RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000267176.8

SBNO1-201, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SBNO1, Length 11,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-201ENST00000267176 CASC4Q6P4E1 433 aa6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 DCUN1D2Q6PH85 259 aa6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 SPATA5Q8NB90 893 aa6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 KIAA0232Q92628 1395 aa6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 HOXB7P09629 217 aa6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP6.98□□□□□ -1.291e-6■■■■□ 23.3
SBNO1-201ENST00000267176 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 NINQ8N4C6 2090 aa6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 THAP12O43422 761 aa6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 PPP2R5DQ14738 602 aa6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 CASP8Q14790 479 aa6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 NCAPH2Q6IBW4 605 aa6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 CADPS2Q86UW7 1296 aa6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 LPIN2Q92539 896 aa6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 EPB41L5Q9HCM4 733 aa6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 BACH1O14867 736 aa6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 IFNAR2P48551 515 aa6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 RASIP1Q5U651 963 aa6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 ZNF654Q8IZM8 581 aa6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 LRRD1A4D1F6 860 aa6.97□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 GYS2P54840 703 aa6.97□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 DIXDC1Q155Q3 683 aa6.97□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 USH1GQ495M9 461 aa6.97□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 CCDC13Q8IYE1 715 aa6.97□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 PCDHA12Q9UN75 941 aa6.97□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 WDR7Q9Y4E6 1490 aa6.97□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 VPS41P49754 854 aa6.97□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 E2F5Q15329 346 aa6.97□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa6.97□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 VPS37BQ9H9H4 285 aa6.97□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 NEURL1BA8MQ27 555 aa6.97□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 CAPN12Q6ZSI9 719 aa6.97□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 TEX11Q8IYF3 940 aa6.97□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 IP6K1Q92551 441 aa6.97□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 MAP4K1Q92918 833 aa6.97□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 VEZTQ9HBM0 779 aa6.97□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 KAT6AQ92794 2004 aa6.97□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 EHHADHQ08426 723 aa6.97□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 SH2D4BQ5SQS7 431 aa6.97□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 LGSNQ5TDP6 509 aa6.97□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
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SBNO1-201ENST00000267176 IL2RBP14784 551 aa6.97□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 ADCY8P40145 1251 aa6.97□□□□□ -1.29
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SBNO1-201ENST00000267176 C2orf54Q08AI8 447 aa6.97□□□□□ -1.29
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SBNO1-201ENST00000267176 POLR3EQ9NVU0 708 aa6.97□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 MYH7BA7E2Y1 1941 aa6.97□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 RTEL1Q9NZ71 1219 aa6.97□□□□□ -1.29
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SBNO1-201ENST00000267176 NGLY1Q96IV0 654 aa6.97□□□□□ -1.29
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SBNO1-201ENST00000267176 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 PLEKHF1Q96S99 279 aa6.96□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa6.96□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa6.96□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 ARHGEF35A5YM69 484 aa6.96□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 KRT25Q7Z3Z0 450 aa6.96□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 SCYL3Q8IZE3 742 aa6.96□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 TACC3Q9Y6A5 838 aa6.96□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 TNRQ92752 1358 aa6.96□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 PBRM1Q86U86 1689 aa6.96□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 PPP6R2O75170 966 aa6.96□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 BAG2O95816 211 aa6.96□□□□□ -1.29
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