RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284116.8

GDPD1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDPD1, Length 1,821 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD1-201ENST00000284116 VWA3AA6NCI4 1184 aa21.54■■□□□ 1.04
GDPD1-201ENST00000284116 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
GDPD1-201ENST00000284116 SLURP2P0DP57 97 aa21.54■■□□□ 1.04
GDPD1-201ENST00000284116 DPEP1P16444 411 aa21.54■■□□□ 1.04
GDPD1-201ENST00000284116 CFAP100Q494V2 611 aa21.54■■□□□ 1.04
GDPD1-201ENST00000284116 NT5DC1Q5TFE4 455 aa21.54■■□□□ 1.04
GDPD1-201ENST00000284116 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
GDPD1-201ENST00000284116 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa21.54■■□□□ 1.04
GDPD1-201ENST00000284116 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
GDPD1-201ENST00000284116 C6orf50Q9HD87 102 aa21.54■■□□□ 1.04
GDPD1-201ENST00000284116 A0A087X0B3 334 aa21.53■■□□□ 1.04
GDPD1-201ENST00000284116 SMCO2A6NFE2 343 aa21.53■■□□□ 1.04
GDPD1-201ENST00000284116 SARSP49591 514 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
GDPD1-201ENST00000284116 ZNF543Q08ER8 600 aa21.53■■□□□ 1.04
GDPD1-201ENST00000284116 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
GDPD1-201ENST00000284116 hCG_1984214I3L0E3 225 aa21.52■■□□□ 1.04
GDPD1-201ENST00000284116 IKBKBO14920 756 aa21.52■■□□□ 1.04
GDPD1-201ENST00000284116 ENTPD3O75355 529 aa21.52■■□□□ 1.04
GDPD1-201ENST00000284116 PRR29P0C7W0 189 aa21.52■■□□□ 1.04
GDPD1-201ENST00000284116 GNA11P29992 359 aa21.52■■□□□ 1.04
GDPD1-201ENST00000284116 NCAPHQ15003 741 aa21.52■■□□□ 1.04
GDPD1-201ENST00000284116 IL17AQ16552 155 aa21.52■■□□□ 1.04
GDPD1-201ENST00000284116 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
GDPD1-201ENST00000284116 DRC7Q8IY82 874 aa21.52■■□□□ 1.04
GDPD1-201ENST00000284116 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
GDPD1-201ENST00000284116 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
GDPD1-201ENST00000284116 KIF13BQ9NQT8 1826 aa21.52■■□□□ 1.04
GDPD1-201ENST00000284116 ESYT2A0FGR8 921 aa21.52■■□□□ 1.04
GDPD1-201ENST00000284116 SLFN14P0C7P3 912 aa21.52■■□□□ 1.04
GDPD1-201ENST00000284116 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
GDPD1-201ENST00000284116 SOGA3Q5TF21 947 aa21.52■■□□□ 1.04
GDPD1-201ENST00000284116 TATDN1Q6P1N9 297 aa21.52■■□□□ 1.04
GDPD1-201ENST00000284116 KRT25Q7Z3Z0 450 aa21.52■■□□□ 1.04
GDPD1-201ENST00000284116 DHX58Q96C10 678 aa21.52■■□□□ 1.04
GDPD1-201ENST00000284116 GPCPD1Q9NPB8 672 aa21.52■■□□□ 1.04
GDPD1-201ENST00000284116 MAN1B1Q9UKM7 699 aa21.52■■□□□ 1.04
GDPD1-201ENST00000284116 INF2Q27J81 1249 aa21.51■■□□□ 1.03
GDPD1-201ENST00000284116 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
GDPD1-201ENST00000284116 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa21.51■■□□□ 1.03
GDPD1-201ENST00000284116 SMARCE1Q969G3 411 aa21.51■■□□□ 1.03
GDPD1-201ENST00000284116 MKL1Q969V6 931 aa21.51■■□□□ 1.03
GDPD1-201ENST00000284116 CCDC34Q96HJ3 373 aa21.51■■□□□ 1.03
GDPD1-201ENST00000284116 SPATA20Q8TB22 786 aa21.5■■□□□ 1.03
GDPD1-201ENST00000284116 FBXO41Q8TF61 875 aa21.5■■□□□ 1.03
GDPD1-201ENST00000284116 VPS33BQ9H267 617 aa21.5■■□□□ 1.03
GDPD1-201ENST00000284116 FAM196BA6NMK8 535 aa21.5■■□□□ 1.03
GDPD1-201ENST00000284116 VIL1P09327 827 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
GDPD1-201ENST00000284116 BMP6P22004 513 aa21.5■■□□□ 1.03
