RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600676.5

FCHO1-234, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene FCHO1, Length 3,094 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-234ENST00000600676 HLA-DOAP06340 250 aa14.55□□□□□ -0.08
FCHO1-234ENST00000600676 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
FCHO1-234ENST00000600676 PNOCQ13519 176 aa14.55□□□□□ -0.08
FCHO1-234ENST00000600676 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
FCHO1-234ENST00000600676 CNNM3Q8NE01 707 aa14.55□□□□□ -0.08
FCHO1-234ENST00000600676 SUPT20HQ8NEM7 779 aa14.55□□□□□ -0.08
FCHO1-234ENST00000600676 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
FCHO1-234ENST00000600676 MYO3BQ8WXR4 1341 aa14.55□□□□□ -0.08
FCHO1-234ENST00000600676 MYH4Q9Y623 1939 aa14.55□□□□□ -0.08
FCHO1-234ENST00000600676 USP17L5A8MUK1 530 aa14.55□□□□□ -0.08
FCHO1-234ENST00000600676 STXBP3O00186 592 aa14.55□□□□□ -0.08
FCHO1-234ENST00000600676 PPIP5K2O43314 1243 aa14.55□□□□□ -0.08
FCHO1-234ENST00000600676 EIF6P56537 245 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
FCHO1-234ENST00000600676 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
FCHO1-234ENST00000600676 BARHL2Q9NY43 387 aa14.55□□□□□ -0.08
FCHO1-234ENST00000600676 BMP15O95972 392 aa14.54□□□□□ -0.08
FCHO1-234ENST00000600676 SLURP2P0DP57 97 aa14.54□□□□□ -0.08
FCHO1-234ENST00000600676 NLRP12P59046 1061 aa14.54□□□□□ -0.08
FCHO1-234ENST00000600676 TCP10Q12799 353 aa14.54□□□□□ -0.08
FCHO1-234ENST00000600676 USP49Q70CQ1 688 aa14.54□□□□□ -0.08
FCHO1-234ENST00000600676 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP14.54□□□□□ -0.08
FCHO1-234ENST00000600676 YDJCA8MPS7 323 aa14.54□□□□□ -0.08
FCHO1-234ENST00000600676 BECN2A8MW95 431 aa14.54□□□□□ -0.08
FCHO1-234ENST00000600676 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
FCHO1-234ENST00000600676 AOPEPQ8N6M6 819 aa14.54□□□□□ -0.08
FCHO1-234ENST00000600676 CCDC148Q8NFR7 591 aa14.54□□□□□ -0.08
FCHO1-234ENST00000600676 RASGRP4Q8TDF6 673 aa14.54□□□□□ -0.08
FCHO1-234ENST00000600676 TUBE1Q9UJT0 475 aa14.54□□□□□ -0.08
FCHO1-234ENST00000600676 SERPINA10Q9UK55 444 aa14.54□□□□□ -0.08
FCHO1-234ENST00000600676 M0R2N6 131 aa14.53□□□□□ -0.08
FCHO1-234ENST00000600676 PDHBP11177 359 aa14.53□□□□□ -0.08
FCHO1-234ENST00000600676 TRAPPC10P48553 1259 aa14.53□□□□□ -0.08
FCHO1-234ENST00000600676 SPC24Q8NBT2 197 aa14.53□□□□□ -0.08
FCHO1-234ENST00000600676 TRIM5Q9C035 493 aa14.53□□□□□ -0.08
FCHO1-234ENST00000600676 EHD4Q9H223 541 aa14.53□□□□□ -0.08
FCHO1-234ENST00000600676 FAM198AQ9UFP1 575 aa14.53□□□□□ -0.08
FCHO1-234ENST00000600676 ZNF75DP51815 510 aa14.53□□□□□ -0.08
FCHO1-234ENST00000600676 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
FCHO1-234ENST00000600676 PTGDRQ13258 359 aa14.53□□□□□ -0.08
FCHO1-234ENST00000600676 PLA2G4DQ86XP0 818 aa14.53□□□□□ -0.08
FCHO1-234ENST00000600676 HOMER1Q86YM7 354 aa14.53□□□□□ -0.08
FCHO1-234ENST00000600676 TTLL6Q8N841 843 aa14.53□□□□□ -0.08
FCHO1-234ENST00000600676 FERMT2Q96AC1 680 aa14.53□□□□□ -0.08
FCHO1-234ENST00000600676 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
FCHO1-234ENST00000600676 FOXN1O15353 648 aa14.52□□□□□ -0.08
FCHO1-234ENST00000600676 TTLL1O95922 423 aa14.52□□□□□ -0.08
FCHO1-234ENST00000600676 ISM2Q6H9L7 571 aa14.52□□□□□ -0.08
FCHO1-234ENST00000600676 DAGLBQ8NCG7 672 aa14.52□□□□□ -0.08
FCHO1-234ENST00000600676 IDI2Q9BXS1 227 aa14.52□□□□□ -0.08
FCHO1-234ENST00000600676 DNAJC18Q9H819 358 aa14.52□□□□□ -0.08
FCHO1-234ENST00000600676 CLIP2Q9UDT6 1046 aa14.52□□□□□ -0.08
FCHO1-234ENST00000600676 MCM7P33993 719 aa14.52□□□□□ -0.08
FCHO1-234ENST00000600676 PDILTQ8N807 584 aa14.52□□□□□ -0.08
FCHO1-234ENST00000600676 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
FCHO1-234ENST00000600676 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
FCHO1-234ENST00000600676 BPIFA3Q9BQP9 254 aa14.52□□□□□ -0.08
FCHO1-234ENST00000600676 SERTAD1Q9UHV2 236 aa14.52□□□□□ -0.08
FCHO1-234ENST00000600676 PCDHA6Q9UN73 950 aa14.52□□□□□ -0.08
FCHO1-234ENST00000600676 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa14.52□□□□□ -0.08
FCHO1-234ENST00000600676 KIF13BQ9NQT8 1826 aa14.52□□□□□ -0.09
FCHO1-234ENST00000600676 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
FCHO1-234ENST00000600676 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
FCHO1-234ENST00000600676 SMARCA1P28370 1054 aa14.52□□□□□ -0.09
FCHO1-234ENST00000600676 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
FCHO1-234ENST00000600676 GALNT17Q6IS24 598 aa14.52□□□□□ -0.09
FCHO1-234ENST00000600676 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
FCHO1-234ENST00000600676 EPSTI1Q96J88 318 aa14.52□□□□□ -0.09
FCHO1-234ENST00000600676 UBA5Q9GZZ9 404 aa14.52□□□□□ -0.09
FCHO1-234ENST00000600676 VAT1LQ9HCJ6 419 aa14.52□□□□□ -0.09
FCHO1-234ENST00000600676 FAM196BA6NMK8 535 aa14.51□□□□□ -0.09
FCHO1-234ENST00000600676 CCDC93Q567U6 631 aa14.51□□□□□ -0.09
FCHO1-234ENST00000600676 SARM1Q6SZW1 724 aa14.51□□□□□ -0.09
FCHO1-234ENST00000600676 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
FCHO1-234ENST00000600676 PIGSQ96S52 555 aa14.51□□□□□ -0.09
FCHO1-234ENST00000600676 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
FCHO1-234ENST00000600676 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
FCHO1-234ENST00000600676 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa14.51□□□□□ -0.09
FCHO1-234ENST00000600676 VWA3AA6NCI4 1184 aa14.51□□□□□ -0.09
FCHO1-234ENST00000600676 SNHG28P0DPA3 235 aa14.51□□□□□ -0.09
FCHO1-234ENST00000600676 DPEP1P16444 411 aa14.51□□□□□ -0.09
FCHO1-234ENST00000600676 KCNA3P22001 575 aa14.51□□□□□ -0.09
FCHO1-234ENST00000600676 NAPAP54920 295 aa14.51□□□□□ -0.09
FCHO1-234ENST00000600676 ASPRV1Q53RT3 343 aa14.51□□□□□ -0.09
FCHO1-234ENST00000600676 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa14.51□□□□□ -0.09
FCHO1-234ENST00000600676 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
FCHO1-234ENST00000600676 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
FCHO1-234ENST00000600676 A0A087X0B3 334 aa14.5□□□□□ -0.09
FCHO1-234ENST00000600676 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
FCHO1-234ENST00000600676 POSTNQ15063 836 aa14.5□□□□□ -0.09
FCHO1-234ENST00000600676 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
FCHO1-234ENST00000600676 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
FCHO1-234ENST00000600676 ZMYND12Q9H0C1 365 aa14.5□□□□□ -0.09
FCHO1-234ENST00000600676 RIOX1Q9H6W3 641 aa14.5□□□□□ -0.09
FCHO1-234ENST00000600676 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
FCHO1-234ENST00000600676 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa14.5□□□□□ -0.09
FCHO1-234ENST00000600676 COL4A5P29400 1685 aa14.5□□□□□ -0.09
FCHO1-234ENST00000600676 CFAP100Q494V2 611 aa14.5□□□□□ -0.09
FCHO1-234ENST00000600676 RTKN2Q8IZC4 609 aa14.5□□□□□ -0.09
FCHO1-234ENST00000600676 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
FCHO1-234ENST00000600676 PI4KBQ9UBF8 816 aa14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms