RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	25.92	■■□□□ 1.74
PPP4C-205	ENST00000563200	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	25.92	■■□□□ 1.74
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		25.92	■■□□□ 1.74
PPP4C-205	ENST00000563200	WDR78	Q5VTH9	848 aa		25.92	■■□□□ 1.74
PPP4C-205	ENST00000563200	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		25.92	■■□□□ 1.74
PPP4C-205	ENST00000563200	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	25.92	■■□□□ 1.74
PPP4C-205	ENST00000563200		F5H6K3	240 aa		25.91	■■□□□ 1.74
PPP4C-205	ENST00000563200	IGHA2	P01877	340 aa		25.91	■■□□□ 1.74
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	25.91	■■□□□ 1.74
PPP4C-205	ENST00000563200	ERCC3	P19447	782 aa		25.91	■■□□□ 1.74
PPP4C-205	ENST00000563200	KLRC3	Q07444	240 aa		25.91	■■□□□ 1.74
PPP4C-205	ENST00000563200	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	25.91	■■□□□ 1.74
PPP4C-205	ENST00000563200	ALX1	Q15699	326 aa		25.91	■■□□□ 1.74
PPP4C-205	ENST00000563200	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		25.91	■■□□□ 1.74
PPP4C-205	ENST00000563200	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		25.91	■■□□□ 1.74
PPP4C-205	ENST00000563200	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		25.91	■■□□□ 1.74
PPP4C-205	ENST00000563200	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		25.91	■■□□□ 1.74
PPP4C-205	ENST00000563200	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		25.91	■■□□□ 1.74
PPP4C-205	ENST00000563200	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		25.91	■■□□□ 1.74
PPP4C-205	ENST00000563200	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		25.9	■■□□□ 1.74
PPP4C-205	ENST00000563200	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	25.9	■■□□□ 1.74
PPP4C-205	ENST00000563200	NDUFB10	O96000	172 aa		25.9	■■□□□ 1.74
PPP4C-205	ENST00000563200	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	25.9	■■□□□ 1.74
PPP4C-205	ENST00000563200	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	25.9	■■□□□ 1.74
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		25.9	■■□□□ 1.74
PPP4C-205	ENST00000563200	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		25.9	■■□□□ 1.74
PPP4C-205	ENST00000563200	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		25.9	■■□□□ 1.74
PPP4C-205	ENST00000563200	STRN	O43815	780 aa		25.89	■■□□□ 1.74
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		25.89	■■□□□ 1.74
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	25.89	■■□□□ 1.74
PPP4C-205	ENST00000563200	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	25.89	■■□□□ 1.74
PPP4C-205	ENST00000563200	VWA5A	O00534	786 aa		25.88	■■□□□ 1.73
PPP4C-205	ENST00000563200	RAD21	O60216	631 aa		25.88	■■□□□ 1.73
PPP4C-205	ENST00000563200	TTLL1	O95922	423 aa		25.88	■■□□□ 1.73
PPP4C-205	ENST00000563200	TSPY3	P0CV98	308 aa		25.88	■■□□□ 1.73
PPP4C-205	ENST00000563200	TSPY8	P0CW00	308 aa		25.88	■■□□□ 1.73
PPP4C-205	ENST00000563200	TFAP4	Q01664	338 aa		25.88	■■□□□ 1.73
PPP4C-205	ENST00000563200	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		25.88	■■□□□ 1.73
PPP4C-205	ENST00000563200	REPS2	Q8NFH8	660 aa		25.88	■■□□□ 1.73
PPP4C-205	ENST00000563200	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		25.88	■■□□□ 1.73
PPP4C-205	ENST00000563200	RILPL2	Q969X0	211 aa		25.88	■■□□□ 1.73
PPP4C-205	ENST00000563200	MROH8	Q9H579	483 aa		25.88	■■□□□ 1.73
PPP4C-205	ENST00000563200	INCENP	Q9NQS7	918 aa		25.88	■■□□□ 1.73
PPP4C-205	ENST00000563200	FGR	P09769	529 aa		25.88	■■□□□ 1.73
PPP4C-205	ENST00000563200	PLS1	Q14651	629 aa		25.88	■■□□□ 1.73
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	25.87	■■□□□ 1.73
PPP4C-205	ENST00000563200	FGA	P02671	866 aa		25.87	■■□□□ 1.73
PPP4C-205	ENST00000563200	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	25.87	■■□□□ 1.73
PPP4C-205	ENST00000563200	SDS	P20132	328 aa		25.87	■■□□□ 1.73
PPP4C-205	ENST00000563200	ADORA2A	P29274	412 aa		25.87	■■□□□ 1.73
PPP4C-205	ENST00000563200	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		25.87	■■□□□ 1.73
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	25.87	■■□□□ 1.73
PPP4C-205	ENST00000563200	ZMYM6	O95789	1325 aa		25.86	■■□□□ 1.73
PPP4C-205	ENST00000563200	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	25.86	■■□□□ 1.73
PPP4C-205	ENST00000563200	MNX1	P50219	401 aa	Predicted RBP	25.86	■■□□□ 1.73
PPP4C-205	ENST00000563200	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	25.86	■■□□□ 1.73
PPP4C-205	ENST00000563200	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		25.86	■■□□□ 1.73
PPP4C-205	ENST00000563200	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		25.86	■■□□□ 1.73
PPP4C-205	ENST00000563200	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		25.86	■■□□□ 1.73
PPP4C-205	ENST00000563200	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		25.86	■■□□□ 1.73
PPP4C-205	ENST00000563200	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		25.86	■■□□□ 1.73
PPP4C-205	ENST00000563200	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		25.86	■■□□□ 1.73
PPP4C-205	ENST00000563200	COBL	O75128	1261 aa		25.85	■■□□□ 1.73
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC25A27	O95847	323 aa		25.85	■■□□□ 1.73
PPP4C-205	ENST00000563200	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	25.85	■■□□□ 1.73
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	25.85	■■□□□ 1.73
PPP4C-205	ENST00000563200	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		25.85	■■□□□ 1.73
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		25.85	■■□□□ 1.73
PPP4C-205	ENST00000563200	ORC4	O43929	436 aa		25.84	■■□□□ 1.73
PPP4C-205	ENST00000563200	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	25.84	■■□□□ 1.73
PPP4C-205	ENST00000563200	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	25.84	■■□□□ 1.73
PPP4C-205	ENST00000563200	HTATIP2	Q9BUP3	242 aa		25.84	■■□□□ 1.73
PPP4C-205	ENST00000563200	STAT3	P40763	770 aa		25.83	■■□□□ 1.73
PPP4C-205	ENST00000563200	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		25.83	■■□□□ 1.73
PPP4C-205	ENST00000563200	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		25.83	■■□□□ 1.73
PPP4C-205	ENST00000563200	LHX8	Q68G74	356 aa		25.83	■■□□□ 1.73
PPP4C-205	ENST00000563200	DPP9	Q86TI2	863 aa		25.83	■■□□□ 1.73
PPP4C-205	ENST00000563200	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	25.83	■■□□□ 1.73
PPP4C-205	ENST00000563200	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		25.82	■■□□□ 1.72
PPP4C-205	ENST00000563200	PDE4A	P27815	886 aa		25.82	■■□□□ 1.72
PPP4C-205	ENST00000563200	NOV	P48745	357 aa		25.82	■■□□□ 1.72
PPP4C-205	ENST00000563200	ALPK3	Q96L96	1907 aa		25.82	■■□□□ 1.72
PPP4C-205	ENST00000563200	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		25.82	■■□□□ 1.72
PPP4C-205	ENST00000563200	TSPY2	A6NKD2	308 aa		25.81	■■□□□ 1.72
PPP4C-205	ENST00000563200		H0YGN5	161 aa		25.81	■■□□□ 1.72
PPP4C-205	ENST00000563200	NMT2	O60551	498 aa		25.81	■■□□□ 1.72
PPP4C-205	ENST00000563200	CYP2C19	P33261	490 aa		25.81	■■□□□ 1.72
PPP4C-205	ENST00000563200	DPF3	Q92784	378 aa		25.81	■■□□□ 1.72
PPP4C-205	ENST00000563200	ATP2A1	O14983	1001 aa		25.8	■■□□□ 1.72
PPP4C-205	ENST00000563200	FCER1A	P12319	257 aa		25.8	■■□□□ 1.72
PPP4C-205	ENST00000563200	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		25.8	■■□□□ 1.72
PPP4C-205	ENST00000563200	SLFN13	Q68D06	897 aa		25.8	■■□□□ 1.72
PPP4C-205	ENST00000563200	NBPF3	Q9H094	633 aa		25.8	■■□□□ 1.72
PPP4C-205	ENST00000563200	FEM1B	Q9UK73	627 aa		25.8	■■□□□ 1.72
PPP4C-205	ENST00000563200	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	25.8	■■□□□ 1.72
PPP4C-205	ENST00000563200	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		25.8	■■□□□ 1.72
PPP4C-205	ENST00000563200	TRPV1	Q8NER1	839 aa		25.8	■■□□□ 1.72
PPP4C-205	ENST00000563200	GMCL1	Q96IK5	515 aa		25.8	■■□□□ 1.72
PPP4C-205	ENST00000563200	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		25.8	■■□□□ 1.72
PPP4C-205	ENST00000563200	BMP3	P12645	472 aa		25.79	■■□□□ 1.72

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