RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294702.5

GFI1-201, Transcript of growth factor independent 1 transcriptional repressor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene GFI1, Length 2,784 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1-201ENST00000294702 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
GFI1-201ENST00000294702 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
GFI1-201ENST00000294702 RASSF8Q8NHQ8 419 aa21.83■■□□□ 1.09
GFI1-201ENST00000294702 ANKRD33BA6NCL7 494 aa21.83■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 GCKP35557 465 aa21.83■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 SLC8A3P57103 927 aa21.83■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 ITIH3Q06033 890 aa21.83■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 QPCTQ16769 361 aa21.83■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 ATG9AQ7Z3C6 839 aa21.83■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 MMP1P03956 469 aa21.82■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 PSMB7Q99436 277 aa21.82■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 WDR19Q8NEZ3 1342 aa21.82■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 MGRN1O60291 552 aa21.82■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 CXCR5P32302 372 aa21.82■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 SLC8A1P32418 973 aa21.82■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 SCTRP47872 440 aa21.82■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 CARSP49589 748 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 XAGE3Q8WTP9 111 aa21.82■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 VPS54Q9P1Q0 977 aa21.82■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 RILPL1Q5EBL4 403 aa21.82■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 RRAGBQ5VZM2 374 aa21.82■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa21.82■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 NFU1Q9UMS0 254 aa21.82■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 BCL9LQ86UU0 1499 aa21.81■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 RNMTO43148 476 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 RCSD1Q6JBY9 416 aa21.81■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 TTLL7Q6ZT98 887 aa21.81■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 IRF2BP1Q8IU81 584 aa21.81■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 CAPN11Q9UMQ6 739 aa21.81■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 ATP2C2O75185 946 aa21.81■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 GLI1P08151 1106 aa21.81■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 TNFRSF8P28908 595 aa21.81■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP21.81■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 XRCC4Q13426 336 aa21.81■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 AKAP4Q5JQC9 854 aa21.81■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 NFRKBQ6P4R8 1299 aa21.81■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 COPS6Q7L5N1 327 aa21.81■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 MB21D1Q8N884 522 aa21.81■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 TBC1D31Q96DN5 1066 aa21.81■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 SPDL1Q96EA4 605 aa21.81■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 BLZF1Q9H2G9 400 aa21.81■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 LEMD3Q9Y2U8 911 aa21.81■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa21.81■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 ZBTB43O43298 467 aa21.8■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 MEA1Q16626 185 aa21.8■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 TICAM2Q86XR7 235 aa21.8■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 OXER1Q8TDS5 423 aa21.8■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa21.8■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 ESYT3A0FGR9 886 aa21.8■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa21.8■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 BACH1O14867 736 aa21.8■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 HPDP32754 393 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 SPAG1Q07617 926 aa21.8■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 PPP4R3AQ6IN85 833 aa21.8■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 TBC1D10CQ8IV04 446 aa21.8■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 CD302Q8IX05 232 aa21.8■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 LMBR1Q8WVP7 490 aa21.8■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 RWDD2AQ9UIY3 292 aa21.8■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa21.8■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 GOLGA8AA7E2F4 631 aa21.79■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 LMBR1LQ6UX01 489 aa21.79■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 ZNF263O14978 683 aa21.79■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 VAV2P52735 878 aa21.79■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 ADCY2Q08462 1091 aa21.79■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa21.79■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 OSBPL9Q96SU4 736 aa21.79■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa21.79■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 GMNCA6NCL1 334 aa21.78■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 GUCY2FP51841 1108 aa21.78■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 NSMCE1Q8WV22 266 aa21.78■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 NELFBQ8WX92 580 aa21.78■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP21.78■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 STRCQ7RTU9 1775 aa21.78■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 ATP6V1G2O95670 118 aa21.78■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 PEX19P40855 299 aa21.78■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP21.78■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 ZNF507Q8TCN5 953 aa21.78■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 SEC16BQ96JE7 1060 aa21.78■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 MLXIPQ9HAP2 919 aa21.78■■□□□ 1.08
GFI1-201ENST00000294702 NOD2Q9HC29 1040 aa21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms