RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592326.1

USP36-223, Transcript of ubiquitin specific peptidase 36, human

TSL 5

Gene USP36, Length 406 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP36-223	ENST00000592326	UBE3C	Q15386	1083 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USP36-223	ENST00000592326	TRIM60	Q495X7	471 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USP36-223	ENST00000592326	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USP36-223	ENST00000592326	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USP36-223	ENST00000592326	MAML3	Q96JK9	1138 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USP36-223	ENST00000592326	HAUS7	Q99871	368 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USP36-223	ENST00000592326	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USP36-223	ENST00000592326	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USP36-223	ENST00000592326	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USP36-223	ENST00000592326	SMIM22	K7EJ46	135 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USP36-223	ENST00000592326	CHGB	P05060	677 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USP36-223	ENST00000592326	PGK2	P07205	417 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USP36-223	ENST00000592326	RARB	P10826	455 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USP36-223	ENST00000592326	STAT3	P40763	770 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USP36-223	ENST00000592326	LRRC41	Q15345	812 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USP36-223	ENST00000592326	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USP36-223	ENST00000592326	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USP36-223	ENST00000592326	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USP36-223	ENST00000592326	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
USP36-223	ENST00000592326	CEP290	O15078	2479 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USP36-223	ENST00000592326	IGHA2	P01877	340 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USP36-223	ENST00000592326	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USP36-223	ENST00000592326	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USP36-223	ENST00000592326	CTR9	Q6PD62	1173 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USP36-223	ENST00000592326	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USP36-223	ENST00000592326	BAD	Q92934	168 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USP36-223	ENST00000592326	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USP36-223	ENST00000592326	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USP36-223	ENST00000592326	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USP36-223	ENST00000592326	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
USP36-223	ENST00000592326	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USP36-223	ENST00000592326	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
USP36-223	ENST00000592326	SHH	Q15465	462 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USP36-223	ENST00000592326	RNF180	Q86T96	592 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USP36-223	ENST00000592326	TINF2	Q9BSI4	451 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USP36-223	ENST00000592326	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
USP36-223	ENST00000592326	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USP36-223	ENST00000592326	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USP36-223	ENST00000592326	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USP36-223	ENST00000592326	VWA5A	O00534	786 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	PGK1	P00558	417 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	COPB2	P35606	906 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	DDX11	Q96FC9	970 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	POTEB2	H3BUK9	544 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	APP	P05067	770 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	NEFL	P07196	543 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	AKR1A1	P14550	325 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	TLE2	Q04725	743 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	CPXCR1	Q8N123	301 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	GPATCH3	Q96I76	525 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	GUCD1	Q96NT3	240 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	CRBN	Q96SW2	442 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	PHF24	Q9UPV7	400 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	ZBED4	O75132	1171 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	CLTB	P09497	229 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	AAMP	Q13685	434 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	SNX17	Q15036	470 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	13.5	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		13.49	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326		F5H6K3	240 aa		13.49	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	RAG1	P15918	1043 aa		13.49	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	TDO2	P48775	406 aa		13.49	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	KLRC3	Q07444	240 aa		13.49	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	SBK1	Q52WX2	424 aa		13.49	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		13.49	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	KIFC2	Q96AC6	838 aa		13.49	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		13.49	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		13.49	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		13.49	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		13.49	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		13.49	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	NYAP2	Q9P242	653 aa		13.49	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		13.49	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		13.48	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326		A0A1W2PQY0	241 aa		13.48	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	NDUFB10	O96000	172 aa		13.48	□□□□□ -0.25

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