RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF186Q9NXI6 227 aa30.2■■■□□ 2.43
CAPNS1-201ENST00000246533 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.43
CAPNS1-201ENST00000246533 MTMR2Q13614 643 aa30.2■■■□□ 2.42
CAPNS1-201ENST00000246533 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.42
CAPNS1-201ENST00000246533 ARID3AQ99856 593 aa30.2■■■□□ 2.42
CAPNS1-201ENST00000246533 KCND1Q9NSA2 647 aa30.2■■■□□ 2.42
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1W2PRG0 241 aa30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-201ENST00000246533 HMGCS2P54868 508 aa30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC112Q8NEF3 446 aa30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
CAPNS1-201ENST00000246533 BTBD19C9JJ37 291 aa30.18■■■□□ 2.42
CAPNS1-201ENST00000246533 CXCL11O14625 94 aa30.18■■■□□ 2.42
CAPNS1-201ENST00000246533 KIF20AO95235 890 aa30.18■■■□□ 2.42
CAPNS1-201ENST00000246533 SREBF2Q12772 1141 aa30.18■■■□□ 2.42
CAPNS1-201ENST00000246533 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
CAPNS1-201ENST00000246533 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
CAPNS1-201ENST00000246533 FOXN1O15353 648 aa30.18■■■□□ 2.42
CAPNS1-201ENST00000246533 JAK2O60674 1132 aa30.18■■■□□ 2.42
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa30.18■■■□□ 2.42
CAPNS1-201ENST00000246533 WDR18Q9BV38 432 aa30.18■■■□□ 2.42
CAPNS1-201ENST00000246533 OGFRQ9NZT2 677 aa30.18■■■□□ 2.42
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF213O14771 459 aa30.17■■■□□ 2.42
CAPNS1-201ENST00000246533 CETPP11597 493 aa30.17■■■□□ 2.42
CAPNS1-201ENST00000246533 PDE4BQ07343 736 aa30.17■■■□□ 2.42
CAPNS1-201ENST00000246533 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP30.17■■■□□ 2.42
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM179Q6ZVK1 233 aa30.17■■■□□ 2.42
CAPNS1-201ENST00000246533 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP30.17■■■□□ 2.42
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC17Q96LX7 622 aa30.17■■■□□ 2.42
CAPNS1-201ENST00000246533 ANO10Q9NW15 660 aa30.17■■■□□ 2.42
CAPNS1-201ENST00000246533 CBX1P83916 185 aa30.16■■■□□ 2.42
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CAPNS1-201ENST00000246533 LRMPQ12912 555 aa30.16■■■□□ 2.42
CAPNS1-201ENST00000246533 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP30.16■■■□□ 2.42
CAPNS1-201ENST00000246533 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
CAPNS1-201ENST00000246533 GPAT2Q6NUI2 795 aa30.16■■■□□ 2.42
CAPNS1-201ENST00000246533 GADL1Q6ZQY3 521 aa30.16■■■□□ 2.42
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRC8AQ8IWT6 810 aa30.16■■■□□ 2.42
CAPNS1-201ENST00000246533 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
CAPNS1-201ENST00000246533 AGXT2Q9BYV1 514 aa30.16■■■□□ 2.42
CAPNS1-201ENST00000246533 NRBP1Q9UHY1 535 aa30.16■■■□□ 2.42
CAPNS1-201ENST00000246533 FGRP09769 529 aa30.16■■■□□ 2.42
CAPNS1-201ENST00000246533 BACE1P56817 501 aa30.16■■■□□ 2.42
CAPNS1-201ENST00000246533 TREML2Q5T2D2 321 aa30.16■■■□□ 2.42
CAPNS1-201ENST00000246533 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP30.16■■■□□ 2.42
CAPNS1-201ENST00000246533 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
CAPNS1-201ENST00000246533 TOMM22Q9NS69 142 aa30.16■■■□□ 2.42
CAPNS1-201ENST00000246533 NEDD4P46934 1319 aa30.15■■■□□ 2.42
CAPNS1-201ENST00000246533 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP30.15■■■□□ 2.42
CAPNS1-201ENST00000246533 DTNBO60941 627 aa30.15■■■□□ 2.42
CAPNS1-201ENST00000246533 TBC1D8O95759 1140 aa30.15■■■□□ 2.42
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
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CAPNS1-201ENST00000246533 INHBEP58166 350 aa30.15■■■□□ 2.42
CAPNS1-201ENST00000246533 TFAP4Q01664 338 aa30.15■■■□□ 2.42
CAPNS1-201ENST00000246533 GINM1Q9NU53 330 aa30.15■■■□□ 2.42
CAPNS1-201ENST00000246533 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP30.15■■■□□ 2.42
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CAPNS1-201ENST00000246533 CYP21A2P08686 494 aa30.14■■■□□ 2.42
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CAPNS1-201ENST00000246533 AS3MTQ9HBK9 375 aa30.14■■■□□ 2.42
CAPNS1-201ENST00000246533 LAMA4Q16363 1823 aa30.14■■■□□ 2.42
CAPNS1-201ENST00000246533 USP17L10C9JJH3 530 aa30.14■■■□□ 2.41
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CAPNS1-201ENST00000246533 FAM160A1Q05DH4 1040 aa30.14■■■□□ 2.41
CAPNS1-201ENST00000246533 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa30.14■■■□□ 2.41
CAPNS1-201ENST00000246533 AKNAD1Q5T1N1 836 aa30.14■■■□□ 2.41
CAPNS1-201ENST00000246533 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.41
CAPNS1-201ENST00000246533 EMILIN3Q9NT22 766 aa30.14■■■□□ 2.41
CAPNS1-201ENST00000246533 TAOK2Q9UL54 1235 aa30.14■■■□□ 2.41
CAPNS1-201ENST00000246533 ATP2B2Q01814 1243 aa30.13■■■□□ 2.41
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CAPNS1-201ENST00000246533 CEP135Q66GS9 1140 aa30.12■■■□□ 2.41
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CAPNS1-201ENST00000246533 CEP95Q96GE4 821 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-201ENST00000246533 BEGAINQ9BUH8 593 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-201ENST00000246533 MFSD6Q6ZSS7 791 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-201ENST00000246533 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
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CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF287Q9HBT7 754 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-201ENST00000246533 IL17RBQ9NRM6 502 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-201ENST00000246533 CTNNA3Q9UI47 895 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-201ENST00000246533 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa30.11■■■□□ 2.41
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CAPNS1-201ENST00000246533 TSPY3P0CV98 308 aa30.11■■■□□ 2.41
CAPNS1-201ENST00000246533 TSPY8P0CW00 308 aa30.11■■■□□ 2.41
CAPNS1-201ENST00000246533 CEP57L1Q8IYX8 460 aa30.11■■■□□ 2.41
CAPNS1-201ENST00000246533 SH3D19Q5HYK7 790 aa30.1■■■□□ 2.41
CAPNS1-201ENST00000246533 NEDD1Q8NHV4 660 aa30.1■■■□□ 2.41
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP30.1■■■□□ 2.41
CAPNS1-201ENST00000246533 PRDM10Q9NQV6 1147 aa30.1■■■□□ 2.41
CAPNS1-201ENST00000246533 IMPACTQ9P2X3 320 aa30.1■■■□□ 2.41
CAPNS1-201ENST00000246533 PDHXO00330 501 aa30.1■■■□□ 2.41
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