RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 RLFQ13129 1914 aa33.02■■■□□ 2.88
CAPNS1-217ENST00000629983 PGK1P00558 417 aa33.02■■■□□ 2.88
CAPNS1-217ENST00000629983 PGK2P07205 417 aa33.02■■■□□ 2.88
CAPNS1-217ENST00000629983 CLTBP09497 229 aa33.02■■■□□ 2.88
CAPNS1-217ENST00000629983 KCTD2Q14681 263 aa33.02■■■□□ 2.88
CAPNS1-217ENST00000629983 C1orf53Q5VUE5 145 aa33.02■■■□□ 2.88
CAPNS1-217ENST00000629983 AMOTL1Q8IY63 956 aa33.02■■■□□ 2.88
CAPNS1-217ENST00000629983 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP33.02■■■□□ 2.88
CAPNS1-217ENST00000629983 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa33.01■■■□□ 2.87
CAPNS1-217ENST00000629983 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP33.01■■■□□ 2.87
CAPNS1-217ENST00000629983 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP33.01■■■□□ 2.87
CAPNS1-217ENST00000629983 NRBP1Q9UHY1 535 aa33.01■■■□□ 2.87
CAPNS1-217ENST00000629983 PRKAB2O43741 272 aa33■■■□□ 2.87
CAPNS1-217ENST00000629983 MBD4O95243 580 aa33■■■□□ 2.87
CAPNS1-217ENST00000629983 RAG1P15918 1043 aa33■■■□□ 2.87
CAPNS1-217ENST00000629983 SIAH1Q8IUQ4 282 aa33■■■□□ 2.87
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC17Q96LX7 622 aa32.99■■■□□ 2.87
CAPNS1-217ENST00000629983 TINF2Q9BSI4 451 aa32.99■■■□□ 2.87
CAPNS1-217ENST00000629983 FBXO28Q9NVF7 368 aa32.99■■■□□ 2.87
CAPNS1-217ENST00000629983 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP32.98■■■□□ 2.87
CAPNS1-217ENST00000629983 DDRGK1Q96HY6 314 aa32.98■■■□□ 2.87
CAPNS1-217ENST00000629983 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa32.98■■■□□ 2.87
CAPNS1-217ENST00000629983 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP32.98■■■□□ 2.87
CAPNS1-217ENST00000629983 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa32.97■■■□□ 2.87
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP32.97■■■□□ 2.87
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1W2PQY0 241 aa32.97■■■□□ 2.87
CAPNS1-217ENST00000629983 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP32.97■■■□□ 2.87
CAPNS1-217ENST00000629983 ITGB8P26012 769 aa32.97■■■□□ 2.87
CAPNS1-217ENST00000629983 CDK8P49336 464 aa32.97■■■□□ 2.87
CAPNS1-217ENST00000629983 RIOX2Q8IUF8 465 aa32.97■■■□□ 2.87
CAPNS1-217ENST00000629983 CNPY2Q9Y2B0 182 aa32.97■■■□□ 2.87
CAPNS1-217ENST00000629983 EEF2P13639 858 aaKnown RBP32.96■■■□□ 2.87
CAPNS1-217ENST00000629983 AKR1A1P14550 325 aa32.96■■■□□ 2.87
CAPNS1-217ENST00000629983 STAT3P40763 770 aa32.96■■■□□ 2.87
CAPNS1-217ENST00000629983 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP32.96■■■□□ 2.87
CAPNS1-217ENST00000629983 KIF1BPQ96EK5 621 aa32.96■■■□□ 2.87
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM39AQ9NV64 488 aa32.96■■■□□ 2.87
CAPNS1-217ENST00000629983 EPHB4P54760 987 aa32.95■■■□□ 2.87
CAPNS1-217ENST00000629983 FPGSQ05932 587 aa32.95■■■□□ 2.87
CAPNS1-217ENST00000629983 SLFNL1Q499Z3 407 aa32.95■■■□□ 2.87
CAPNS1-217ENST00000629983 GOPCQ9HD26 462 aa32.95■■■□□ 2.87
CAPNS1-217ENST00000629983 PAG1Q9NWQ8 432 aa32.95■■■□□ 2.87
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF792Q3KQV3 632 aa32.94■■■□□ 2.86
CAPNS1-217ENST00000629983 PANK1Q8TE04 598 aa32.94■■■□□ 2.86
CAPNS1-217ENST00000629983 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP32.94■■■□□ 2.862e-6■■□□□ 12.4
CAPNS1-217ENST00000629983 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa32.94■■■□□ 2.86
CAPNS1-217ENST00000629983 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP32.94■■■□□ 2.86
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM265A0A087WTH1 108 aa32.93■■■□□ 2.86
CAPNS1-217ENST00000629983 USP17L12C9JPN9 530 aa32.93■■■□□ 2.86
CAPNS1-217ENST00000629983 USP17L21D6R901 530 aa32.93■■■□□ 2.86
CAPNS1-217ENST00000629983 SMIM22K7EJ46 135 aa32.93■■■□□ 2.86
CAPNS1-217ENST00000629983 VWA5AO00534 786 aa32.93■■■□□ 2.86
CAPNS1-217ENST00000629983 KIAA0355O15063 1070 aa32.93■■■□□ 2.86
CAPNS1-217ENST00000629983 COPB2P35606 906 aa32.93■■■□□ 2.86
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM83BQ5T0W9 1011 aa32.93■■■□□ 2.86
CAPNS1-217ENST00000629983 C12orf60Q5U649 245 aa32.93■■■□□ 2.86
CAPNS1-217ENST00000629983 BOLA2Q9H3K6 86 aa32.93■■■□□ 2.86
CAPNS1-217ENST00000629983 KANSL2Q9H9L4 492 aa32.93■■■□□ 2.86
CAPNS1-217ENST00000629983 ADD2P35612 726 aa32.92■■■□□ 2.86
CAPNS1-217ENST00000629983 C16orf86Q6ZW13 317 aa32.92■■■□□ 2.86
CAPNS1-217ENST00000629983 STARD7Q9NQZ5 370 aa32.92■■■□□ 2.86
CAPNS1-217ENST00000629983 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa32.92■■■□□ 2.86
CAPNS1-217ENST00000629983 DCDC2CA8MYV0 355 aa32.91■■■□□ 2.86
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP32.91■■■□□ 2.86
CAPNS1-217ENST00000629983 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP32.9■■■□□ 2.86
CAPNS1-217ENST00000629983 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP32.9■■■□□ 2.86
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa32.9■■■□□ 2.86
CAPNS1-217ENST00000629983 ROBO3Q96MS0 1386 aa32.9■■■□□ 2.86
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC4A3P48751 1232 aa32.89■■■□□ 2.86
CAPNS1-217ENST00000629983 NUP133Q8WUM0 1156 aa32.89■■■□□ 2.86
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP32.89■■■□□ 2.86
CAPNS1-217ENST00000629983 ADAMTS4O75173 837 aa32.88■■■□□ 2.85
CAPNS1-217ENST00000629983 HMMRO75330 724 aa32.88■■■□□ 2.85
CAPNS1-217ENST00000629983 DNAJB2P25686 324 aa32.88■■■□□ 2.85
CAPNS1-217ENST00000629983 ACLYP53396 1101 aa32.88■■■□□ 2.85
CAPNS1-217ENST00000629983 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP32.88■■■□□ 2.85
CAPNS1-217ENST00000629983 DDX11Q96FC9 970 aa32.88■■■□□ 2.85
CAPNS1-217ENST00000629983 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP32.88■■■□□ 2.85
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM184BQ9ULE4 1060 aa32.88■■■□□ 2.85
CAPNS1-217ENST00000629983 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa32.87■■■□□ 2.85
CAPNS1-217ENST00000629983 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP32.87■■■□□ 2.85
CAPNS1-217ENST00000629983 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP32.87■■■□□ 2.85
CAPNS1-217ENST00000629983 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP32.87■■■□□ 2.85
CAPNS1-217ENST00000629983 FAAP100Q0VG06 881 aa32.86■■■□□ 2.85
CAPNS1-217ENST00000629983 GRIN2CQ14957 1233 aa32.86■■■□□ 2.85
CAPNS1-217ENST00000629983 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP32.86■■■□□ 2.85
CAPNS1-217ENST00000629983 SLF1Q9BQI6 1058 aa32.86■■■□□ 2.85
CAPNS1-217ENST00000629983 TEX13BQ9BXU2 312 aa32.86■■■□□ 2.85
CAPNS1-217ENST00000629983 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP32.86■■■□□ 2.85
CAPNS1-217ENST00000629983 CHGBP05060 677 aa32.85■■■□□ 2.85
CAPNS1-217ENST00000629983 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa32.85■■■□□ 2.85
CAPNS1-217ENST00000629983 REPS2Q8NFH8 660 aa32.85■■■□□ 2.85
CAPNS1-217ENST00000629983 TOX2Q96NM4 488 aa32.85■■■□□ 2.85
CAPNS1-217ENST00000629983 PRDM6Q9NQX0 595 aa32.85■■■□□ 2.85
CAPNS1-217ENST00000629983 MOXD2PA6NHM9 499 aa32.84■■■□□ 2.85
CAPNS1-217ENST00000629983 KCNA10Q16322 511 aa32.84■■■□□ 2.85
CAPNS1-217ENST00000629983 CTR9Q6PD62 1173 aa32.84■■■□□ 2.85
CAPNS1-217ENST00000629983 VTI1AQ96AJ9 217 aa32.84■■■□□ 2.85
CAPNS1-217ENST00000629983 RAB11FIP3O75154 756 aa32.83■■■□□ 2.85
CAPNS1-217ENST00000629983 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP32.83■■■□□ 2.85
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