RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564105.5

CTU2-204, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CTU2, Length 1,586 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-204ENST00000564105 MTMR2Q13614 643 aa22.33■■□□□ 1.17
CTU2-204ENST00000564105 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
CTU2-204ENST00000564105 OPTNQ96CV9 577 aa22.33■■□□□ 1.17
CTU2-204ENST00000564105 NDUFB10O96000 172 aa22.33■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 SNHG28P0DPA3 235 aa22.33■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 CDC27P30260 824 aa22.33■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 USP14P54578 494 aa22.33■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 ST3GAL1Q11201 340 aa22.33■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 GRM1Q13255 1194 aa22.33■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 PPP2R5BQ15173 497 aa22.33■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 C19orf81C9J6K1 198 aa22.32■■□□□ 1.16
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CTU2-204ENST00000564105 KIF5BP33176 963 aa22.32■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 ADD1P35611 737 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 PPIL2Q13356 520 aa22.32■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 CUL4AQ13619 759 aa22.32■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa22.32■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 USP17L2Q6R6M4 530 aa22.32■■□□□ 1.16
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CTU2-204ENST00000564105 DCAF4Q8WV16 495 aa22.32■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 MAD2L2Q9UI95 211 aa22.32■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa22.31■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 IRF6O14896 467 aa22.31■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 SLC1A4P43007 532 aa22.31■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 GMCL1Q96IK5 515 aa22.31■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 CPLX1O14810 134 aa22.3■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 GOLGA8HP0CJ92 632 aa22.3■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 SLC4A3P48751 1232 aa22.3■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 CCDC96Q2M329 555 aa22.3■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 ASPRV1Q53RT3 343 aa22.3■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 STAG2Q8N3U4 1231 aa22.3■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 AOC2O75106 756 aa22.29■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 HMGCS2P54868 508 aa22.29■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 ZNF543Q08ER8 600 aa22.29■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 DGKZQ13574 1117 aa22.29■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 LPAR1Q92633 364 aa22.29■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 WNK4Q96J92 1243 aa22.29■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 EMILIN3Q9NT22 766 aa22.29■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 CXCL11O14625 94 aa22.29■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 BMP3P12645 472 aa22.29■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 GJA5P36382 358 aa22.29■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 GNAQP50148 359 aa22.29■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 LBX1P52954 281 aa22.29■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 KCTD1Q719H9 257 aa22.29■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 HHIPL1Q96JK4 782 aa22.29■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 GPCPD1Q9NPB8 672 aa22.29■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 PRDM10Q9NQV6 1147 aa22.29■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 KCNH4Q9UQ05 1017 aa22.29■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 KLRF2D3W0D1 207 aa22.28■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 PLEKHA8P1O95397 391 aa22.28■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 SH3D19Q5HYK7 790 aa22.28■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 TMTC3Q6ZXV5 915 aa22.28■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 C12orf42Q96LP6 360 aa22.28■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 TMOD4Q9NZQ9 345 aa22.28■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 WDR46O15213 610 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 NTRK3Q16288 839 aa22.27■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 FAM83BQ5T0W9 1011 aa22.27■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa22.27■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 FOXD4L1Q9NU39 408 aa22.27■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
CTU2-204ENST00000564105 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 CTDNEP1O95476 244 aa22.26■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 VCAM1P19320 739 aa22.26■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 RGMBQ6NW40 437 aa22.26■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 CCDC82Q8N4S0 544 aa22.26■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 LZTS2Q9BRK4 669 aa22.26■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 DTNBO60941 627 aa22.25■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 CDKL5O76039 1030 aa22.25■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 IFNAR1P17181 557 aa22.25■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 SPRYD7Q5W111 196 aa22.25■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 TTBK2Q6IQ55 1244 aa22.25■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 CPVLQ9H3G5 476 aa22.25■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 TMEM232C9JQI7 657 aa22.25■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 CAPN15O75808 1086 aa22.25■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 MAP2K2P36507 400 aa22.25■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 GADL1Q6ZQY3 521 aa22.25■■□□□ 1.15
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