GDPD1-201ENST00000284116 LONP1P36776 959 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
GDPD1-201ENST00000284116 TPM4P67936 248 aa21.5■■□□□ 1.03
GDPD1-201ENST00000284116 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
GDPD1-201ENST00000284116 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa21.5■■□□□ 1.03
GDPD1-201ENST00000284116 LARGE2Q8N3Y3 721 aa21.5■■□□□ 1.03
GDPD1-201ENST00000284116 TRIML1Q8N9V2 468 aa21.5■■□□□ 1.03
GDPD1-201ENST00000284116 TRIM34Q9BYJ4 488 aa21.5■■□□□ 1.03
GDPD1-201ENST00000284116 KANSL2Q9H9L4 492 aa21.5■■□□□ 1.03
GDPD1-201ENST00000284116 NYAP2Q9P242 653 aa21.5■■□□□ 1.03
GDPD1-201ENST00000284116 ATRNL1Q5VV63 1379 aa21.49■■□□□ 1.03
GDPD1-201ENST00000284116 ATP2B2Q01814 1243 aa21.49■■□□□ 1.03
GDPD1-201ENST00000284116 MORC3Q14149 939 aa21.49■■□□□ 1.03
GDPD1-201ENST00000284116 CCDC186Q7Z3E2 898 aa21.49■■□□□ 1.03
GDPD1-201ENST00000284116 PAGE5Q96GU1 130 aa21.49■■□□□ 1.03
GDPD1-201ENST00000284116 GMLQ99445 158 aa21.49■■□□□ 1.03
GDPD1-201ENST00000284116 KCNF1Q9H3M0 494 aa21.49■■□□□ 1.03
GDPD1-201ENST00000284116 JMJD4Q9H9V9 463 aa21.49■■□□□ 1.03
GDPD1-201ENST00000284116 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
GDPD1-201ENST00000284116 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP21.48■■□□□ 1.03
GDPD1-201ENST00000284116 ADGRF4Q8IZF3 695 aa21.48■■□□□ 1.03
GDPD1-201ENST00000284116 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
GDPD1-201ENST00000284116 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
GDPD1-201ENST00000284116 NRBP1Q9UHY1 535 aa21.48■■□□□ 1.03
GDPD1-201ENST00000284116 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa21.48■■□□□ 1.03
GDPD1-201ENST00000284116 LAD1O00515 517 aa21.48■■□□□ 1.03
GDPD1-201ENST00000284116 SMC2O95347 1197 aa21.48■■□□□ 1.03
GDPD1-201ENST00000284116 EEF2P13639 858 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
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GDPD1-201ENST00000284116 TTBK2Q6IQ55 1244 aa21.48■■□□□ 1.03
GDPD1-201ENST00000284116 MLKLQ8NB16 471 aa21.48■■□□□ 1.03
GDPD1-201ENST00000284116 PSMD14O00487 310 aa21.47■■□□□ 1.03
GDPD1-201ENST00000284116 RAD17O75943 681 aa21.47■■□□□ 1.03
GDPD1-201ENST00000284116 MYL5Q02045 173 aa21.47■■□□□ 1.03
GDPD1-201ENST00000284116 E2F4Q16254 413 aa21.47■■□□□ 1.03
GDPD1-201ENST00000284116 DTHD1Q6ZMT9 781 aa21.47■■□□□ 1.03
GDPD1-201ENST00000284116 IQUBQ8NA54 791 aa21.47■■□□□ 1.03
GDPD1-201ENST00000284116 COA7Q96BR5 231 aa21.47■■□□□ 1.03
GDPD1-201ENST00000284116 TMEM60Q9H2L4 133 aa21.47■■□□□ 1.03
GDPD1-201ENST00000284116 COL4A5P29400 1685 aa21.46■■□□□ 1.03
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GDPD1-201ENST00000284116 PRPHP41219 470 aa21.46■■□□□ 1.03
GDPD1-201ENST00000284116 CCDC96Q2M329 555 aa21.46■■□□□ 1.03
GDPD1-201ENST00000284116 TMEM179Q6ZVK1 233 aa21.46■■□□□ 1.03
GDPD1-201ENST00000284116 SIAH1Q8IUQ4 282 aa21.46■■□□□ 1.03
GDPD1-201ENST00000284116 MTMR8Q96EF0 704 aa21.46■■□□□ 1.03
GDPD1-201ENST00000284116 HSD3B7Q9H2F3 369 aa21.46■■□□□ 1.03
GDPD1-201ENST00000284116 HDAC9Q9UKV0 1011 aa21.46■■□□□ 1.03
GDPD1-201ENST00000284116 SPDYE2BA6NHP3 402 aa21.45■■□□□ 1.03
GDPD1-201ENST00000284116 SPDYE6P0CI01 402 aa21.45■■□□□ 1.03
GDPD1-201ENST00000284116 AFMP43652 599 aa21.45■■□□□ 1.03
GDPD1-201ENST00000284116 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.03
GDPD1-201ENST00000284116 PPP1R18Q6NYC8 613 aa21.45■■□□□ 1.03
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