RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617158.4

CSAG3-202, Transcript of CSAG family member 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG3, Length 789 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG3-202ENST00000617158 TMTC3Q6ZXV5 915 aa24.4■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 DCAF4Q8WV16 495 aa24.4■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 WNK4Q96J92 1243 aa24.4■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 C12orf42Q96LP6 360 aa24.4■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 FEZ1Q99689 392 aa24.4■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 CPVLQ9H3G5 476 aa24.4■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 TLL2Q9Y6L7 1015 aa24.4■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 BECN1Q14457 450 aa24.39■■□□□ 1.49
CSAG3-202ENST00000617158 KCTD1Q719H9 257 aa24.39■■□□□ 1.49
CSAG3-202ENST00000617158 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
CSAG3-202ENST00000617158 SH2D4AQ9H788 454 aa24.39■■□□□ 1.49
CSAG3-202ENST00000617158 GOPCQ9HD26 462 aa24.39■■□□□ 1.49
CSAG3-202ENST00000617158 GPCPD1Q9NPB8 672 aa24.39■■□□□ 1.49
CSAG3-202ENST00000617158 PARP14Q460N5 1801 aa24.39■■□□□ 1.49
CSAG3-202ENST00000617158 RLFQ13129 1914 aa24.39■■□□□ 1.49
CSAG3-202ENST00000617158 CYTH3O43739 400 aa24.38■■□□□ 1.49
CSAG3-202ENST00000617158 JAK2O60674 1132 aa24.38■■□□□ 1.49
CSAG3-202ENST00000617158 PPFIA3O75145 1194 aa24.38■■□□□ 1.49
CSAG3-202ENST00000617158 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
CSAG3-202ENST00000617158 HMGCS2P54868 508 aa24.38■■□□□ 1.49
CSAG3-202ENST00000617158 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
CSAG3-202ENST00000617158 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
CSAG3-202ENST00000617158 TMEM88BA6NKF7 163 aa24.37■■□□□ 1.49
CSAG3-202ENST00000617158 C19orf81C9J6K1 198 aa24.37■■□□□ 1.49
CSAG3-202ENST00000617158 CXCL11O14625 94 aa24.37■■□□□ 1.49
CSAG3-202ENST00000617158 ASPRV1Q53RT3 343 aa24.37■■□□□ 1.49
CSAG3-202ENST00000617158 FAM83BQ5T0W9 1011 aa24.37■■□□□ 1.49
CSAG3-202ENST00000617158 SPRYD7Q5W111 196 aa24.37■■□□□ 1.49
CSAG3-202ENST00000617158 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
CSAG3-202ENST00000617158 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa24.37■■□□□ 1.49
CSAG3-202ENST00000617158 UBA5Q9GZZ9 404 aa24.37■■□□□ 1.49
CSAG3-202ENST00000617158 FOXD4L1Q9NU39 408 aa24.37■■□□□ 1.49
CSAG3-202ENST00000617158 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa24.36■■□□□ 1.49
CSAG3-202ENST00000617158 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
CSAG3-202ENST00000617158 KLRF2D3W0D1 207 aa24.36■■□□□ 1.49
CSAG3-202ENST00000617158 RAD21O60216 631 aa24.36■■□□□ 1.49
CSAG3-202ENST00000617158 BMP3P12645 472 aa24.36■■□□□ 1.49
CSAG3-202ENST00000617158 FDPSP14324 419 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
CSAG3-202ENST00000617158 IFNAR1P17181 557 aa24.36■■□□□ 1.49
CSAG3-202ENST00000617158 VCAM1P19320 739 aa24.36■■□□□ 1.49
CSAG3-202ENST00000617158 SLC1A4P43007 532 aa24.36■■□□□ 1.49
CSAG3-202ENST00000617158 PPP2R5BQ15173 497 aa24.36■■□□□ 1.49
CSAG3-202ENST00000617158 RASAL3Q86YV0 1011 aa24.36■■□□□ 1.49
CSAG3-202ENST00000617158 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa24.36■■□□□ 1.49
CSAG3-202ENST00000617158 MS4A4AQ96JQ5 239 aa24.36■■□□□ 1.49
CSAG3-202ENST00000617158 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
CSAG3-202ENST00000617158 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
