RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 CACNA1SQ13698 1873 aa16.79■□□□□ 0.28
SYP-201ENST00000263233 H7C1D1 291 aa16.79■□□□□ 0.28
SYP-201ENST00000263233 ENC1O14682 589 aa16.79■□□□□ 0.28
SYP-201ENST00000263233 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
SYP-201ENST00000263233 HERVK_113P62684 666 aa16.79■□□□□ 0.28
SYP-201ENST00000263233 CCDC152Q4G0S7 254 aa16.79■□□□□ 0.28
SYP-201ENST00000263233 HSP90B2PQ58FF3 399 aa16.79■□□□□ 0.28
SYP-201ENST00000263233 CCDC148Q8NFR7 591 aa16.79■□□□□ 0.28
SYP-201ENST00000263233 OR8K1Q8NGG5 319 aa16.79■□□□□ 0.28
SYP-201ENST00000263233 BRIP1Q9BX63 1249 aa16.79■□□□□ 0.28
SYP-201ENST00000263233 HAUS4Q9H6D7 363 aa16.79■□□□□ 0.28
SYP-201ENST00000263233 TRIM66O15016 1216 aa16.78■□□□□ 0.28
SYP-201ENST00000263233 PHACTR2O75167 634 aa16.78■□□□□ 0.28
SYP-201ENST00000263233 RPS6KA5O75582 802 aa16.78■□□□□ 0.28
SYP-201ENST00000263233 SCG2P13521 617 aa16.78■□□□□ 0.28
SYP-201ENST00000263233 USP14P54578 494 aa16.78■□□□□ 0.28
SYP-201ENST00000263233 DNAJC7Q99615 494 aa16.78■□□□□ 0.28
SYP-201ENST00000263233 TFR2Q9UP52 801 aa16.78■□□□□ 0.28
SYP-201ENST00000263233 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
SYP-201ENST00000263233 ZNF804BA4D1E1 1349 aa16.78■□□□□ 0.28
SYP-201ENST00000263233 TOM1O60784 492 aa16.78■□□□□ 0.28
SYP-201ENST00000263233 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
SYP-201ENST00000263233 IVLP07476 585 aa16.78■□□□□ 0.28
SYP-201ENST00000263233 PMS1P54277 932 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
SYP-201ENST00000263233 CTR9Q6PD62 1173 aa16.78■□□□□ 0.28
SYP-201ENST00000263233 WDR59Q6PJI9 974 aa16.78■□□□□ 0.28
SYP-201ENST00000263233 ADSSL1Q8N142 457 aa16.78■□□□□ 0.28
SYP-201ENST00000263233 C4orf32Q8N8J7 132 aa16.78■□□□□ 0.28
SYP-201ENST00000263233 ZNF507Q8TCN5 953 aa16.78■□□□□ 0.28
SYP-201ENST00000263233 TRIM34Q9BYJ4 488 aa16.78■□□□□ 0.28
SYP-201ENST00000263233 MED4Q9NPJ6 270 aa16.78■□□□□ 0.28
SYP-201ENST00000263233 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
SYP-201ENST00000263233 COL4A1P02462 1669 aa16.78■□□□□ 0.28
SYP-201ENST00000263233 LGALS16A8MUM7 142 aa16.77■□□□□ 0.28
SYP-201ENST00000263233 VGLL3A8MV65 326 aa16.77■□□□□ 0.28
SYP-201ENST00000263233 NMT2O60551 498 aa16.77■□□□□ 0.28
SYP-201ENST00000263233 GYG1P46976 350 aa16.77■□□□□ 0.28
SYP-201ENST00000263233 EVX2Q03828 476 aa16.77■□□□□ 0.28
SYP-201ENST00000263233 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
SYP-201ENST00000263233 MMS19Q96T76 1030 aa16.77■□□□□ 0.28
SYP-201ENST00000263233 RASSF4Q9H2L5 321 aa16.77■□□□□ 0.28
SYP-201ENST00000263233 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
SYP-201ENST00000263233 A0A1W2PQC6 194 aa16.77■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 LONP1P36776 959 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 STAT6P42226 847 aa16.77■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 FOXR1Q6PIV2 292 aa16.77■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 C10orf67Q8IYJ2 551 aa16.77■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 ACBD3Q9H3P7 528 aa16.77■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 CAPN11Q9UMQ6 739 aa16.77■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 SRGAP2O75044 1071 aa16.76■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 PCP11498 1178 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 EIF5P55010 431 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 ZNF384Q8TF68 577 aa16.76■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 VIPAS39Q9H9C1 493 aa16.76■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP16.76■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 SAR1BQ9Y6B6 198 aa16.76■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 CCDC122Q5T0U0 273 aa16.76■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 KAT6BQ8WYB5 2073 aa16.76■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 USP17L12C9JPN9 530 aa16.75■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 USP17L21D6R901 530 aa16.75■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 SYF2O95926 243 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP16.75■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 NAALADL2Q58DX5 795 aa16.75■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 CERKQ8TCT0 537 aa16.75■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 FAM204AQ9H8W3 233 aa16.75■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 DISC1Q9NRI5 854 aa16.75■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 PHLPP1O60346 1717 aa16.75■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 FAM47AQ5JRC9 791 aa16.75■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 ZNF662Q6ZS27 426 aa16.75■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 THAP9Q9H5L6 903 aa16.75■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 FAM205AQ6ZU69 1335 aa16.75■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 A0A1B0GUL6 1792 aa16.74■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 PES1O00541 588 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 MEA1Q16626 185 aa16.74■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 KLRC4O43908 158 aa16.74■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 RNF40O75150 1001 aa16.74■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 NTSR2O95665 410 aa16.74■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 KCNB1Q14721 858 aa16.74■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 LRRC31Q6UY01 552 aa16.74■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 CAPZA3Q96KX2 299 aa16.74■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 HPCAL4Q9UM19 191 aa16.74■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 RCCD1A6NED2 376 aa16.73■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 ORC4O43929 436 aa16.73■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 KRT83P78385 493 aa16.73■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 BLIDQ8IZY5 108 aa16.73■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 JAKMIP2Q96AA8 810 aa16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms