RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP23.28■■□□□ 1.321e-13■□□□□ 10.6
CCSAP-201ENST00000284617 CLIC4Q9Y696 253 aa23.28■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM2Q9UHN6 1383 aa23.28■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 KLRF2D3W0D1 207 aa23.28■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 CUL4AQ13619 759 aa23.28■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC89Q8N998 374 aa23.28■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 CLIC6Q96NY7 704 aa23.28■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 MFSD14BQ5SR56 506 aa23.28■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa23.28■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 POLR3EQ9NVU0 708 aa23.27■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 CIAO1O76071 339 aa23.27■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 TNNI1P19237 187 aa23.27■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 TCP10Q12799 353 aa23.27■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 TTLL7Q6ZT98 887 aa23.27■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 NLRX1Q86UT6 975 aa23.27■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 RABGGTAQ92696 567 aa23.27■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa23.27■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 H0YIN7 160 aa23.27■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 STX2P32856 288 aa23.27■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 TRAPPC10P48553 1259 aa23.27■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 APBA1Q02410 837 aa23.27■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC24Q50LG9 513 aa23.27■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 TSC1Q92574 1164 aa23.27■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 VPS37BQ9H9H4 285 aa23.27■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 USP40Q9NVE5 1235 aa23.27■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 IKBKBO14920 756 aa23.27■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 GUCY2FP51841 1108 aa23.27■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 HSPA2P54652 639 aa23.27■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 GNGT1P63211 74 aa23.27■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 PTGDRQ13258 359 aa23.27■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 ADCK5Q3MIX3 580 aa23.27■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 MIER3Q7Z3K6 550 aa23.27■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 GRK7Q8WTQ7 553 aa23.27■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 CUEDC2Q9H467 287 aa23.27■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 SDR42E1Q8WUS8 393 aa23.26■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 TEKT1Q969V4 418 aa23.26■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 TBC1D8O95759 1140 aa23.26■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 H2AFZP0C0S5 128 aa23.26■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 H2AFVQ71UI9 128 aa23.26■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 LARGE2Q8N3Y3 721 aa23.26■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 RDH13Q8NBN7 331 aa23.26■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 PANK4Q9NVE7 773 aa23.26■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 GIPC1O14908 333 aa23.26■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 ABCB4P21439 1286 aa23.25■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 COPB1P53618 953 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 FAM26FQ5R3K3 315 aa23.25■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC125Q86Z20 511 aa23.25■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 UIMC1Q96RL1 719 aa23.25■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa23.25■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 MAGI2Q86UL8 1455 aa23.25■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 P4HA1P13674 534 aa23.25■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 ALDH1B1P30837 517 aa23.25■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 CYP2J2P51589 502 aa23.25■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 FAM71BQ8TC56 605 aa23.25■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 ATP2A3Q93084 1043 aa23.25■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa23.25■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 HGSO14964 777 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM37O94972 964 aa23.25■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 GYG1P46976 350 aa23.25■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 CDC23Q9UJX2 597 aa23.25■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 GJA3Q9Y6H8 435 aa23.25■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 LAD1O00515 517 aa23.24■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 PDE8BO95263 885 aa23.24■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 RIC8AQ9NPQ8 531 aa23.24■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa23.24■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP23.24■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 BCAMP50895 628 aa23.24■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa23.24■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF521Q96K83 1311 aa23.24■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 ATP8B1O43520 1251 aa23.24■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 KRT19P08727 400 aa23.24■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 SEPT6Q14141 434 aa23.24■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa23.24■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 CYP21A2P08686 494 aa23.23■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC38Q502W7 563 aa23.23■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 PRR16Q569H4 304 aa23.23■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 VCXQ9H320 206 aa23.23■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP23.23■■□□□ 1.313e-6■■■□□ 15.8
CCSAP-201ENST00000284617 PYCARDQ9ULZ3 195 aa23.23■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 DLGAP5Q15398 846 aa23.23■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 TRPC6Q9Y210 931 aa23.23■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 GTF2IP78347 998 aa23.23■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 STK32BQ9NY57 414 aa23.23■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 H0YCG3 227 aa23.23■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 DEPTORQ8TB45 409 aa23.23■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 KLHL14Q9P2G3 628 aa23.23■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 ADAM9Q13443 819 aa23.22■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 CASC4Q6P4E1 433 aa23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms