RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326431.3

TMIE-201, Transcript of transmembrane inner ear, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMIE, Length 1,824 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIE-201ENST00000326431 BMP3P12645 472 aa27.39■■□□□ 1.98
TMIE-201ENST00000326431 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
TMIE-201ENST00000326431 TNFRSF25Q93038 417 aa27.39■■□□□ 1.98
TMIE-201ENST00000326431 USP17L10C9JJH3 530 aa27.39■■□□□ 1.97
TMIE-201ENST00000326431 DLK2Q6UY11 383 aa27.39■■□□□ 1.97
TMIE-201ENST00000326431 CCDC148Q8NFR7 591 aa27.39■■□□□ 1.97
TMIE-201ENST00000326431 MTMR8Q96EF0 704 aa27.39■■□□□ 1.97
TMIE-201ENST00000326431 WRNIP1Q96S55 665 aa27.39■■□□□ 1.97
TMIE-201ENST00000326431 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.97
TMIE-201ENST00000326431 VCPKMTQ9H867 229 aa27.39■■□□□ 1.97
TMIE-201ENST00000326431 ADM5C9JUS6 153 aa27.38■■□□□ 1.97
TMIE-201ENST00000326431 CALML3P27482 149 aa27.38■■□□□ 1.97
TMIE-201ENST00000326431 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
TMIE-201ENST00000326431 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
TMIE-201ENST00000326431 ANO1Q5XXA6 986 aa27.38■■□□□ 1.97
TMIE-201ENST00000326431 SH2D4AQ9H788 454 aa27.38■■□□□ 1.97
TMIE-201ENST00000326431 FAM205CA6NFA0 338 aa27.37■■□□□ 1.97
TMIE-201ENST00000326431 NASPP49321 788 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
TMIE-201ENST00000326431 NAPAP54920 295 aa27.37■■□□□ 1.97
TMIE-201ENST00000326431 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa27.37■■□□□ 1.97
TMIE-201ENST00000326431 SULF1Q8IWU6 871 aa27.37■■□□□ 1.97
TMIE-201ENST00000326431 PGBD1Q96JS3 809 aa27.37■■□□□ 1.97
TMIE-201ENST00000326431 PCDHA4Q9UN74 947 aa27.37■■□□□ 1.97
TMIE-201ENST00000326431 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa27.37■■□□□ 1.97
TMIE-201ENST00000326431 TMEM232C9JQI7 657 aa27.37■■□□□ 1.97
TMIE-201ENST00000326431 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
TMIE-201ENST00000326431 BLIDQ8IZY5 108 aa27.37■■□□□ 1.97
TMIE-201ENST00000326431 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
TMIE-201ENST00000326431 LINC00301Q8NCQ3 95 aa27.37■■□□□ 1.97
TMIE-201ENST00000326431 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa27.36■■□□□ 1.97
TMIE-201ENST00000326431 OTOFQ9HC10 1997 aa27.36■■□□□ 1.97
TMIE-201ENST00000326431 YEATS4O95619 227 aa27.36■■□□□ 1.97
TMIE-201ENST00000326431 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
TMIE-201ENST00000326431 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
TMIE-201ENST00000326431 SCYL3Q8IZE3 742 aa27.36■■□□□ 1.97
TMIE-201ENST00000326431 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
TMIE-201ENST00000326431 POTECB2RU33 542 aa27.35■■□□□ 1.97
TMIE-201ENST00000326431 hCG_1984214I3L0E3 225 aa27.35■■□□□ 1.97
TMIE-201ENST00000326431 ZBTB5O15062 677 aa27.35■■□□□ 1.97
TMIE-201ENST00000326431 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
TMIE-201ENST00000326431 STK38Q15208 465 aa27.35■■□□□ 1.97
TMIE-201ENST00000326431 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
TMIE-201ENST00000326431 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
TMIE-201ENST00000326431 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
TMIE-201ENST00000326431 COA7Q96BR5 231 aa27.35■■□□□ 1.97
TMIE-201ENST00000326431 KLRG1Q96E93 195 aa27.35■■□□□ 1.97
TMIE-201ENST00000326431 ZMYND12Q9H0C1 365 aa27.35■■□□□ 1.97
TMIE-201ENST00000326431 RILPL1Q5EBL4 403 aa27.34■■□□□ 1.97
TMIE-201ENST00000326431 FAM83BQ5T0W9 1011 aa27.34■■□□□ 1.97
TMIE-201ENST00000326431 BTNL9Q6UXG8 535 aa27.34■■□□□ 1.97
TMIE-201ENST00000326431 DAGLBQ8NCG7 672 aa27.34■■□□□ 1.97
TMIE-201ENST00000326431 FEZ1Q99689 392 aa27.34■■□□□ 1.97
TMIE-201ENST00000326431 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
TMIE-201ENST00000326431 M0R2N6 131 aa27.34■■□□□ 1.97
TMIE-201ENST00000326431 IKQ13123 557 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
TMIE-201ENST00000326431 SYDE2Q5VT97 1194 aa27.34■■□□□ 1.97
TMIE-201ENST00000326431 GALNT17Q6IS24 598 aa27.34■■□□□ 1.97
TMIE-201ENST00000326431 KRT26Q7Z3Y9 468 aa27.34■■□□□ 1.97
TMIE-201ENST00000326431 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
TMIE-201ENST00000326431 IQCA1LA6NCM1 817 aa27.32■■□□□ 1.96
TMIE-201ENST00000326431 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa27.32■■□□□ 1.96
TMIE-201ENST00000326431 SMCO2A6NFE2 343 aa27.32■■□□□ 1.96
TMIE-201ENST00000326431 PRKG1Q13976 671 aa27.32■■□□□ 1.96
TMIE-201ENST00000326431 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
TMIE-201ENST00000326431 QRICH1Q2TAL8 776 aa27.32■■□□□ 1.96
TMIE-201ENST00000326431 RASGRP4Q8TDF6 673 aa27.32■■□□□ 1.96
TMIE-201ENST00000326431 SPTLC2O15270 562 aa27.32■■□□□ 1.96
TMIE-201ENST00000326431 PTPAQ15257 358 aa27.32■■□□□ 1.96
TMIE-201ENST00000326431 KCNG4Q8TDN1 519 aa27.32■■□□□ 1.96
TMIE-201ENST00000326431 TMEM63CQ9P1W3 806 aa27.32■■□□□ 1.96
TMIE-201ENST00000326431 SMCHD1A6NHR9 2005 aa27.31■■□□□ 1.96
TMIE-201ENST00000326431 ESYT2A0FGR8 921 aa27.31■■□□□ 1.96
TMIE-201ENST00000326431 USP2O75604 605 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
TMIE-201ENST00000326431 STAT2P52630 851 aa27.31■■□□□ 1.96
TMIE-201ENST00000326431 SLC39A14Q15043 492 aa27.31■■□□□ 1.96
TMIE-201ENST00000326431 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
TMIE-201ENST00000326431 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa27.31■■□□□ 1.96
TMIE-201ENST00000326431 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa27.31■■□□□ 1.96
TMIE-201ENST00000326431 C6orf50Q9HD87 102 aa27.31■■□□□ 1.96
TMIE-201ENST00000326431 PCDHA6Q9UN73 950 aa27.31■■□□□ 1.96
TMIE-201ENST00000326431 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa27.31■■□□□ 1.96
TMIE-201ENST00000326431 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa27.31■■□□□ 1.96
TMIE-201ENST00000326431 PTPRAP18433 802 aa27.3■■□□□ 1.96
TMIE-201ENST00000326431 ME1P48163 572 aa27.3■■□□□ 1.96
TMIE-201ENST00000326431 SNAP25P60880 206 aa27.3■■□□□ 1.96
TMIE-201ENST00000326431 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP27.3■■□□□ 1.96
TMIE-201ENST00000326431 PICK1Q9NRD5 415 aa27.3■■□□□ 1.96
TMIE-201ENST00000326431 PCDHA7Q9UN72 937 aa27.3■■□□□ 1.96
TMIE-201ENST00000326431 ATP2B1P20020 1258 aa27.3■■□□□ 1.96
TMIE-201ENST00000326431 GNA11P29992 359 aa27.3■■□□□ 1.96
TMIE-201ENST00000326431 PRR12Q9ULL5 1215 aa27.3■■□□□ 1.96
TMIE-201ENST00000326431 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
TMIE-201ENST00000326431 PPP1R18Q6NYC8 613 aa27.29■■□□□ 1.96
TMIE-201ENST00000326431 PARP14Q460N5 1801 aa27.28■■□□□ 1.96
TMIE-201ENST00000326431 WNT7AO00755 349 aa27.28■■□□□ 1.96
TMIE-201ENST00000326431 DGKZQ13574 1117 aa27.28■■□□□ 1.96
TMIE-201ENST00000326431 BICD2Q8TD16 824 aa27.28■■□□□ 1.96
TMIE-201ENST00000326431 WDR18Q9BV38 432 aa27.28■■□□□ 1.96
TMIE-201ENST00000326431 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
TMIE-201ENST00000326431 LIG1P18858 919 aa27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms