RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574099.1

CCDC40-211, Transcript of coiled-coil domain containing 40, humanhuman

TSL 4

Gene CCDC40, Length 537 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC40-211ENST00000574099 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
CCDC40-211ENST00000574099 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
CCDC40-211ENST00000574099 A0A1W2PQY0 241 aa21.22■□□□□ 0.99
CCDC40-211ENST00000574099 AKR1B1P15121 316 aa21.22■□□□□ 0.99
CCDC40-211ENST00000574099 GRIN2CQ14957 1233 aa21.22■□□□□ 0.99
CCDC40-211ENST00000574099 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
CCDC40-211ENST00000574099 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF532Q9HCE3 1301 aa21.22■□□□□ 0.99
CCDC40-211ENST00000574099 TMEM265A0A087WTH1 108 aa21.21■□□□□ 0.99
CCDC40-211ENST00000574099 KIAA0355O15063 1070 aa21.21■□□□□ 0.99
CCDC40-211ENST00000574099 DNAJB2P25686 324 aa21.21■□□□□ 0.99
CCDC40-211ENST00000574099 FPGSQ05932 587 aa21.21■□□□□ 0.99
CCDC40-211ENST00000574099 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
CCDC40-211ENST00000574099 SIAH1Q8IUQ4 282 aa21.21■□□□□ 0.99
CCDC40-211ENST00000574099 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
CCDC40-211ENST00000574099 VCPKMTQ9H867 229 aa21.21■□□□□ 0.99
CCDC40-211ENST00000574099 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa21.21■□□□□ 0.99
CCDC40-211ENST00000574099 TMEM39AQ9NV64 488 aa21.21■□□□□ 0.99
CCDC40-211ENST00000574099 TMX2Q9Y320 296 aa21.21■□□□□ 0.99
CCDC40-211ENST00000574099 WDR46O15213 610 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
CCDC40-211ENST00000574099 SLC25A27O95847 323 aa21.2■□□□□ 0.98
CCDC40-211ENST00000574099 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
CCDC40-211ENST00000574099 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
CCDC40-211ENST00000574099 TINF2Q9BSI4 451 aa21.2■□□□□ 0.98
CCDC40-211ENST00000574099 SH2D4AQ9H788 454 aa21.2■□□□□ 0.98
CCDC40-211ENST00000574099 FBXO28Q9NVF7 368 aa21.2■□□□□ 0.98
CCDC40-211ENST00000574099 SWAP70Q9UH65 585 aa21.2■□□□□ 0.98
CCDC40-211ENST00000574099 SMIM22K7EJ46 135 aa21.19■□□□□ 0.98
CCDC40-211ENST00000574099 KCTD2Q14681 263 aa21.19■□□□□ 0.98
CCDC40-211ENST00000574099 BCL11AQ9H165 835 aa21.19■□□□□ 0.98
CCDC40-211ENST00000574099 ARMT1Q9H993 441 aa21.19■□□□□ 0.98
CCDC40-211ENST00000574099 NRBP1Q9UHY1 535 aa21.19■□□□□ 0.98
CCDC40-211ENST00000574099 GOLIM4O00461 696 aa21.18■□□□□ 0.98
CCDC40-211ENST00000574099 RAD21O60216 631 aa21.18■□□□□ 0.98
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
CCDC40-211ENST00000574099 RLBP1P12271 317 aa21.18■□□□□ 0.98
CCDC40-211ENST00000574099 AKR1A1P14550 325 aa21.18■□□□□ 0.98
CCDC40-211ENST00000574099 FAAP100Q0VG06 881 aa21.18■□□□□ 0.98
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF792Q3KQV3 632 aa21.18■□□□□ 0.98
CCDC40-211ENST00000574099 TJAP1Q5JTD0 557 aa21.18■□□□□ 0.98
CCDC40-211ENST00000574099 CEP85Q6P2H3 762 aa21.18■□□□□ 0.98
CCDC40-211ENST00000574099 STARD7Q9NQZ5 370 aa21.18■□□□□ 0.98
CCDC40-211ENST00000574099 ROBO3Q96MS0 1386 aa21.18■□□□□ 0.98
CCDC40-211ENST00000574099 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa21.17■□□□□ 0.98
CCDC40-211ENST00000574099 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
CCDC40-211ENST00000574099 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
CCDC40-211ENST00000574099 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa21.17■□□□□ 0.98
CCDC40-211ENST00000574099 PRKAB2O43741 272 aa21.17■□□□□ 0.98
CCDC40-211ENST00000574099 ADAMTS4O75173 837 aa21.17■□□□□ 0.98
CCDC40-211ENST00000574099 SLFNL1Q499Z3 407 aa21.17■□□□□ 0.98
CCDC40-211ENST00000574099 ERC1Q8IUD2 1116 aa21.17■□□□□ 0.98
CCDC40-211ENST00000574099 RIOX2Q8IUF8 465 aa21.17■□□□□ 0.98
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF576Q9H609 170 aa21.17■□□□□ 0.98
CCDC40-211ENST00000574099 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa21.16■□□□□ 0.98
CCDC40-211ENST00000574099 ACLYP53396 1101 aa21.16■□□□□ 0.98
CCDC40-211ENST00000574099 PPM1EQ8WY54 764 aa21.16■□□□□ 0.98
CCDC40-211ENST00000574099 TIFAQ96CG3 184 aa21.16■□□□□ 0.98
CCDC40-211ENST00000574099 CNPY2Q9Y2B0 182 aa21.16■□□□□ 0.98
CCDC40-211ENST00000574099 TTC28Q96AY4 2481 aa21.15■□□□□ 0.98
CCDC40-211ENST00000574099 DCDC2CA8MYV0 355 aa21.15■□□□□ 0.98
CCDC40-211ENST00000574099 APBB1O00213 710 aa21.15■□□□□ 0.98
CCDC40-211ENST00000574099 MBD4O95243 580 aa21.15■□□□□ 0.98
CCDC40-211ENST00000574099 EEF2P13639 858 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
CCDC40-211ENST00000574099 STAT3P40763 770 aa21.15■□□□□ 0.98
CCDC40-211ENST00000574099 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP21.15■□□□□ 0.98
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
CCDC40-211ENST00000574099 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa21.15■□□□□ 0.98
CCDC40-211ENST00000574099 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
CCDC40-211ENST00000574099 VWA5AO00534 786 aa21.14■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 CDK8P49336 464 aa21.14■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 FAM83BQ5T0W9 1011 aa21.14■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa21.14■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa21.14■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 MUC3AQ02505 3323 aa21.14■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 MYADML2A6NDP7 307 aa21.13■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 GRXCR1A8MXD5 290 aa21.13■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 TNFRSF10AO00220 468 aa21.13■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 COL9A1P20849 921 aa21.13■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 PBX2P40425 430 aa21.13■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa21.13■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 RHPN1Q8TCX5 695 aa21.13■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 NUP133Q8WUM0 1156 aa21.13■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 CCDC17Q96LX7 622 aa21.13■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 TOX2Q96NM4 488 aa21.13■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 TIMP1P01033 207 aa21.12■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 KCNA10Q16322 511 aa21.12■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 REPS2Q8NFH8 660 aa21.12■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 GOPCQ9HD26 462 aa21.12■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 TBX21Q9UL17 535 aa21.12■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 MCM3APO60318 1980 aa21.11■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 MOXD2PA6NHM9 499 aa21.11■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 USP17L12C9JPN9 530 aa21.11■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 USP17L21D6R901 530 aa21.11■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 CHGBP05060 677 aa21.11■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 SLC4A3P48751 1232 aa21.11■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 C12orf60Q5U649 245 aa21.11■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 AMOTL1Q8IY63 956 aa21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms