RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578025.5

TSPOAP1-AS1-201, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,229 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CCDC150Q8NCX0 1101 aa27.52■■■□□ 2
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TUBE1Q9UJT0 475 aa27.51■■□□□ 1.99
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CUTAO60888 179 aa27.51■■□□□ 1.99
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SCG2P13521 617 aa27.51■■□□□ 1.99
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SYKP43405 635 aa27.51■■□□□ 1.99
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 BRMS1Q9HCU9 246 aa27.5■■□□□ 1.99
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SLX4Q8IY92 1834 aa27.5■■□□□ 1.99
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 QSER1Q2KHR3 1735 aa27.5■■□□□ 1.99
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GRM4Q14833 912 aa27.49■■□□□ 1.99
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RESP18Q5W5W9 173 aa27.49■■□□□ 1.99
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa27.49■■□□□ 1.99
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa27.49■■□□□ 1.99
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KCNJ6P48051 423 aa27.49■■□□□ 1.99
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TPM4P67936 248 aa27.48■■□□□ 1.99
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NPY5RQ15761 445 aa27.48■■□□□ 1.99
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SPECC1Q5M775 1068 aa27.48■■□□□ 1.99
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa27.48■■□□□ 1.99
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NEDD1Q8NHV4 660 aa27.47■■□□□ 1.99
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ERO1AQ96HE7 468 aa27.47■■□□□ 1.99
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NLRP5P59047 1200 aa27.47■■□□□ 1.99
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FANCCQ00597 558 aa27.47■■□□□ 1.99
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GRIN1Q05586 938 aa27.47■■□□□ 1.99
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RASGRP2Q7LDG7 609 aa27.47■■□□□ 1.99
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TEKT1Q969V4 418 aa27.47■■□□□ 1.99
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP27.46■■□□□ 1.99
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CEP131Q9UPN4 1083 aa27.46■■□□□ 1.99
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ATP1A3P13637 1013 aa27.45■■□□□ 1.99
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ISM2Q6H9L7 571 aa27.45■■□□□ 1.99
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CNKSR1Q969H4 720 aa27.45■■□□□ 1.99
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TRIM75PA6NK02 468 aa27.45■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP27.45■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CEP95Q96GE4 821 aa27.45■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ECE2O60344 883 aa27.44■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GOLGA8HP0CJ92 632 aa27.44■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PTPREP23469 700 aa27.44■■□□□ 1.98
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa27.44■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KIAA0825Q8IV33 1275 aa27.44■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TNFRSF25Q93038 417 aa27.44■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KCNH3Q9ULD8 1083 aa27.44■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KMT5BQ4FZB7 885 aa27.44■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HHIPL2Q6UWX4 724 aa27.44■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 L2HGDHQ9H9P8 463 aa27.44■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP27.44■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 V9GYY5 206 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP27.43■■□□□ 1.98
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SLC35G1Q2M3R5 365 aa27.43■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP27.43■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 WNT7AO00755 349 aa27.42■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PNOCQ13519 176 aa27.42■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ADAMTS3O15072 1205 aa27.41■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CYTH3O43739 400 aa27.41■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 AOC3Q16853 763 aa27.41■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DPF2Q92785 391 aa27.41■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GABPAQ06546 454 aa27.41■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa27.41■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CPVLQ9H3G5 476 aa27.41■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa27.41■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SCN9AQ15858 1988 aa27.4■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MYL5Q02045 173 aa27.4■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ELF2Q15723 593 aa27.4■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LONRF3Q496Y0 759 aa27.4■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 STRIP1Q5VSL9 837 aa27.4■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KLRF2D3W0D1 207 aa27.4■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TOP1P11387 765 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NFIAQ12857 509 aa27.4■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF174Q15697 407 aa27.4■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CCDC93Q567U6 631 aa27.4■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DACT2Q5SW24 774 aa27.39■■□□□ 1.98
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