RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637475.1

CACNA1A-241, Transcript of calcium voltage-gated channel subunit alpha1 A, humanhuman

Gene CACNA1A, Length 1,975 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1A-241ENST00000637475 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 PPFIA4O75335 1185 aa22.12■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 PDE8BO95263 885 aa22.12■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 XBP1P17861 261 aa22.12■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 COPB1P53618 953 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 FANCBQ8NB91 859 aa22.12■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 PHF20Q9BVI0 1012 aa22.12■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 MYH2Q9UKX2 1941 aa22.12■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 GSG1L2A8MUP6 293 aa22.12■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 RHOXF2BP0C7M4 288 aa22.12■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 FGFR2P21802 821 aa22.12■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 E2F4Q16254 413 aa22.12■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa22.12■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 RHOXF2Q9BQY4 288 aa22.12■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 SUGCTQ9HAC7 445 aa22.12■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 A0A1W2PQC6 194 aa22.11■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa22.11■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 OXER1Q8TDS5 423 aa22.11■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 CABP5Q9NP86 173 aa22.11■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 NHSQ6T4R5 1651 aa22.11■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa22.1■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 SYF2O95926 243 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 ZNF654Q8IZM8 581 aa22.1■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 EHBP1Q8NDI1 1231 aa22.1■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 CPLX3Q8WVH0 158 aa22.1■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 TNFRSF25Q93038 417 aa22.1■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 DNAJC7Q99615 494 aa22.1■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 YY1AP1Q9H869 796 aa22.1■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 N4BP3O15049 544 aa22.1■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 ITGA6P23229 1130 aa22.1■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 KRT2P35908 639 aa22.1■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 ERICH2A1L162 156 aa22.09■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 NDUFA10O95299 355 aa22.09■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 CTSWP56202 376 aa22.09■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 CTDSPL2Q05D32 466 aa22.09■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 FUT2Q10981 343 aa22.09■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 MAP3K12Q12852 859 aa22.09■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 TCP11X2Q5H9J9 407 aa22.09■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 PPM1EQ8WY54 764 aa22.09■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 LPIN2Q92539 896 aa22.09■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 CCDC102AQ96A19 550 aa22.09■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 EPSTI1Q96J88 318 aa22.09■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 NACAP1Q9BZK3 213 aa22.09■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 FAM107BQ9H098 131 aa22.09■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 FAM204AQ9H8W3 233 aa22.09■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 RMND1Q9NWS8 449 aa22.09■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 ANAPC4Q9UJX5 808 aa22.09■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 HPCAL4Q9UM19 191 aa22.09■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 XDHP47989 1333 aa22.09■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 RNF40O75150 1001 aa22.08■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 MBD4O95243 580 aa22.08■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 PHKA1P46020 1223 aa22.08■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 STX17P56962 302 aa22.08■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 SEC23AQ15436 765 aa22.08■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 KLHL10Q6JEL2 608 aa22.08■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 AFAP1L1Q8TED9 768 aa22.08■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 FAM89AQ96GI7 184 aa22.08■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 BRMS1Q9HCU9 246 aa22.08■■□□□ 1.13
CACNA1A-241ENST00000637475 ANO9A1A5B4 782 aa22.08■■□□□ 1.12
CACNA1A-241ENST00000637475 AFMP43652 599 aa22.08■■□□□ 1.12
CACNA1A-241ENST00000637475 PAK1Q13153 545 aa22.08■■□□□ 1.12
CACNA1A-241ENST00000637475 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
CACNA1A-241ENST00000637475 PKN1Q16512 942 aa22.08■■□□□ 1.12
CACNA1A-241ENST00000637475 TXNRD1Q16881 649 aa22.08■■□□□ 1.12
CACNA1A-241ENST00000637475 PDXDC2PQ6P474 469 aa22.08■■□□□ 1.12
CACNA1A-241ENST00000637475 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
CACNA1A-241ENST00000637475 KIF6Q6ZMV9 814 aa22.08■■□□□ 1.12
CACNA1A-241ENST00000637475 COG1Q8WTW3 980 aa22.08■■□□□ 1.12
CACNA1A-241ENST00000637475 SHISA4Q96DD7 197 aa22.08■■□□□ 1.12
CACNA1A-241ENST00000637475 CTNND2Q9UQB3 1225 aa22.08■■□□□ 1.12
CACNA1A-241ENST00000637475 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.07■■□□□ 1.12
CACNA1A-241ENST00000637475 KRT9P35527 623 aa22.07■■□□□ 1.12
CACNA1A-241ENST00000637475 TRAPPC10P48553 1259 aa22.07■■□□□ 1.12
CACNA1A-241ENST00000637475 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CACNA1A-241ENST00000637475 EFCAB13Q8IY85 973 aa22.07■■□□□ 1.12
CACNA1A-241ENST00000637475 GREM2Q9H772 168 aa22.07■■□□□ 1.12
CACNA1A-241ENST00000637475 ABL1P00519 1130 aa22.07■■□□□ 1.12
CACNA1A-241ENST00000637475 MEA1Q16626 185 aa22.07■■□□□ 1.12
CACNA1A-241ENST00000637475 OR8K1Q8NGG5 319 aa22.07■■□□□ 1.12
CACNA1A-241ENST00000637475 CNNM1Q9NRU3 951 aa22.07■■□□□ 1.12
CACNA1A-241ENST00000637475 MROH5Q6ZUA9 1318 aa22.07■■□□□ 1.12
CACNA1A-241ENST00000637475 KCNJ18B7U540 433 aa22.06■■□□□ 1.12
CACNA1A-241ENST00000637475 H7C1D1 291 aa22.06■■□□□ 1.12
CACNA1A-241ENST00000637475 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
CACNA1A-241ENST00000637475 ITIH3Q06033 890 aa22.06■■□□□ 1.12
CACNA1A-241ENST00000637475 KCNJ12Q14500 433 aa22.06■■□□□ 1.12
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