RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007722.11

ITGA3-201, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene ITGA3, Length 3,665 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-201ENST00000007722 TYW1BQ6NUM6 668 aa14.64□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 ARMT1Q9H993 441 aa14.64□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 KLC4Q9NSK0 619 aa14.64□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 NFU1Q9UMS0 254 aa14.64□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 GCP02774 474 aa14.64□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 NAA25Q14CX7 972 aa14.64□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 MB21D1Q8N884 522 aa14.64□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 AKR1B10O60218 316 aa14.63□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 ELF1P32519 619 aa14.63□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 TICAM2Q86XR7 235 aa14.63□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 GPR108Q9NPR9 543 aa14.63□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 PIK3C2AO00443 1686 aa14.63□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 GOLGA6L10A6NI86 522 aa14.63□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 MBD4O95243 580 aa14.63□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 KRT2P35908 639 aa14.63□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 PRCPP42785 496 aa14.63□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 EPHB4P54760 987 aa14.63□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 PTGDRQ13258 359 aa14.63□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 NAA35Q5VZE5 725 aa14.63□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa14.63□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 SEMA3EO15041 775 aa14.63□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 BUB1O43683 1085 aa14.63□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 TATP17735 454 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 GPTP24298 496 aa14.63□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 LSP1P33241 339 aa14.63□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 PDE6BP35913 854 aa14.63□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 GUCY2DQ02846 1103 aa14.63□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 SPATA4Q8NEY3 305 aa14.63□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 FAM89AQ96GI7 184 aa14.63□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 V9GY48 417 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 MCAMP43121 646 aa14.62□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 IQCA1Q86XH1 822 aa14.62□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 RWDD2AQ9UIY3 292 aa14.62□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 PDHBP11177 359 aa14.62□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 NR1D1P20393 614 aa14.62□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 STAT6P42226 847 aa14.62□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa14.62□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 EPB41L5Q9HCM4 733 aa14.62□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa14.62□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 H7C1W4 665 aa14.62□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 RPN1P04843 607 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 TTC38Q5R3I4 469 aa14.62□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 WNT7AO00755 349 aa14.61□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 ADD2P35612 726 aa14.61□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 TBC1D31Q96DN5 1066 aa14.61□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 MS4A14Q96JA4 679 aa14.61□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 STIM2Q9P246 746 aa14.61□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 AXIN2Q9Y2T1 843 aa14.61□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 PRKAB2O43741 272 aa14.61□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 CASP7P55210 303 aa14.61□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 C2CD5Q86YS7 1000 aa14.61□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 MAGEB6Q8N7X4 407 aa14.61□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 MIGA1Q8NAN2 632 aa14.61□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 ALS2CR12Q96Q35 445 aa14.61□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 CCT8L2Q96SF2 557 aa14.61□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 MTMR7Q9Y216 660 aa14.61□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa14.61□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 XDHP47989 1333 aa14.61□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 DIP2BQ9P265 1576 aa14.61□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 EZRP15311 586 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 TCIRG1Q13488 830 aa14.61□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa14.61□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 CCDC13Q8IYE1 715 aa14.61□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 PDE6AP16499 860 aa14.6□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 PTPROQ16827 1216 aa14.6□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 WDR59Q6PJI9 974 aa14.6□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 NLRP14Q86W24 1093 aa14.6□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 ZNF654Q8IZM8 581 aa14.6□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 FANCBQ8NB91 859 aa14.6□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 SPATA20Q8TB22 786 aa14.6□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 SLC40A1Q9NP59 571 aa14.6□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 SNX12Q9UMY4 172 aa14.6□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ITGA3-201ENST00000007722 CARSP49589 748 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.1 ms