RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568530.5

PDPR-210, Transcript of pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDPR, Length 7,223 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPR-210ENST00000568530 CPLX4Q7Z7G2 160 aa9.31□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 POLKQ9UBT6 870 aa9.31□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 BAG5Q9UL15 447 aa9.31□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 PRAG1Q86YV5 1406 aa9.31□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 DISC1Q9NRI5 854 aa9.31□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 DDAH1O94760 285 aa9.31□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 TRIM37O94972 964 aa9.31□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 KRT3P12035 628 aa9.31□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 CALCOCO2Q13137 446 aa9.31□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 DYMQ7RTS9 669 aa9.31□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 OTULINQ96BN8 352 aa9.31□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 FAM89AQ96GI7 184 aa9.31□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 SLC13A4Q9UKG4 626 aa9.31□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 MARK3P27448 753 aa9.31□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 NLRX1Q86UT6 975 aa9.31□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 CTAGE3PQ8IX95 158 aa9.31□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa9.31□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 BLZF1Q9H2G9 400 aa9.31□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa9.31□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 ERBB3P21860 1342 aa9.3□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 DUOX2Q9NRD8 1548 aa9.3□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 BEND3Q5T5X7 828 aa9.3□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa9.3□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa9.3□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 RAPH1Q70E73 1250 aa9.3□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 NELFCDQ8IXH7 590 aa9.3□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 RETREG2Q8NC44 543 aa9.3□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 HOOK2Q96ED9 719 aa9.3□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 CTAGE1Q96RT6 745 aa9.3□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa9.3□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 NEUROG2Q9H2A3 272 aa9.3□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 AS3MTQ9HBK9 375 aa9.3□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 MTUS1Q9ULD2 1270 aa9.3□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 KIF1BO60333 1816 aa9.3□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 VAMP4O75379 141 aa9.3□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 MBD4O95243 580 aa9.3□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 IVLP07476 585 aa9.3□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 EPHB1P54762 984 aa9.3□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 NEDD9Q14511 834 aa9.3□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa9.3□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 TTC25Q96NG3 672 aa9.3□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 NDUFB5O43674 189 aa9.3□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 P4HA1P13674 534 aa9.3□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 OSBPP22059 807 aa9.3□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 TRIM14Q14142 442 aa9.3□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 KSR2Q6VAB6 950 aa9.3□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 CDC37L1Q7L3B6 337 aa9.3□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 NLRP7Q8WX94 980 aa9.3□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 A0A1W2PP64 1363 aa9.3□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 SLC1A4P43007 532 aa9.3□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 METTL23Q86XA0 190 aa9.3□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa9.3□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 IL2RBP14784 551 aa9.3□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 RPS6KB1P23443 525 aa9.3□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 ADCY1Q08828 1119 aa9.3□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 RSAD2Q8WXG1 361 aa9.3□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa9.3□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 GNAQP50148 359 aa9.29□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 GTF2IP78347 998 aa9.29□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 KIAA0825Q8IV33 1275 aa9.29□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 ANKRD2Q9GZV1 360 aa9.29□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 COPRSQ9NQ92 184 aa9.29□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 JAK2O60674 1132 aa9.29□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 CLCN1P35523 988 aa9.29□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 OSTNP61366 133 aa9.29□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 TTC6Q86TZ1 520 aa9.29□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 BTN2A2Q8WVV5 523 aa9.29□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 DPF3Q92784 378 aa9.29□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 ADPGKQ9BRR6 497 aa9.29□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 EXOC7Q9UPT5 735 aa9.29□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 TACC1O75410 805 aa9.29□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 SOX5P35711 763 aa9.29□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 UBXN2AP68543 259 aa9.29□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 ZNF365Q70YC5 407 aa9.29□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 SV2BQ7L1I2 683 aa9.29□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 EXT2Q93063 718 aa9.29□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 SNX14Q9Y5W7 946 aa9.29□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP9.29□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 DDHD2O94830 711 aa9.29□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 ELF2Q15723 593 aa9.29□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 AKAP4Q5JQC9 854 aa9.29□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 ARMC9Q7Z3E5 817 aa9.29□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 SNX21Q969T3 373 aa9.29□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 MAP3K5Q99683 1374 aa9.29□□□□□ -0.92
PDPR-210ENST00000568530 CNNM2Q9H8M5 875 aa9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms