RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609525.1

CSNK2A1-208, Transcript of casein kinase 2 alpha 1, human

TSL 5

Gene CSNK2A1, Length 581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NOTO	A8MTQ0	251 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CHMP4BP1	P59074	171 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RNF111	Q6ZNA4	994 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CSNK2A1-208	ENST00000609525	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PHC3	Q8NDX5	983 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KLHL3	Q9UH77	587 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NRDC	O43847	1150 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CILP	O75339	1184 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PHACTR4	Q8IZ21	702 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	N4BP3	O15049	544 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	EFEMP2	O95967	443 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	VIPR1	P32241	457 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KIR2DL1	P43626	348 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	EPHB3	P54753	998 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MAP6	Q96JE9	813 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CNTD2	Q9H8S5	307 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RNF19A	Q9NV58	838 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ARHGEF11	O15085	1522 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CELA3B	P08861	270 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GBP1	P32455	592 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FAM221A	A4D161	298 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	F13A1	P00488	732 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PNLIP	P16233	465 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LMNB2	Q03252	620 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KIF2C	Q99661	725 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	HDAC8	Q9BY41	377 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ABLIM1	O14639	778 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	HTR3B	O95264	441 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SDHB	P21912	280 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	YBX1	P67809	324 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	VMAC	Q2NL98	169 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SP8	Q8IXZ3	490 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	VWCE	Q96DN2	955 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TCFL5	Q9UL49	500 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GRIN3B	O60391	1043 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RNF4	P78317	190 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KCNA1	Q09470	495 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CSNK2A1-208	ENST00000609525	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZNF655	Q8N720	491 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MZB1	Q8WU39	189 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TCTN2	Q96GX1	697 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CSNK2A1-208	ENST00000609525	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CSNK2A1-208	ENST00000609525		F6X3S4	739 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CSNK2A1-208	ENST00000609525	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PF4	P02776	101 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CDR1	P51861	262 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RTP1	P59025	263 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CSNK2A1-208	ENST00000609525	BORCS6	Q96GS4	357 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TMEM82	A0PJX8	343 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RGS13	O14921	159 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FKTN	O75072	461 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MPO	P05164	745 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CSNK2A1-208	ENST00000609525	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DNAJA2	O60884	412 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SYP	P08247	313 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ADRB1	P08588	477 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ARL4A	P40617	200 aa		7.3	□□□□□ -1.24

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