RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326277.5

SNX18-201, Transcript of sorting nexin 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNX18, Length 2,063 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18-201ENST00000326277 UBA5Q9GZZ9 404 aa25.99■■□□□ 1.75
SNX18-201ENST00000326277 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
SNX18-201ENST00000326277 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
SNX18-201ENST00000326277 UQCRHLA0A096LP55 91 aa25.99■■□□□ 1.75
SNX18-201ENST00000326277 UQCRHP07919 91 aa25.99■■□□□ 1.75
SNX18-201ENST00000326277 NFIAQ12857 509 aa25.99■■□□□ 1.75
SNX18-201ENST00000326277 IQUBQ8NA54 791 aa25.99■■□□□ 1.75
SNX18-201ENST00000326277 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
SNX18-201ENST00000326277 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
SNX18-201ENST00000326277 MYH8P13535 1937 aa25.98■■□□□ 1.75
SNX18-201ENST00000326277 SHMT1P34896 483 aa25.98■■□□□ 1.75
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SNX18-201ENST00000326277 TMEM60Q9H2L4 133 aa25.97■■□□□ 1.75
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SNX18-201ENST00000326277 GNA11P29992 359 aa25.95■■□□□ 1.74
SNX18-201ENST00000326277 DACT2Q5SW24 774 aa25.95■■□□□ 1.74
SNX18-201ENST00000326277 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
SNX18-201ENST00000326277 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa25.94■■□□□ 1.74
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SNX18-201ENST00000326277 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP25.92■■□□□ 1.74
SNX18-201ENST00000326277 EHD4Q9H223 541 aa25.92■■□□□ 1.74
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SNX18-201ENST00000326277 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP25.92■■□□□ 1.74
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SNX18-201ENST00000326277 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
SNX18-201ENST00000326277 CNKSR1Q969H4 720 aa25.92■■□□□ 1.74
SNX18-201ENST00000326277 INTS13Q9NVM9 706 aa25.92■■□□□ 1.74
SNX18-201ENST00000326277 C10orf71Q711Q0 1435 aa25.92■■□□□ 1.74
SNX18-201ENST00000326277 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP25.91■■□□□ 1.74
SNX18-201ENST00000326277 TCP10Q12799 353 aa25.91■■□□□ 1.74
SNX18-201ENST00000326277 CUL4BQ13620 913 aa25.91■■□□□ 1.74
SNX18-201ENST00000326277 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
SNX18-201ENST00000326277 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
SNX18-201ENST00000326277 VSTM4Q8IW00 320 aa25.91■■□□□ 1.74
SNX18-201ENST00000326277 MYRIPQ8NFW9 859 aa25.91■■□□□ 1.74
SNX18-201ENST00000326277 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
SNX18-201ENST00000326277 ESYT2A0FGR8 921 aa25.91■■□□□ 1.74
SNX18-201ENST00000326277 USP27XA6NNY8 438 aa25.91■■□□□ 1.74
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SNX18-201ENST00000326277 ZNF543Q08ER8 600 aa25.91■■□□□ 1.74
SNX18-201ENST00000326277 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
SNX18-201ENST00000326277 C7orf43Q8WVR3 580 aa25.91■■□□□ 1.74
SNX18-201ENST00000326277 DNAJC18Q9H819 358 aa25.91■■□□□ 1.74
SNX18-201ENST00000326277 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
SNX18-201ENST00000326277 hCG_1984214I3L0E3 225 aa25.9■■□□□ 1.74
SNX18-201ENST00000326277 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
SNX18-201ENST00000326277 PRPHP41219 470 aa25.9■■□□□ 1.74
SNX18-201ENST00000326277 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
SNX18-201ENST00000326277 AOC3Q16853 763 aa25.9■■□□□ 1.74
SNX18-201ENST00000326277 LETM2Q2VYF4 491 aa25.9■■□□□ 1.74
SNX18-201ENST00000326277 KLHL10Q6JEL2 608 aa25.9■■□□□ 1.74
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