RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555690.5

PPP4R4-204, Transcript of protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, human

TSL 3

Gene PPP4R4, Length 680 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4R4-204	ENST00000555690	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		29.29	■■■□□ 2.28
PPP4R4-204	ENST00000555690	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		29.29	■■■□□ 2.28
PPP4R4-204	ENST00000555690	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	29.28	■■■□□ 2.28
PPP4R4-204	ENST00000555690	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		29.27	■■■□□ 2.28
PPP4R4-204	ENST00000555690	DNM1L	O00429	736 aa		29.27	■■■□□ 2.28
PPP4R4-204	ENST00000555690	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	29.27	■■■□□ 2.28
PPP4R4-204	ENST00000555690	FCER1A	P12319	257 aa		29.27	■■■□□ 2.28
PPP4R4-204	ENST00000555690	RASA1	P20936	1047 aa		29.27	■■■□□ 2.28
PPP4R4-204	ENST00000555690	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	29.27	■■■□□ 2.28
PPP4R4-204	ENST00000555690	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		29.27	■■■□□ 2.28
PPP4R4-204	ENST00000555690	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		29.27	■■■□□ 2.28
PPP4R4-204	ENST00000555690	ANO1	Q5XXA6	986 aa		29.27	■■■□□ 2.28
PPP4R4-204	ENST00000555690	APPBP2	Q92624	585 aa		29.27	■■■□□ 2.28
PPP4R4-204	ENST00000555690	SLC25A27	O95847	323 aa		29.26	■■■□□ 2.27
PPP4R4-204	ENST00000555690	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	29.26	■■■□□ 2.27
PPP4R4-204	ENST00000555690	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		29.26	■■■□□ 2.27
PPP4R4-204	ENST00000555690	TDH	Q8IZJ6	230 aa		29.26	■■■□□ 2.27
PPP4R4-204	ENST00000555690	MAML3	Q96JK9	1138 aa		29.26	■■■□□ 2.27
PPP4R4-204	ENST00000555690	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		29.26	■■■□□ 2.27
PPP4R4-204	ENST00000555690	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		29.26	■■■□□ 2.27
PPP4R4-204	ENST00000555690	PARP14	Q460N5	1801 aa		29.25	■■■□□ 2.27
PPP4R4-204	ENST00000555690	VWA5A	O00534	786 aa		29.25	■■■□□ 2.27
PPP4R4-204	ENST00000555690	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	29.25	■■■□□ 2.27
PPP4R4-204	ENST00000555690	SEPT4	O43236	478 aa		29.24	■■■□□ 2.27
PPP4R4-204	ENST00000555690	GPAA1	O43292	621 aa		29.24	■■■□□ 2.27
PPP4R4-204	ENST00000555690	STAT3	P40763	770 aa		29.24	■■■□□ 2.27
PPP4R4-204	ENST00000555690	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		29.24	■■■□□ 2.27
PPP4R4-204	ENST00000555690	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		29.24	■■■□□ 2.27
PPP4R4-204	ENST00000555690	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	29.24	■■■□□ 2.27
PPP4R4-204	ENST00000555690	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	29.23	■■■□□ 2.27
PPP4R4-204	ENST00000555690	MMP19	Q99542	508 aa		29.23	■■■□□ 2.27
PPP4R4-204	ENST00000555690	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	29.23	■■■□□ 2.27
PPP4R4-204	ENST00000555690	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	29.22	■■■□□ 2.27
PPP4R4-204	ENST00000555690		M0R2C6	588 aa		29.22	■■■□□ 2.27
PPP4R4-204	ENST00000555690	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	29.22	■■■□□ 2.27
PPP4R4-204	ENST00000555690	APP	P05067	770 aa		29.22	■■■□□ 2.27
PPP4R4-204	ENST00000555690	PGK2	P07205	417 aa		29.22	■■■□□ 2.27
PPP4R4-204	ENST00000555690	LRIT3	Q3SXY7	679 aa		29.22	■■■□□ 2.27
PPP4R4-204	ENST00000555690	REPS2	Q8NFH8	660 aa		29.22	■■■□□ 2.27
PPP4R4-204	ENST00000555690	NYAP2	Q9P242	653 aa		29.22	■■■□□ 2.27
PPP4R4-204	ENST00000555690	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	29.22	■■■□□ 2.27
PPP4R4-204	ENST00000555690	COL6A3	P12111	3177 aa		29.21	■■■□□ 2.27
PPP4R4-204	ENST00000555690	TDO2	P48775	406 aa		29.21	■■■□□ 2.27
PPP4R4-204	ENST00000555690	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	29.21	■■■□□ 2.27
PPP4R4-204	ENST00000555690	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		29.21	■■■□□ 2.27
PPP4R4-204	ENST00000555690	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		29.21	■■■□□ 2.27
PPP4R4-204	ENST00000555690	KBTBD13	C9JR72	458 aa		29.2	■■■□□ 2.26
PPP4R4-204	ENST00000555690		F5H6K3	240 aa		29.2	■■■□□ 2.26
PPP4R4-204	ENST00000555690	GNAT2	P19087	354 aa		29.2	■■■□□ 2.26
PPP4R4-204	ENST00000555690	RTP1	P59025	263 aa		29.2	■■■□□ 2.26
PPP4R4-204	ENST00000555690	KLRC3	Q07444	240 aa		29.2	■■■□□ 2.26
PPP4R4-204	ENST00000555690	KCTD2	Q14681	263 aa		29.2	■■■□□ 2.26
PPP4R4-204	ENST00000555690	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		29.2	■■■□□ 2.26
PPP4R4-204	ENST00000555690	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		29.2	■■■□□ 2.26
PPP4R4-204	ENST00000555690	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	29.2	■■■□□ 2.26
PPP4R4-204	ENST00000555690	PRDM1	O75626	825 aa		29.19	■■■□□ 2.26
PPP4R4-204	ENST00000555690	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	29.18	■■■□□ 2.26
PPP4R4-204	ENST00000555690	NDUFB10	O96000	172 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PPP4R4-204	ENST00000555690	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PPP4R4-204	ENST00000555690	GPR153	Q6NV75	609 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PPP4R4-204	ENST00000555690	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	29.18	■■■□□ 2.26
PPP4R4-204	ENST00000555690	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	29.18	■■■□□ 2.26
PPP4R4-204	ENST00000555690	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	29.18	■■■□□ 2.26
PPP4R4-204	ENST00000555690	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PPP4R4-204	ENST00000555690	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PPP4R4-204	ENST00000555690	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PPP4R4-204	ENST00000555690	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PPP4R4-204	ENST00000555690	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PPP4R4-204	ENST00000555690	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PPP4R4-204	ENST00000555690	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	29.17	■■■□□ 2.26
PPP4R4-204	ENST00000555690	TINF2	Q9BSI4	451 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PPP4R4-204	ENST00000555690	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PPP4R4-204	ENST00000555690	ERC2	O15083	957 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PPP4R4-204	ENST00000555690	COPB2	P35606	906 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PPP4R4-204	ENST00000555690	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PPP4R4-204	ENST00000555690	LRRC41	Q15345	812 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PPP4R4-204	ENST00000555690	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	29.16	■■■□□ 2.26
PPP4R4-204	ENST00000555690	DEFB123	Q8N688	67 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PPP4R4-204	ENST00000555690	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PPP4R4-204	ENST00000555690	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PPP4R4-204	ENST00000555690	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PPP4R4-204	ENST00000555690	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	29.16	■■■□□ 2.26
PPP4R4-204	ENST00000555690	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PPP4R4-204	ENST00000555690	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	29.15	■■■□□ 2.26
PPP4R4-204	ENST00000555690	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	29.15	■■■□□ 2.26
PPP4R4-204	ENST00000555690		Q7L0L9	218 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PPP4R4-204	ENST00000555690	FERMT2	Q96AC1	680 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PPP4R4-204	ENST00000555690	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PPP4R4-204	ENST00000555690	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	29.15	■■■□□ 2.26
PPP4R4-204	ENST00000555690	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	29.14	■■■□□ 2.26
PPP4R4-204	ENST00000555690	CEP95	Q96GE4	821 aa		29.14	■■■□□ 2.26
PPP4R4-204	ENST00000555690	FSD1	Q9BTV5	496 aa		29.14	■■■□□ 2.26
PPP4R4-204	ENST00000555690	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		29.14	■■■□□ 2.26
PPP4R4-204	ENST00000555690	RIPK3	Q9Y572	518 aa		29.14	■■■□□ 2.26
PPP4R4-204	ENST00000555690	RARB	P10826	455 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PPP4R4-204	ENST00000555690	SLC4A3	P48751	1232 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PPP4R4-204	ENST00000555690	MKL1	Q969V6	931 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PPP4R4-204	ENST00000555690	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PPP4R4-204	ENST00000555690	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PPP4R4-204	ENST00000555690	CPXCR1	Q8N123	301 aa		29.12	■■■□□ 2.25

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