RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264839.11

RIMS1-201, Transcript of regulating synaptic membrane exocytosis 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RIMS1, Length 7,055 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS1-201ENST00000264839 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 CUL4BQ13620 913 aa13.88□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 MMEL1Q495T6 779 aa13.88□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 SYCE1Q8N0S2 351 aa13.88□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 PPP4R1Q8TF05 950 aa13.88□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 ERBB4Q15303 1308 aa13.88□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa13.88□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 H0Y3Z8 333 aa13.88□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 SRGAP2O75044 1071 aa13.88□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 ITKQ08881 620 aa13.88□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 GRIN2BQ13224 1484 aa13.88□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 LRRC8CQ8TDW0 803 aa13.88□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 ZNF653Q96CK0 615 aa13.88□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 DLATP10515 647 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 SMTNP53814 917 aa13.88□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 IRX4P78413 519 aa13.88□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 LRRC41Q15345 812 aa13.88□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 GPBP1Q86WP2 473 aa13.88□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 OGFOD1Q8N543 542 aa13.88□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 TRIM58Q8NG06 486 aa13.88□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 JRKLQ9Y4A0 524 aa13.88□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 SCRN1Q12765 414 aa13.87□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 KRT81Q14533 505 aa13.87□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 MCUQ8NE86 351 aa13.87□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 CDC25AP30304 524 aa13.87□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 FAM102BQ5T8I3 360 aa13.87□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 SPTLC3Q9NUV7 552 aa13.87□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 ADALQ6DHV7 355 aa13.87□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 FAM167BQ9BTA0 163 aa13.87□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP13.87□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 YIPF3Q9GZM5 350 aa13.87□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 FAM47EQ6ZV65 393 aa13.87□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 POMGNT1Q8WZA1 660 aa13.87□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP13.87□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 ABL1P00519 1130 aa13.87□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 SLC8A1P32418 973 aa13.87□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 MYSM1Q5VVJ2 828 aa13.87□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 BTBD18B2RXH4 712 aa13.87□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 GSTA1P08263 222 aa13.87□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 GSTA2P09210 222 aa13.87□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 DYNLT1P63172 113 aa13.87□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP13.87□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 MLXIPLQ9NP71 852 aa13.87□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP13.86□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 BCRP11274 1271 aa13.86□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 PLTPP55058 493 aa13.86□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa13.86□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa13.86□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 RASGRP4Q8TDF6 673 aa13.86□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 TMEM87BQ96K49 555 aa13.86□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 PANK4Q9NVE7 773 aa13.86□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 CCDC197Q8NCU1 140 aa13.86□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 CCDC127Q96BQ5 260 aa13.86□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 PGBD1Q96JS3 809 aa13.86□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 JADE1Q6IE81 842 aa13.86□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 ABCB6Q9NP58 842 aa13.86□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 RNMTO43148 476 aaKnown RBP13.86□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 STK10O94804 968 aaKnown RBP13.86□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 SLC4A1P02730 911 aa13.86□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 SLC12A2P55011 1212 aa13.86□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 UNC5CLQ8IV45 518 aa13.86□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 MAP3K5Q99683 1374 aa13.86□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 NSD2O96028 1365 aa13.85□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP13.85□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 DYDC2Q96IM9 177 aa13.85□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 CCDC93Q567U6 631 aa13.85□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 APPBP2Q92624 585 aa13.85□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa13.85□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 SMCO2A6NFE2 343 aa13.85□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 ADCY7P51828 1080 aa13.85□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 NNTQ13423 1086 aa13.85□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 SGK1O00141 431 aa13.85□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 CSPG5O95196 566 aa13.85□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 RPN1P04843 607 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 TMTC4Q5T4D3 741 aa13.85□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 GJA3Q9Y6H8 435 aa13.85□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa13.85□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 ATF2P15336 505 aa13.85□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 STAT1P42224 750 aa13.85□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP13.85□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 TCP11X2Q5H9J9 407 aa13.85□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP13.85□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 RSPH3Q86UC2 560 aa13.85□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 ZNF148Q9UQR1 794 aa13.85□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 LRRN2O75325 713 aa13.85□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 TFAP4Q01664 338 aa13.85□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 SUPT20HQ8NEM7 779 aa13.85□□□□□ -0.19
RIMS1-201ENST00000264839 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.1 ms