RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000303903.10

SYCE1-201, Transcript of synaptonemal complex central element protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYCE1, Length 1,011 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1-201ENST00000303903 CHMP4CQ96CF2 233 aa14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 ATP2A1O14983 1001 aa14.68□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 PLA2G6O60733 806 aa14.68□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 ZBED4O75132 1171 aa14.68□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 CYP21A2P08686 494 aa14.68□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 ADORA2AP29274 412 aa14.68□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 GJA8P48165 433 aa14.68□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 STAT2P52630 851 aa14.68□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 FAM160B2Q86V87 743 aa14.68□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 DGKHQ86XP1 1220 aa14.68□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 ABRAQ8N0Z2 381 aa14.68□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 CHURC1Q8WUH1 139 aa14.68□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 DCAF4Q8WV16 495 aa14.68□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 MAP4K1Q92918 833 aa14.68□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 SHISA4Q96DD7 197 aa14.68□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 TEX13BQ9BXU2 312 aa14.68□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 KRT23Q9C075 422 aa14.68□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 FLRT1Q9NZU1 646 aa14.68□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 ZSWIM5Q9P217 1185 aa14.68□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 MTMR7Q9Y216 660 aa14.68□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 RIPK3Q9Y572 518 aa14.68□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 RPTORQ8N122 1335 aa14.67□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 COBLO75128 1261 aa14.67□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 SGPL1O95470 568 aa14.67□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 IGHA2P01877 340 aa14.67□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 FDX1P10109 184 aa14.67□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 COPB2P35606 906 aa14.67□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 CCDC178Q5BJE1 867 aa14.67□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 IQCA1Q86XH1 822 aa14.67□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 CPXCR1Q8N123 301 aa14.67□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 ANKS1AQ92625 1134 aa14.67□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa14.67□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 CNNM2Q9H8M5 875 aa14.67□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 SNHG28P0DPA3 235 aa14.66□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 PDHBP11177 359 aa14.66□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 FCER1AP12319 257 aa14.66□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 OAZ1P54368 228 aa14.66□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 DPP9Q86TI2 863 aa14.66□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 DEFB118Q96PH6 123 aa14.66□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 PRR12Q9ULL5 1215 aa14.66□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 TAF6LQ9Y6J9 622 aa14.66□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 ZNF536O15090 1300 aa14.66□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 IKQ13123 557 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 CCDC96Q2M329 555 aa14.65□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 TTBK2Q6IQ55 1244 aa14.65□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 BTNL9Q6UXG8 535 aa14.65□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa14.65□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 MMP19Q99542 508 aa14.65□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 TNKSO95271 1327 aa14.65□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SYCE1-201ENST00000303903 E7EWF7 191 aa14.64□□□□□ -0.07
SYCE1-201ENST00000303903 ZNF543Q08ER8 600 aa14.64□□□□□ -0.07
SYCE1-201ENST00000303903 KCTD2Q14681 263 aa14.64□□□□□ -0.07
SYCE1-201ENST00000303903 MFSD14CQ5VZR4 134 aa14.64□□□□□ -0.07
SYCE1-201ENST00000303903 OLFML2BQ68BL8 750 aa14.64□□□□□ -0.07
SYCE1-201ENST00000303903 STOX1Q6ZVD7 989 aa14.64□□□□□ -0.07
SYCE1-201ENST00000303903 CYB5R4Q7L1T6 521 aa14.64□□□□□ -0.07
SYCE1-201ENST00000303903 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
SYCE1-201ENST00000303903 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa14.64□□□□□ -0.07
SYCE1-201ENST00000303903 SLC5A4Q9NY91 659 aa14.64□□□□□ -0.07
SYCE1-201ENST00000303903 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa14.63□□□□□ -0.07
SYCE1-201ENST00000303903 PGK2P07205 417 aa14.63□□□□□ -0.07
SYCE1-201ENST00000303903 CAPN2P17655 700 aa14.63□□□□□ -0.07
SYCE1-201ENST00000303903 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SYCE1-201ENST00000303903 CYP2C19P33261 490 aa14.63□□□□□ -0.07
SYCE1-201ENST00000303903 SLC16A2P36021 539 aa14.63□□□□□ -0.07
SYCE1-201ENST00000303903 SLC4A3P48751 1232 aa14.63□□□□□ -0.07
SYCE1-201ENST00000303903 SNAP25P60880 206 aa14.63□□□□□ -0.07
SYCE1-201ENST00000303903 TRDNQ13061 729 aa14.63□□□□□ -0.07
SYCE1-201ENST00000303903 SEC23AQ15436 765 aa14.63□□□□□ -0.07
SYCE1-201ENST00000303903 ZNF792Q3KQV3 632 aa14.63□□□□□ -0.07
SYCE1-201ENST00000303903 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa14.63□□□□□ -0.07
SYCE1-201ENST00000303903 PNMA1Q8ND90 353 aa14.63□□□□□ -0.07
SYCE1-201ENST00000303903 CHST13Q8NET6 341 aa14.63□□□□□ -0.07
SYCE1-201ENST00000303903 MAML3Q96JK9 1138 aa14.63□□□□□ -0.07
SYCE1-201ENST00000303903 AGBL1Q96MI9 1066 aa14.63□□□□□ -0.07
SYCE1-201ENST00000303903 UBAC1Q9BSL1 405 aa14.63□□□□□ -0.07
SYCE1-201ENST00000303903 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SYCE1-201ENST00000303903 KAT14Q9H8E8 782 aa14.63□□□□□ -0.07
SYCE1-201ENST00000303903 GPCPD1Q9NPB8 672 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms