RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581525.1

SNORD55-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 55, humanhuman

BASIC

Gene SNORD55, Length 80 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD55-201ENST00000581525 PRKCZQ05513 592 aa14.92□□□□□ -0.02
SNORD55-201ENST00000581525 CCDC178Q5BJE1 867 aa14.92□□□□□ -0.02
SNORD55-201ENST00000581525 MORN1Q5T089 497 aa14.92□□□□□ -0.02
SNORD55-201ENST00000581525 FAM83BQ5T0W9 1011 aa14.92□□□□□ -0.02
SNORD55-201ENST00000581525 DGKHQ86XP1 1220 aa14.92□□□□□ -0.02
SNORD55-201ENST00000581525 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SNORD55-201ENST00000581525 ZNF333Q96JL9 665 aa14.92□□□□□ -0.02
SNORD55-201ENST00000581525 TANGO6Q9C0B7 1094 aa14.92□□□□□ -0.02
SNORD55-201ENST00000581525 PORCNQ9H237 461 aa14.92□□□□□ -0.02
SNORD55-201ENST00000581525 CNNM2Q9H8M5 875 aa14.92□□□□□ -0.02
SNORD55-201ENST00000581525 ZSWIM5Q9P217 1185 aa14.92□□□□□ -0.02
SNORD55-201ENST00000581525 VWA5AO00534 786 aa14.91□□□□□ -0.02
SNORD55-201ENST00000581525 FLOT1O75955 427 aa14.91□□□□□ -0.02
SNORD55-201ENST00000581525 IGHA2P01877 340 aa14.91□□□□□ -0.02
SNORD55-201ENST00000581525 SNHG28P0DPA3 235 aa14.91□□□□□ -0.02
SNORD55-201ENST00000581525 FDX1P10109 184 aa14.91□□□□□ -0.02
SNORD55-201ENST00000581525 TOP1P11387 765 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SNORD55-201ENST00000581525 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SNORD55-201ENST00000581525 FLT3LGP49771 235 aa14.91□□□□□ -0.02
SNORD55-201ENST00000581525 NECTIN1Q15223 517 aa14.91□□□□□ -0.02
SNORD55-201ENST00000581525 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP14.91□□□□□ -0.02
SNORD55-201ENST00000581525 NBPF11Q86T75 865 aa14.91□□□□□ -0.02
SNORD55-201ENST00000581525 ATG4CQ96DT6 458 aa14.91□□□□□ -0.02
SNORD55-201ENST00000581525 KRT23Q9C075 422 aa14.91□□□□□ -0.02
SNORD55-201ENST00000581525 SPATC1LQ9H0A9 340 aa14.91□□□□□ -0.02
SNORD55-201ENST00000581525 FBXO28Q9NVF7 368 aa14.91□□□□□ -0.02
SNORD55-201ENST00000581525 FEM1BQ9UK73 627 aa14.91□□□□□ -0.02
SNORD55-201ENST00000581525 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa14.91□□□□□ -0.02
SNORD55-201ENST00000581525 MGAMO43451 1857 aa14.91□□□□□ -0.02
SNORD55-201ENST00000581525 BRCA2P51587 3418 aa14.91□□□□□ -0.02
SNORD55-201ENST00000581525 A0A0G2JMZ2 1700 aa14.9□□□□□ -0.02
SNORD55-201ENST00000581525 STRNO43815 780 aa14.9□□□□□ -0.02
SNORD55-201ENST00000581525 BMP3P12645 472 aa14.9□□□□□ -0.02
SNORD55-201ENST00000581525 TMEM132BQ14DG7 1078 aa14.9□□□□□ -0.02
SNORD55-201ENST00000581525 SLFN13Q68D06 897 aa14.9□□□□□ -0.02
SNORD55-201ENST00000581525 BTNL9Q6UXG8 535 aa14.9□□□□□ -0.02
SNORD55-201ENST00000581525 GPR142Q7Z601 462 aa14.9□□□□□ -0.02
SNORD55-201ENST00000581525 PLEKHH3Q7Z736 793 aa14.9□□□□□ -0.02
SNORD55-201ENST00000581525 TMEM47Q9BQJ4 181 aa14.9□□□□□ -0.02
SNORD55-201ENST00000581525 PAGR1Q9BTK6 254 aa14.9□□□□□ -0.02
SNORD55-201ENST00000581525 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SNORD55-201ENST00000581525 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
SNORD55-201ENST00000581525 STX8Q9UNK0 236 aa14.9□□□□□ -0.02
SNORD55-201ENST00000581525 LAMA4Q16363 1823 aa14.89□□□□□ -0.03
SNORD55-201ENST00000581525 SLC25A27O95847 323 aa14.89□□□□□ -0.03
SNORD55-201ENST00000581525 HOXC6P09630 235 aa14.89□□□□□ -0.03
SNORD55-201ENST00000581525 PTPREP23469 700 aa14.89□□□□□ -0.03
SNORD55-201ENST00000581525 GRK4P32298 578 aa14.89□□□□□ -0.03
SNORD55-201ENST00000581525 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SNORD55-201ENST00000581525 RIOX2Q8IUF8 465 aa14.89□□□□□ -0.03
SNORD55-201ENST00000581525 ABRAQ8N0Z2 381 aa14.89□□□□□ -0.03
SNORD55-201ENST00000581525 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SNORD55-201ENST00000581525 SLAIN1Q8ND83 568 aa14.89□□□□□ -0.03
SNORD55-201ENST00000581525 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SNORD55-201ENST00000581525 SLF1Q9BQI6 1058 aa14.89□□□□□ -0.03
SNORD55-201ENST00000581525 TOMM22Q9NS69 142 aa14.89□□□□□ -0.03
SNORD55-201ENST00000581525 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SNORD55-201ENST00000581525 DOCK3Q8IZD9 2030 aa14.88□□□□□ -0.03
SNORD55-201ENST00000581525 PARP14Q460N5 1801 aa14.88□□□□□ -0.03
SNORD55-201ENST00000581525 SLC15A5A6NIM6 579 aa14.88□□□□□ -0.03
SNORD55-201ENST00000581525 CCDC85CA6NKD9 419 aa14.88□□□□□ -0.03
SNORD55-201ENST00000581525 B4E1Z4 1266 aa14.88□□□□□ -0.03
SNORD55-201ENST00000581525 KDM4AO75164 1064 aa14.88□□□□□ -0.03
SNORD55-201ENST00000581525 CDC45O75419 566 aa14.88□□□□□ -0.03
SNORD55-201ENST00000581525 MCCP23508 829 aa14.88□□□□□ -0.03
SNORD55-201ENST00000581525 GRB14Q14449 540 aa14.88□□□□□ -0.03
SNORD55-201ENST00000581525 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa14.88□□□□□ -0.03
SNORD55-201ENST00000581525 FAM160B2Q86V87 743 aa14.88□□□□□ -0.03
SNORD55-201ENST00000581525 IQCA1Q86XH1 822 aa14.88□□□□□ -0.03
SNORD55-201ENST00000581525 RAET1EQ8TD07 263 aa14.88□□□□□ -0.03
SNORD55-201ENST00000581525 CHURC1Q8WUH1 139 aa14.88□□□□□ -0.03
SNORD55-201ENST00000581525 DCAF4Q8WV16 495 aa14.88□□□□□ -0.03
SNORD55-201ENST00000581525 SOCS4Q8WXH5 440 aa14.88□□□□□ -0.03
SNORD55-201ENST00000581525 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
SNORD55-201ENST00000581525 NUDT12Q9BQG2 462 aa14.88□□□□□ -0.03
SNORD55-201ENST00000581525 MROH8Q9H579 483 aa14.88□□□□□ -0.03
SNORD55-201ENST00000581525 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa14.88□□□□□ -0.03
SNORD55-201ENST00000581525 MYH4Q9Y623 1939 aa14.88□□□□□ -0.03
SNORD55-201ENST00000581525 E7EWF7 191 aa14.87□□□□□ -0.03
SNORD55-201ENST00000581525 ADCY3O60266 1144 aa14.87□□□□□ -0.03
SNORD55-201ENST00000581525 CAPN2P17655 700 aa14.87□□□□□ -0.03
SNORD55-201ENST00000581525 STAT3P40763 770 aa14.87□□□□□ -0.03
SNORD55-201ENST00000581525 OAZ1P54368 228 aa14.87□□□□□ -0.03
SNORD55-201ENST00000581525 SEC23AQ15436 765 aa14.87□□□□□ -0.03
SNORD55-201ENST00000581525 TSGA10IPQ3SY00 556 aa14.87□□□□□ -0.03
SNORD55-201ENST00000581525 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa14.87□□□□□ -0.03
SNORD55-201ENST00000581525 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SNORD55-201ENST00000581525 MTA3Q9BTC8 594 aa14.87□□□□□ -0.03
SNORD55-201ENST00000581525 TAF6LQ9Y6J9 622 aa14.87□□□□□ -0.03
SNORD55-201ENST00000581525 PLXNB2O15031 1838 aa14.87□□□□□ -0.03
SNORD55-201ENST00000581525 TMEM232C9JQI7 657 aa14.86□□□□□ -0.03
SNORD55-201ENST00000581525 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
SNORD55-201ENST00000581525 PDHBP11177 359 aa14.86□□□□□ -0.03
SNORD55-201ENST00000581525 ERCC3P19447 782 aa14.86□□□□□ -0.03
SNORD55-201ENST00000581525 COPB2P35606 906 aa14.86□□□□□ -0.03
SNORD55-201ENST00000581525 SLC1A4P43007 532 aa14.86□□□□□ -0.03
SNORD55-201ENST00000581525 STAT2P52630 851 aa14.86□□□□□ -0.03
SNORD55-201ENST00000581525 MAP2K5Q13163 448 aa14.86□□□□□ -0.03
SNORD55-201ENST00000581525 STOX1Q6ZVD7 989 aa14.86□□□□□ -0.03
SNORD55-201ENST00000581525 CYB5R4Q7L1T6 521 aa14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 137.5 ms