CSAG3-202ENST00000617158 KIF5BP33176 963 aa24.35■■□□□ 1.49
CSAG3-202ENST00000617158 USP14P54578 494 aa24.35■■□□□ 1.49
CSAG3-202ENST00000617158 CCDC96Q2M329 555 aa24.35■■□□□ 1.49
CSAG3-202ENST00000617158 LPAR1Q92633 364 aa24.35■■□□□ 1.49
CSAG3-202ENST00000617158 PHKBQ93100 1093 aa24.35■■□□□ 1.49
CSAG3-202ENST00000617158 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
CSAG3-202ENST00000617158 SLC16A2P36021 539 aa24.34■■□□□ 1.49
CSAG3-202ENST00000617158 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
CSAG3-202ENST00000617158 RGMBQ6NW40 437 aa24.34■■□□□ 1.49
CSAG3-202ENST00000617158 BTNL9Q6UXG8 535 aa24.34■■□□□ 1.49
CSAG3-202ENST00000617158 CCDC82Q8N4S0 544 aa24.34■■□□□ 1.49
CSAG3-202ENST00000617158 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
CSAG3-202ENST00000617158 FBXO28Q9NVF7 368 aa24.34■■□□□ 1.49
CSAG3-202ENST00000617158 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa24.33■■□□□ 1.49
CSAG3-202ENST00000617158 PTPDC1A2A3K4 754 aa24.33■■□□□ 1.49
CSAG3-202ENST00000617158 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
CSAG3-202ENST00000617158 WDR46O15213 610 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
CSAG3-202ENST00000617158 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
CSAG3-202ENST00000617158 TREML2Q5T2D2 321 aa24.33■■□□□ 1.49
CSAG3-202ENST00000617158 GPAT2Q6NUI2 795 aa24.33■■□□□ 1.49
CSAG3-202ENST00000617158 SPZ1Q9BXG8 430 aa24.33■■□□□ 1.49
CSAG3-202ENST00000617158 RIOX1Q9H6W3 641 aa24.33■■□□□ 1.49
CSAG3-202ENST00000617158 MYH6P13533 1939 aa24.33■■□□□ 1.49
CSAG3-202ENST00000617158 TMEM232C9JQI7 657 aa24.32■■□□□ 1.48
CSAG3-202ENST00000617158 SMARCA1P28370 1054 aa24.32■■□□□ 1.48
CSAG3-202ENST00000617158 MTMR8Q96EF0 704 aa24.32■■□□□ 1.48
CSAG3-202ENST00000617158 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
CSAG3-202ENST00000617158 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa24.31■■□□□ 1.48
CSAG3-202ENST00000617158 PLA2G6O60733 806 aa24.31■■□□□ 1.48
CSAG3-202ENST00000617158 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
CSAG3-202ENST00000617158 SLC10A3P09131 477 aa24.31■■□□□ 1.48
CSAG3-202ENST00000617158 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
CSAG3-202ENST00000617158 GNAQP50148 359 aa24.31■■□□□ 1.48
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
CSAG3-202ENST00000617158 PKN1Q16512 942 aa24.31■■□□□ 1.48
CSAG3-202ENST00000617158 DDX11Q96FC9 970 aa24.31■■□□□ 1.48
CSAG3-202ENST00000617158 LZTS2Q9BRK4 669 aa24.31■■□□□ 1.48
CSAG3-202ENST00000617158 JMJD4Q9H9V9 463 aa24.31■■□□□ 1.48
CSAG3-202ENST00000617158 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
CSAG3-202ENST00000617158 CPLX1O14810 134 aa24.3■■□□□ 1.48
CSAG3-202ENST00000617158 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
CSAG3-202ENST00000617158 APLP1P51693 650 aa24.3■■□□□ 1.48
CSAG3-202ENST00000617158 SNAPC2Q13487 334 aa24.3■■□□□ 1.48
CSAG3-202ENST00000617158 ADGRF4Q8IZF3 695 aa24.3■■□□□ 1.48
CSAG3-202ENST00000617158 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
CSAG3-202ENST00000617158 BRI3BPQ8WY22 251 aa24.3■■□□□ 1.48
CSAG3-202ENST00000617158 SHISA4Q96DD7 197 aa24.3■■□□□ 1.48
CSAG3-202ENST00000617158 HHIPL1Q96JK4 782 aa24.3■■□□□ 1.48
CSAG3-202ENST00000617158 AIFM3Q96NN9 605 aa24.3■■□□□ 1.48
CSAG3-202ENST00000617158 TMOD4Q9NZQ9 345 aa24.3■■□□□ 1.48
CSAG3-202ENST00000617158 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
CSAG3-202ENST00000617158 DDIT3P35638 169 aa24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms