RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325558.10

PGA3-201, Transcript of pepsinogen 3, group I (pepsinogen A), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGA3, Length 1,748 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3-201ENST00000325558 SIAH1Q8IUQ4 282 aa12.9□□□□□ -0.34
PGA3-201ENST00000325558 PAGE5Q96GU1 130 aa12.9□□□□□ -0.34
PGA3-201ENST00000325558 GMLQ99445 158 aa12.9□□□□□ -0.34
PGA3-201ENST00000325558 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 ZNF543Q08ER8 600 aa12.89□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP12.89□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 PDXDC2PQ6P474 469 aa12.89□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 KIAA0825Q8IV33 1275 aa12.89□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 MLKLQ8NB16 471 aa12.89□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 SUPT20HQ8NEM7 779 aa12.89□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 RASGRP4Q8TDF6 673 aa12.89□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 FBXW7Q969H0 707 aa12.89□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 PIGSQ96S52 555 aa12.89□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 MTRQ99707 1265 aa12.89□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 G3V3G9 751 aa12.88□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 ZNF18P17022 549 aa12.88□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 LONP1P36776 959 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 PRPHP41219 470 aa12.88□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 AOC3Q16853 763 aa12.88□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 DCAF8Q5TAQ9 597 aa12.88□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 ISM2Q6H9L7 571 aa12.88□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa12.88□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 PSMD1Q99460 953 aa12.88□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 UBA5Q9GZZ9 404 aa12.88□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 TMEM60Q9H2L4 133 aa12.88□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 PI4KBQ9UBF8 816 aa12.88□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 CLIP2Q9UDT6 1046 aa12.88□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 COL4A5P29400 1685 aa12.88□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 VWA3AA6NCI4 1184 aa12.88□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 LAD1O00515 517 aa12.88□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 ENTPD3O75355 529 aa12.88□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 HLA-DOAP06340 250 aa12.88□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 SLURP2P0DP57 97 aa12.88□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 MCM7P33993 719 aa12.88□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 MYL5Q02045 173 aa12.88□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa12.88□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 PDILTQ8N807 584 aa12.88□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 CCSER1Q9C0I3 900 aa12.88□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 JMJD4Q9H9V9 463 aa12.88□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 NYAP2Q9P242 653 aa12.88□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 IMPACTQ9P2X3 320 aa12.88□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 SMCO2A6NFE2 343 aa12.87□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 GNA11P29992 359 aa12.87□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP12.87□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa12.87□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 KRT25Q7Z3Z0 450 aa12.87□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 LRRC8AQ8IWT6 810 aa12.87□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 SLC16A10Q8TF71 515 aa12.87□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 SMARCE1Q969G3 411 aa12.87□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 DHX58Q96C10 678 aa12.87□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 GSDMAQ96QA5 445 aa12.87□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 VPS33BQ9H267 617 aa12.87□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa12.86□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 VIL1P09327 827 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 ATP1A3P13637 1013 aa12.86□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 CLK2P49760 499 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 FANCCQ00597 558 aa12.86□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 LRMPQ12912 555 aa12.86□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 CUL4BQ13620 913 aa12.86□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 INF2Q27J81 1249 aa12.86□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 NAALADL2Q58DX5 795 aa12.86□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 CLEC10AQ8IUN9 316 aa12.86□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 C6orf50Q9HD87 102 aa12.86□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 KCND1Q9NSA2 647 aa12.86□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa12.86□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa12.85□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 NEMFO60524 1076 aa12.85□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 CACNB3P54284 484 aa12.85□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 NAPAP54920 295 aa12.85□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 PPP1R18Q6NYC8 613 aa12.85□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 TTLL6Q8N841 843 aa12.85□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 IQUBQ8NA54 791 aa12.85□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 FANCLQ9NW38 375 aa12.85□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 IFNKQ9P0W0 207 aa12.85□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa12.85□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 C21orf2O43822 256 aa12.85□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 JAG1P78504 1218 aa12.85□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 CCZ1BP86790 482 aa12.85□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 ARID5BQ14865 1188 aa12.85□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP12.85□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 CFAP100Q494V2 611 aa12.85□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 TTBK2Q6IQ55 1244 aa12.85□□□□□ -0.35
PGA3-201ENST00000325558 RTKN2Q8IZC4 609 aa12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms