RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296031.4

CXCL2-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CXCL2, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2-201ENST00000296031 UBXN2AP68543 259 aa29.35■■■□□ 2.29
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CXCL2-201ENST00000296031 UBAC1Q9BSL1 405 aa29.35■■■□□ 2.29
CXCL2-201ENST00000296031 TMEM106CQ9BVX2 250 aa29.35■■■□□ 2.29
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CXCL2-201ENST00000296031 STRNO43815 780 aa29.34■■■□□ 2.29
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CXCL2-201ENST00000296031 FDX1P10109 184 aa29.32■■■□□ 2.28
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CXCL2-201ENST00000296031 KAT14Q9H8E8 782 aa29.32■■■□□ 2.28
CXCL2-201ENST00000296031 ATP2A1O14983 1001 aa29.31■■■□□ 2.28
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CXCL2-201ENST00000296031 SLC4A3P48751 1232 aa29.31■■■□□ 2.28
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CXCL2-201ENST00000296031 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
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CXCL2-201ENST00000296031 SNHG28P0DPA3 235 aa29.29■■■□□ 2.28
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CXCL2-201ENST00000296031 OAZ1P54368 228 aa29.29■■■□□ 2.28
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CXCL2-201ENST00000296031 CREB3L3Q68CJ9 461 aa29.29■■■□□ 2.28
CXCL2-201ENST00000296031 TTBK2Q6IQ55 1244 aa29.29■■■□□ 2.28
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CXCL2-201ENST00000296031 PRR12Q9ULL5 1215 aa29.29■■■□□ 2.28
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CXCL2-201ENST00000296031 SEC23AQ15436 765 aa29.28■■■□□ 2.28
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CXCL2-201ENST00000296031 DPP9Q86TI2 863 aa29.28■■■□□ 2.28
CXCL2-201ENST00000296031 RNF208Q9H0X6 261 aa29.28■■■□□ 2.28
CXCL2-201ENST00000296031 UNC93B1Q9H1C4 597 aa29.28■■■□□ 2.28
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CXCL2-201ENST00000296031 SNAP25P60880 206 aa29.27■■■□□ 2.28
CXCL2-201ENST00000296031 MMP19Q99542 508 aa29.27■■■□□ 2.28
CXCL2-201ENST00000296031 SYDE2Q5VT97 1194 aa29.26■■■□□ 2.27
CXCL2-201ENST00000296031 CHST3Q7LGC8 479 aa29.26■■■□□ 2.27
CXCL2-201ENST00000296031 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.27
CXCL2-201ENST00000296031 NPLOC4Q8TAT6 608 aa29.26■■■□□ 2.27
CXCL2-201ENST00000296031 BRCA2P51587 3418 aa29.26■■■□□ 2.27
CXCL2-201ENST00000296031 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
CXCL2-201ENST00000296031 EN2P19622 333 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
CXCL2-201ENST00000296031 KCTD2Q14681 263 aa29.25■■■□□ 2.27
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CXCL2-201ENST00000296031 RNF20Q5VTR2 975 aa29.25■■■□□ 2.27
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CXCL2-201ENST00000296031 ERICH2A1L162 156 aa29.24■■■□□ 2.27
CXCL2-201ENST00000296031 GOLGA8HP0CJ92 632 aa29.24■■■□□ 2.27
CXCL2-201ENST00000296031 SART3Q15020 963 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
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CXCL2-201ENST00000296031 FLRT1Q9NZU1 646 aa29.24■■■□□ 2.27
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF536O15090 1300 aa29.23■■■□□ 2.27
CXCL2-201ENST00000296031 COBLO75128 1261 aa29.23■■■□□ 2.27
CXCL2-201ENST00000296031 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
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CXCL2-201ENST00000296031 GJB1P08034 283 aa29.22■■■□□ 2.27
CXCL2-201ENST00000296031 ANTXR2P58335 489 aa29.22■■■□□ 2.27
CXCL2-201ENST00000296031 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
CXCL2-201ENST00000296031 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa29.22■■■□□ 2.27
CXCL2-201ENST00000296031 PGK2P07205 417 aa29.21■■■□□ 2.27
CXCL2-201ENST00000296031 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
CXCL2-201ENST00000296031 WTAPQ15007 396 aa29.21■■■□□ 2.27
CXCL2-201ENST00000296031 TMEM67Q5HYA8 995 aa29.21■■■□□ 2.27
CXCL2-201ENST00000296031 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa29.21■■■□□ 2.27
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