RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324444.7

SYNE4-201, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SYNE4, Length 1,354 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-201ENST00000324444 PDHBP11177 359 aa20.85■□□□□ 0.93
SYNE4-201ENST00000324444 FDPSP14324 419 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
SYNE4-201ENST00000324444 GTF2A2P52657 109 aa20.85■□□□□ 0.93
SYNE4-201ENST00000324444 NBPF11Q86T75 865 aa20.85■□□□□ 0.93
SYNE4-201ENST00000324444 ERO1BQ86YB8 467 aa20.85■□□□□ 0.93
SYNE4-201ENST00000324444 SPZ1Q9BXG8 430 aa20.85■□□□□ 0.93
SYNE4-201ENST00000324444 GOPCQ9HD26 462 aa20.85■□□□□ 0.93
SYNE4-201ENST00000324444 MAD2L2Q9UI95 211 aa20.85■□□□□ 0.93
SYNE4-201ENST00000324444 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa20.84■□□□□ 0.93
SYNE4-201ENST00000324444 KLRF2D3W0D1 207 aa20.84■□□□□ 0.93
SYNE4-201ENST00000324444 F13A1P00488 732 aa20.84■□□□□ 0.93
SYNE4-201ENST00000324444 CRHR2Q13324 411 aa20.84■□□□□ 0.93
SYNE4-201ENST00000324444 CCL15Q16663 113 aa20.84■□□□□ 0.93
SYNE4-201ENST00000324444 SIAH1Q8IUQ4 282 aa20.84■□□□□ 0.93
SYNE4-201ENST00000324444 SCYL3Q8IZE3 742 aa20.84■□□□□ 0.93
SYNE4-201ENST00000324444 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa20.84■□□□□ 0.93
SYNE4-201ENST00000324444 BRI3BPQ8WY22 251 aa20.84■□□□□ 0.93
SYNE4-201ENST00000324444 PHKBQ93100 1093 aa20.84■□□□□ 0.93
SYNE4-201ENST00000324444 GMCL1Q96IK5 515 aa20.84■□□□□ 0.93
SYNE4-201ENST00000324444 AS3MTQ9HBK9 375 aa20.84■□□□□ 0.93
SYNE4-201ENST00000324444 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP20.83■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 PICK1Q9NRD5 415 aa20.83■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 TMX2Q9Y320 296 aa20.83■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 ZDHHC9Q9Y397 364 aa20.83■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF543Q08ER8 600 aa20.82■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 FUT2Q10981 343 aa20.82■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 SLFN13Q68D06 897 aa20.82■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 V9GY48 417 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 USP17L5A8MUK1 530 aa20.81■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 F5H6K3 240 aa20.81■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 hCG_1984214I3L0E3 225 aa20.81■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 IRF6O14896 467 aa20.81■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 PLEKHA8P1O95397 391 aa20.81■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 SLC1A4P43007 532 aa20.81■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 KLRC3Q07444 240 aa20.81■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 PPIL2Q13356 520 aa20.81■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 PKP1Q13835 747 aa20.81■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa20.81■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 ATL3Q6DD88 541 aa20.81■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 CCDC82Q8N4S0 544 aa20.81■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa20.81■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 PTPRFP10586 1907 aa20.8■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 DDX11L8A8MPP1 907 aa20.8■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 CETPP11597 493 aa20.8■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 PPATQ06203 517 aa20.8■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 SNAPC2Q13487 334 aa20.8■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 CCDC96Q2M329 555 aa20.8■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 USP17L2Q6R6M4 530 aa20.8■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 FAM43AQ8N2R8 423 aa20.8■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 BRMS1Q9HCU9 246 aa20.8■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 SH3GLB2Q9NR46 395 aa20.8■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 MTMR7Q9Y216 660 aa20.8■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 SCG2P13521 617 aa20.79■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 PTPRAP18433 802 aa20.79■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 USP14P54578 494 aa20.79■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 TRAF1Q13077 416 aa20.79■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 BRAPQ7Z569 592 aa20.79■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 RIOX1Q9H6W3 641 aa20.79■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 A0A1W2PRG0 241 aa20.78■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 STAG2Q8N3U4 1231 aa20.78■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 CCDC148Q8NFR7 591 aa20.78■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 LPAR1Q92633 364 aa20.78■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 WDR18Q9BV38 432 aa20.78■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 VCPKMTQ9H867 229 aa20.78■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 RAD21O60216 631 aa20.77■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 BAG4O95429 457 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 BMP3P12645 472 aa20.77■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 CALML3P27482 149 aa20.77■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 KRT40Q6A162 431 aa20.77■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 MCTP1Q6DN14 999 aa20.77■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 GALNT17Q6IS24 598 aa20.77■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 ACER1Q8TDN7 264 aa20.77■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 FEZ1Q99689 392 aa20.77■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa20.77■□□□□ 0.92
SYNE4-201ENST00000324444 NDUFB10O96000 172 aa20.76■□□□□ 0.91
SYNE4-201ENST00000324444 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
SYNE4-201ENST00000324444 CHURC1Q8WUH1 139 aa20.76■□□□□ 0.91
SYNE4-201ENST00000324444 ERO1AQ96HE7 468 aa20.76■□□□□ 0.91
SYNE4-201ENST00000324444 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa20.76■□□□□ 0.91
SYNE4-201ENST00000324444 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
SYNE4-201ENST00000324444 TRIM17Q9Y577 477 aa20.76■□□□□ 0.91
SYNE4-201ENST00000324444 BTBD19C9JJ37 291 aa20.75■□□□□ 0.91
SYNE4-201ENST00000324444 PLA2G6O60733 806 aa20.75■□□□□ 0.91
SYNE4-201ENST00000324444 MMP1P03956 469 aa20.75■□□□□ 0.91
SYNE4-201ENST00000324444 GOLGA8HP0CJ92 632 aa20.75■□□□□ 0.91
SYNE4-201ENST00000324444 MCM4P33991 863 aa20.75■□□□□ 0.91
SYNE4-201ENST00000324444 RGS19P49795 217 aa20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms