RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259239.7

IMP4-201, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene IMP4, Length 1,740 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-201ENST00000259239 MTMR2Q13614 643 aa20.52■□□□□ 0.88
IMP4-201ENST00000259239 TYW1BQ6NUM6 668 aa20.52■□□□□ 0.88
IMP4-201ENST00000259239 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa20.52■□□□□ 0.88
IMP4-201ENST00000259239 AS3MTQ9HBK9 375 aa20.52■□□□□ 0.88
IMP4-201ENST00000259239 BARHL2Q9NY43 387 aa20.52■□□□□ 0.88
IMP4-201ENST00000259239 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
IMP4-201ENST00000259239 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa20.52■□□□□ 0.88
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IMP4-201ENST00000259239 STXBP3O00186 592 aa20.51■□□□□ 0.87
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IMP4-201ENST00000259239 BRAPQ7Z569 592 aa20.51■□□□□ 0.87
IMP4-201ENST00000259239 OXER1Q8TDS5 423 aa20.51■□□□□ 0.87
IMP4-201ENST00000259239 WDR18Q9BV38 432 aa20.51■□□□□ 0.87
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IMP4-201ENST00000259239 FIBPO43427 364 aa20.5■□□□□ 0.87
IMP4-201ENST00000259239 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP20.5■□□□□ 0.871e-7■■■□□ 17.4
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IMP4-201ENST00000259239 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
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IMP4-201ENST00000259239 SYDE2Q5VT97 1194 aa20.5■□□□□ 0.87
IMP4-201ENST00000259239 ZNF280CQ8ND82 737 aa20.5■□□□□ 0.87
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IMP4-201ENST00000259239 SMCHD1A6NHR9 2005 aa20.5■□□□□ 0.87
IMP4-201ENST00000259239 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa20.5■□□□□ 0.87
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IMP4-201ENST00000259239 TRAF5O00463 557 aa20.5■□□□□ 0.87
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IMP4-201ENST00000259239 STAT2P52630 851 aa20.5■□□□□ 0.87
IMP4-201ENST00000259239 NLRP5P59047 1200 aa20.5■□□□□ 0.87
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IMP4-201ENST00000259239 CSADQ9Y600 493 aa20.5■□□□□ 0.87
IMP4-201ENST00000259239 ZBTB5O15062 677 aa20.49■□□□□ 0.87
IMP4-201ENST00000259239 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
IMP4-201ENST00000259239 NAPAP54920 295 aa20.49■□□□□ 0.87
IMP4-201ENST00000259239 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP20.49■□□□□ 0.87
IMP4-201ENST00000259239 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
IMP4-201ENST00000259239 LDHDQ86WU2 507 aa20.49■□□□□ 0.87
IMP4-201ENST00000259239 NOSTRINQ8IVI9 506 aa20.49■□□□□ 0.87
IMP4-201ENST00000259239 CCDC148Q8NFR7 591 aa20.49■□□□□ 0.87
IMP4-201ENST00000259239 LPAR1Q92633 364 aa20.49■□□□□ 0.87
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IMP4-201ENST00000259239 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
IMP4-201ENST00000259239 USP14P54578 494 aa20.48■□□□□ 0.87
IMP4-201ENST00000259239 BACE1P56817 501 aa20.48■□□□□ 0.87
IMP4-201ENST00000259239 SNAP25P60880 206 aa20.48■□□□□ 0.87
IMP4-201ENST00000259239 QRICH1Q2TAL8 776 aa20.48■□□□□ 0.87
IMP4-201ENST00000259239 MYSM1Q5VVJ2 828 aa20.48■□□□□ 0.87
IMP4-201ENST00000259239 COA7Q96BR5 231 aa20.48■□□□□ 0.87
IMP4-201ENST00000259239 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.87
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IMP4-201ENST00000259239 hCG_1984214I3L0E3 225 aa20.47■□□□□ 0.87
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IMP4-201ENST00000259239 ZNF408Q9H9D4 720 aa20.47■□□□□ 0.87
IMP4-201ENST00000259239 LMBRD1Q9NUN5 540 aa20.47■□□□□ 0.87
IMP4-201ENST00000259239 PRR12Q9ULL5 1215 aa20.47■□□□□ 0.87
IMP4-201ENST00000259239 VCAM1P19320 739 aa20.47■□□□□ 0.87
IMP4-201ENST00000259239 CALML3P27482 149 aa20.47■□□□□ 0.87
IMP4-201ENST00000259239 HMGCS2P54868 508 aa20.47■□□□□ 0.87
IMP4-201ENST00000259239 MAP3K11Q16584 847 aa20.47■□□□□ 0.87
IMP4-201ENST00000259239 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa20.47■□□□□ 0.87
IMP4-201ENST00000259239 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
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IMP4-201ENST00000259239 USP28Q96RU2 1077 aa20.47■□□□□ 0.87
IMP4-201ENST00000259239 ELP3Q9H9T3 547 aa20.47■□□□□ 0.87
IMP4-201ENST00000259239 FBXO28Q9NVF7 368 aa20.47■□□□□ 0.87
IMP4-201ENST00000259239 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa20.47■□□□□ 0.87
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IMP4-201ENST00000259239 KIFC2Q96AC6 838 aa20.46■□□□□ 0.87
IMP4-201ENST00000259239 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
IMP4-201ENST00000259239 FEM1BQ9UK73 627 aa20.46■□□□□ 0.87
IMP4-201ENST00000259239 PCDHA4Q9UN74 947 aa20.46■□□□□ 0.87
IMP4-201ENST00000259239 LOC285556D6RIA3 1793 aa20.46■□□□□ 0.87
IMP4-201ENST00000259239 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
IMP4-201ENST00000259239 PLA2G6O60733 806 aa20.45■□□□□ 0.86
IMP4-201ENST00000259239 ARMC9Q7Z3E5 817 aa20.45■□□□□ 0.86
IMP4-201ENST00000259239 FAM160B2Q86V87 743 aa20.45■□□□□ 0.86
IMP4-201ENST00000259239 BLIDQ8IZY5 108 aa20.45■□□□□ 0.86
IMP4-201ENST00000259239 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
IMP4-201ENST00000259239 TMEM87AQ8NBN3 555 aa20.45■□□□□ 0.86
IMP4-201ENST00000259239 TNFRSF25Q93038 417 aa20.45■□□□□ 0.86
IMP4-201ENST00000259239 TANGO6Q9C0B7 1094 aa20.45■□□□□ 0.86
IMP4-201ENST00000259239 ZMYND12Q9H0C1 365 aa20.45■□□□□ 0.86
IMP4-201ENST00000259239 FAM205CA6NFA0 338 aa20.44■□□□□ 0.86
IMP4-201ENST00000259239 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
IMP4-201ENST00000259239 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
IMP4-201ENST00000259239 DAGLBQ8NCG7 672 aa20.44■□□□□ 0.86
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