RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552294.1

CTDSP2-208, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP2, Length 436 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-208ENST00000552294 REPS2Q8NFH8 660 aa8.31□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa8.31□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 SDR42E1Q8WUS8 393 aa8.31□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 ASB2Q96Q27 587 aa8.31□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa8.31□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa8.31□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 SERPINB13Q9UIV8 391 aa8.31□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 TBX21Q9UL17 535 aa8.31□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 RIPK3Q9Y572 518 aa8.31□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 ZNF236Q9UL36 1845 aa8.31□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 EPOPA6NHQ4 379 aa8.3□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 BAG3O95817 575 aa8.3□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa8.3□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 RLBP1P12271 317 aa8.3□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 CCNA1P78396 465 aa8.3□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 FPGSQ05932 587 aa8.3□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 MAP3K12Q12852 859 aa8.3□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 COG2Q14746 738 aa8.3□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 ZNF365Q70YC5 407 aa8.3□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 LCORLQ8N3X6 602 aa8.3□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 TMEM57Q8N5G2 664 aa8.3□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 TIFAQ96CG3 184 aa8.3□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP8.3□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa8.3□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 TANGO6Q9C0B7 1094 aa8.3□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 EHD4Q9H223 541 aa8.3□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa8.3□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 EPHX3Q9H6B9 360 aa8.3□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 C11orf16Q9NQ32 467 aa8.3□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 TMEM39AQ9NV64 488 aa8.3□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa8.3□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 SMCHD1A6NHR9 2005 aa8.3□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 ASTN1O14525 1302 aa8.29□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 GRIN2DO15399 1336 aa8.29□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa8.29□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa8.29□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 ANP32CO43423 234 aa8.29□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 MSCO60682 206 aa8.29□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 HLA-DOAP06340 250 aa8.29□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 BMP1P13497 986 aa8.29□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 RAG1P15918 1043 aa8.29□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 CYP2C18P33260 490 aa8.29□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 PLA2G5P39877 138 aa8.29□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 USP5P45974 858 aa8.29□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 CDK7P50613 346 aa8.29□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 ACLYP53396 1101 aa8.29□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP8.29□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 KCNA10Q16322 511 aa8.29□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 KLHDC9Q8NEP7 349 aa8.29□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 SSH3Q8TE77 659 aa8.29□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 TINF2Q9BSI4 451 aa8.29□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 TRIM34Q9BYJ4 488 aa8.29□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 CD320Q9NPF0 282 aa8.29□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 TACC3Q9Y6A5 838 aa8.29□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 MYH1P12882 1939 aa8.29□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 FLOT1O75955 427 aa8.28□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 TIMP1P01033 207 aa8.28□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 GNAI2P04899 355 aa8.28□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 USP14P54578 494 aa8.28□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 BEX3Q00994 111 aa8.28□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa8.28□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 SHCBP1Q8NEM2 672 aa8.28□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 ARMT1Q9H993 441 aa8.28□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 GINM1Q9NU53 330 aa8.28□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa8.28□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa8.28□□□□□ -1.08
CTDSP2-208ENST00000552294 TRIOO75962 3097 aa8.27□□□□□ -1.09
CTDSP2-208ENST00000552294 PARP14Q460N5 1801 aa8.27□□□□□ -1.09
CTDSP2-208ENST00000552294 FAM86C2PA6NEL3 165 aa8.27□□□□□ -1.09
CTDSP2-208ENST00000552294 STRNO43815 780 aa8.27□□□□□ -1.09
CTDSP2-208ENST00000552294 SURF6O75683 361 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
CTDSP2-208ENST00000552294 GNAI3P08754 354 aa8.27□□□□□ -1.09
CTDSP2-208ENST00000552294 PDE6AP16499 860 aa8.27□□□□□ -1.09
CTDSP2-208ENST00000552294 PLCG2P16885 1265 aa8.27□□□□□ -1.09
CTDSP2-208ENST00000552294 IGFBP4P22692 258 aa8.27□□□□□ -1.09
CTDSP2-208ENST00000552294 ATP8B2P98198 1209 aa8.27□□□□□ -1.09
CTDSP2-208ENST00000552294 MFSD5Q6N075 450 aa8.27□□□□□ -1.09
CTDSP2-208ENST00000552294 RASGRP2Q7LDG7 609 aa8.27□□□□□ -1.09
CTDSP2-208ENST00000552294 ANKS1AQ92625 1134 aa8.27□□□□□ -1.09
CTDSP2-208ENST00000552294 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
CTDSP2-208ENST00000552294 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
CTDSP2-208ENST00000552294 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
CTDSP2-208ENST00000552294 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
CTDSP2-208ENST00000552294 KATNBL1Q9H079 304 aa8.27□□□□□ -1.09
CTDSP2-208ENST00000552294 WNT8AQ9H1J5 351 aa8.27□□□□□ -1.09
CTDSP2-208ENST00000552294 CERS4Q9HA82 394 aa8.27□□□□□ -1.09
CTDSP2-208ENST00000552294 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
CTDSP2-208ENST00000552294 GPR108Q9NPR9 543 aa8.27□□□□□ -1.09
CTDSP2-208ENST00000552294 MCM9Q9NXL9 1143 aa8.27□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms