RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 MAP2K7O14733 419 aa25.42■■□□□ 1.66
HOXD1-201ENST00000331462 CYP2D6P10635 497 aa25.42■■□□□ 1.66
HOXD1-201ENST00000331462 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
HOXD1-201ENST00000331462 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
HOXD1-201ENST00000331462 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa25.42■■□□□ 1.66
HOXD1-201ENST00000331462 LONRF2Q1L5Z9 754 aa25.42■■□□□ 1.66
HOXD1-201ENST00000331462 WWC2Q6AWC2 1192 aa25.42■■□□□ 1.66
HOXD1-201ENST00000331462 ACRBPQ8NEB7 543 aa25.42■■□□□ 1.66
HOXD1-201ENST00000331462 VPS16Q9H269 839 aa25.42■■□□□ 1.66
HOXD1-201ENST00000331462 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa25.42■■□□□ 1.66
HOXD1-201ENST00000331462 A0A1W2PQC6 194 aa25.42■■□□□ 1.66
HOXD1-201ENST00000331462 STAT6P42226 847 aa25.42■■□□□ 1.66
HOXD1-201ENST00000331462 GALNT17Q6IS24 598 aa25.42■■□□□ 1.66
HOXD1-201ENST00000331462 SLC35F6Q8N357 371 aa25.42■■□□□ 1.66
HOXD1-201ENST00000331462 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
HOXD1-201ENST00000331462 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
HOXD1-201ENST00000331462 PRCPP42785 496 aa25.41■■□□□ 1.66
HOXD1-201ENST00000331462 GRM4Q14833 912 aa25.41■■□□□ 1.66
HOXD1-201ENST00000331462 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa25.41■■□□□ 1.66
HOXD1-201ENST00000331462 NAALADL2Q58DX5 795 aa25.41■■□□□ 1.66
HOXD1-201ENST00000331462 IRF2BP1Q8IU81 584 aa25.41■■□□□ 1.66
HOXD1-201ENST00000331462 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
HOXD1-201ENST00000331462 KAT14Q9H8E8 782 aa25.41■■□□□ 1.66
HOXD1-201ENST00000331462 A0A0G2JS52 829 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD1-201ENST00000331462 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
HOXD1-201ENST00000331462 OAS2P29728 719 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
HOXD1-201ENST00000331462 PRDX5P30044 214 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD1-201ENST00000331462 GNAQP50148 359 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD1-201ENST00000331462 RPS8P62241 208 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
HOXD1-201ENST00000331462 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
HOXD1-201ENST00000331462 GDAQ9Y2T3 454 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD1-201ENST00000331462 MYH8P13535 1937 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD1-201ENST00000331462 LGALS16A8MUM7 142 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC178Q5BJE1 867 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD1-201ENST00000331462 CCSER1Q9C0I3 900 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD1-201ENST00000331462 LAD1O00515 517 aa25.39■■□□□ 1.66
HOXD1-201ENST00000331462 KRT9P35527 623 aa25.39■■□□□ 1.66
HOXD1-201ENST00000331462 CERKQ8TCT0 537 aa25.39■■□□□ 1.66
HOXD1-201ENST00000331462 THAP9Q9H5L6 903 aa25.39■■□□□ 1.66
HOXD1-201ENST00000331462 IRS2Q9Y4H2 1338 aa25.39■■□□□ 1.65
HOXD1-201ENST00000331462 COBLO75128 1261 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXD1-201ENST00000331462 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
HOXD1-201ENST00000331462 CDC25AP30304 524 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXD1-201ENST00000331462 C12orf60Q5U649 245 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXD1-201ENST00000331462 LINC00116Q8NCU8 138 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXD1-201ENST00000331462 DNAJC7Q99615 494 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXD1-201ENST00000331462 IL17RBQ9NRM6 502 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXD1-201ENST00000331462 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXD1-201ENST00000331462 TUBBP07437 444 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXD1-201ENST00000331462 PRPHP41219 470 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXD1-201ENST00000331462 PIP4K2BP78356 416 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXD1-201ENST00000331462 AMPD2Q01433 879 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXD1-201ENST00000331462 DTHD1Q6ZMT9 781 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXD1-201ENST00000331462 PNMA1Q8ND90 353 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC148Q8NFR7 591 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXD1-201ENST00000331462 NYXQ9GZU5 481 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXD1-201ENST00000331462 KBTBD4Q9NVX7 518 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXD1-201ENST00000331462 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
HOXD1-201ENST00000331462 KLRC4O43908 158 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXD1-201ENST00000331462 RHOBTB3O94955 611 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXD1-201ENST00000331462 UBXN1Q04323 297 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXD1-201ENST00000331462 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
HOXD1-201ENST00000331462 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
HOXD1-201ENST00000331462 BARGINQ6ZT62 677 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXD1-201ENST00000331462 MB21D1Q8N884 522 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF507Q8TCN5 953 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXD1-201ENST00000331462 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
HOXD1-201ENST00000331462 MAGEF1Q9HAY2 307 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXD1-201ENST00000331462 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXD1-201ENST00000331462 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXD1-201ENST00000331462 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXD1-201ENST00000331462 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa25.36■■□□□ 1.65
HOXD1-201ENST00000331462 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
HOXD1-201ENST00000331462 TYW1BQ6NUM6 668 aa25.36■■□□□ 1.65
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF662Q6ZS27 426 aa25.36■■□□□ 1.65
HOXD1-201ENST00000331462 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP25.36■■□□□ 1.65
HOXD1-201ENST00000331462 CUEDC2Q9H467 287 aa25.36■■□□□ 1.65
HOXD1-201ENST00000331462 MCM9Q9NXL9 1143 aa25.36■■□□□ 1.65
HOXD1-201ENST00000331462 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
HOXD1-201ENST00000331462 UBAP1LF5GYI3 381 aa25.36■■□□□ 1.65
HOXD1-201ENST00000331462 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
HOXD1-201ENST00000331462 NDUFA10O95299 355 aa25.36■■□□□ 1.65
HOXD1-201ENST00000331462 TFAP4Q01664 338 aa25.36■■□□□ 1.65
HOXD1-201ENST00000331462 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
HOXD1-201ENST00000331462 OR8K1Q8NGG5 319 aa25.36■■□□□ 1.65
HOXD1-201ENST00000331462 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa25.36■■□□□ 1.65
HOXD1-201ENST00000331462 MAD2L2Q9UI95 211 aa25.36■■□□□ 1.65
HOXD1-201ENST00000331462 PCDHA6Q9UN73 950 aa25.36■■□□□ 1.65
HOXD1-201ENST00000331462 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
HOXD1-201ENST00000331462 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa25.36■■□□□ 1.65
HOXD1-201ENST00000331462 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
HOXD1-201ENST00000331462 ERLIN1O75477 346 aa25.35■■□□□ 1.65
HOXD1-201ENST00000331462 TBC1D9BQ66K14 1250 aa25.35■■□□□ 1.65
HOXD1-201ENST00000331462 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa25.35■■□□□ 1.65
HOXD1-201ENST00000331462 CTAGE15A4D2H0 777 aa25.35■■□□□ 1.65
HOXD1-201ENST00000331462 ABL1P00519 1130 aa25.35■■□□□ 1.65
HOXD1-201ENST00000331462 USP17L8P0C7I0 530 aa25.35■■□□□ 1.65
HOXD1-201ENST00000331462 CTAGE8P0CG41 777 aa25.35■■□□□ 1.65
HOXD1-201ENST00000331462 STIM1Q13586 685 aa25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms