RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249330.2

VGF-201, Transcript of VGF nerve growth factor inducible, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VGF, Length 2,575 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGF-201ENST00000249330 PARD6BQ9BYG5 372 aa22.86■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 IL17RBQ9NRM6 502 aa22.86■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 ECM29Q5VYK3 1845 aa22.85■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 FOXN1O15353 648 aa22.85■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa22.85■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 USP17L3A6NCW0 530 aa22.85■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 USP17L4A6NCW7 530 aa22.85■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 DPEP1P16444 411 aa22.85■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 KCNA3P22001 575 aa22.85■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
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VGF-201ENST00000249330 USP17L1Q7RTZ2 530 aa22.85■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 CATIPQ7Z7H3 387 aa22.85■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 MLKLQ8NB16 471 aa22.85■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa22.85■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 ZNF18P17022 549 aa22.84■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 RCSD1Q6JBY9 416 aa22.84■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
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VGF-201ENST00000249330 SMARCE1Q969G3 411 aa22.84■■□□□ 1.25
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VGF-201ENST00000249330 CERS3Q8IU89 383 aa22.84■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 NID2Q14112 1375 aa22.83■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa22.83■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa22.83■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 TTLL6Q8N841 843 aa22.83■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 C10orf71Q711Q0 1435 aa22.83■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 SCN9AQ15858 1988 aa22.83■■□□□ 1.24
VGF-201ENST00000249330 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP22.83■■□□□ 1.24
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VGF-201ENST00000249330 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.24
VGF-201ENST00000249330 DESI2Q9BSY9 194 aa22.83■■□□□ 1.24
VGF-201ENST00000249330 TSPYL1Q9H0U9 437 aa22.83■■□□□ 1.24
VGF-201ENST00000249330 USP40Q9NVE5 1235 aa22.83■■□□□ 1.24
VGF-201ENST00000249330 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa22.82■■□□□ 1.24
VGF-201ENST00000249330 PLEKHA8P1O95397 391 aa22.82■■□□□ 1.24
VGF-201ENST00000249330 TXLNAP40222 546 aa22.82■■□□□ 1.24
VGF-201ENST00000249330 SPECC1Q5M775 1068 aa22.82■■□□□ 1.24
VGF-201ENST00000249330 DACT2Q5SW24 774 aa22.82■■□□□ 1.24
VGF-201ENST00000249330 TSPY3P0CV98 308 aa22.82■■□□□ 1.24
VGF-201ENST00000249330 TSPY8P0CW00 308 aa22.82■■□□□ 1.24
VGF-201ENST00000249330 CDK8P49336 464 aa22.82■■□□□ 1.24
VGF-201ENST00000249330 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
VGF-201ENST00000249330 FUT8Q9BYC5 575 aa22.82■■□□□ 1.24
VGF-201ENST00000249330 SNED1Q8TER0 1413 aa22.82■■□□□ 1.24
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VGF-201ENST00000249330 ROBO3Q96MS0 1386 aa22.81■■□□□ 1.24
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VGF-201ENST00000249330 RASA1P20936 1047 aa22.81■■□□□ 1.24
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VGF-201ENST00000249330 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa22.81■■□□□ 1.24
VGF-201ENST00000249330 STK36Q9NRP7 1315 aa22.81■■□□□ 1.24
VGF-201ENST00000249330 PPIP5K2O43314 1243 aa22.81■■□□□ 1.24
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VGF-201ENST00000249330 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa22.81■■□□□ 1.24
VGF-201ENST00000249330 CCDC151A5D8V7 595 aa22.8■■□□□ 1.24
VGF-201ENST00000249330 CAPN2P17655 700 aa22.8■■□□□ 1.24
VGF-201ENST00000249330 CRKP46108 304 aa22.8■■□□□ 1.24
VGF-201ENST00000249330 RCAN1P53805 252 aa22.8■■□□□ 1.24
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VGF-201ENST00000249330 BRD3Q15059 726 aa22.8■■□□□ 1.24
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VGF-201ENST00000249330 TRIML1Q8N9V2 468 aa22.8■■□□□ 1.24
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VGF-201ENST00000249330 TRERF1Q96PN7 1200 aa22.8■■□□□ 1.24
VGF-201ENST00000249330 SERTAD1Q9UHV2 236 aa22.8■■□□□ 1.24
VGF-201ENST00000249330 KCNJ14Q9UNX9 436 aa22.8■■□□□ 1.24
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VGF-201ENST00000249330 C16orf86Q6ZW13 317 aa22.79■■□□□ 1.24
VGF-201ENST00000249330 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
VGF-201ENST00000249330 MTMR7Q9Y216 660 aa22.79■■□□□ 1.24
VGF-201ENST00000249330 SLURP2P0DP57 97 aa22.79■■□□□ 1.24
VGF-201ENST00000249330 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP22.79■■□□□ 1.24
VGF-201ENST00000249330 HHIPL2Q6UWX4 724 aa22.79■■□□□ 1.24
VGF-201ENST00000249330 PANX2Q96RD6 677 aa22.79■■□□□ 1.24
VGF-201ENST00000249330 SARSP49591 514 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
VGF-201ENST00000249330 CHMP4BP1P59074 171 aa22.78■■□□□ 1.24
VGF-201ENST00000249330 FUT2Q10981 343 aa22.78■■□□□ 1.24
VGF-201ENST00000249330 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
VGF-201ENST00000249330 STX8Q9UNK0 236 aa22.78■■□□□ 1.24
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