RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551473.5

CS-228, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-228ENST00000551473 GABPAQ06546 454 aa14.46□□□□□ -0.09
CS-228ENST00000551473 RAB30Q15771 203 aa14.46□□□□□ -0.09
CS-228ENST00000551473 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
CS-228ENST00000551473 TMEM199Q8N511 208 aa14.46□□□□□ -0.09
CS-228ENST00000551473 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
CS-228ENST00000551473 PPM1EQ8WY54 764 aa14.46□□□□□ -0.09
CS-228ENST00000551473 ATG4CQ96DT6 458 aa14.46□□□□□ -0.09
CS-228ENST00000551473 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP14.46□□□□□ -0.094e-7■■□□□ 13.5
CS-228ENST00000551473 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
CS-228ENST00000551473 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
CS-228ENST00000551473 SWAP70Q9UH65 585 aa14.46□□□□□ -0.09
CS-228ENST00000551473 MSRAQ9UJ68 235 aa14.46□□□□□ -0.09
CS-228ENST00000551473 A0A0G2JMZ2 1700 aa14.46□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 TTC28Q96AY4 2481 aa14.46□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa14.45□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 ADAMTS4O75173 837 aa14.45□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 SURF6O75683 361 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 ACLYP53396 1101 aa14.45□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 POLA2Q14181 598 aa14.45□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 RIOX2Q8IUF8 465 aa14.45□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 GLT1D1Q96MS3 346 aa14.45□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 PBX4Q9BYU1 374 aa14.45□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 VCPKMTQ9H867 229 aa14.45□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 MCM9Q9NXL9 1143 aa14.45□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 ELP1O95163 1332 aa14.44□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa14.44□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 TLR3O15455 904 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP14.44□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 ICA1Q05084 483 aa14.44□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 ZNF792Q3KQV3 632 aa14.44□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 SSH3Q8TE77 659 aa14.44□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa14.44□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 PRDM12Q9H4Q4 367 aa14.44□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 SPC25Q9HBM1 224 aa14.44□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 TBX21Q9UL17 535 aa14.44□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 FAM184BQ9ULE4 1060 aa14.44□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 TMX2Q9Y320 296 aa14.44□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 TMEM132BQ14DG7 1078 aa14.43□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP14.43□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 TMEM240Q5SV17 173 aa14.43□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 RASIP1Q5U651 963 aa14.43□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP14.43□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 CCDC17Q96LX7 622 aa14.43□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa14.42□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa14.42□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 APBB1O00213 710 aa14.42□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 PGK2P07205 417 aa14.42□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 TRIM27P14373 513 aa14.42□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 IGFBP4P22692 258 aa14.42□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 CST5P28325 142 aaPredicted RBP14.42□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 STAT3P40763 770 aa14.42□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 ATP8B2P98198 1209 aa14.42□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 KCNA10Q16322 511 aa14.42□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 AAK1Q2M2I8 961 aa14.42□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 SPICE1Q8N0Z3 855 aa14.42□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 KLHDC9Q8NEP7 349 aa14.42□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP14.42□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa14.42□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 MUC3AQ02505 3323 aa14.41□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP14.41□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP14.41□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP14.41□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 PBX2P40425 430 aa14.41□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 AMOTL1Q8IY63 956 aa14.41□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 VTI1AQ96AJ9 217 aa14.41□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 SLC28A3Q9HAS3 691 aa14.41□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 GOPCQ9HD26 462 aa14.41□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP14.41□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa14.41□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP14.41□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP14.41□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 VWA5AO00534 786 aa14.4□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 CSF2RAP15509 400 aa14.4□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP14.4□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa14.4□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP14.4□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 ZNF365Q70YC5 407 aa14.4□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 HERVK_113Q902F9 699 aa14.4□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP14.4□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP14.4□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 ANTXR1Q9H6X2 564 aa14.4□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP14.4□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP14.4□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa14.4□□□□□ -0.1
CS-228ENST00000551473 ARVCFO00192 962 aa14.39□□□□□ -0.11
CS-228ENST00000551473 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP14.39□□□□□ -0.11
CS-228ENST00000551473 CDK7P50613 346 aa14.39□□□□□ -0.11
CS-228ENST00000551473 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa14.39□□□□□ -0.11
CS-228ENST00000551473 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa14.39□□□□□ -0.11
CS-228ENST00000551473 C16orf59Q7L2K0 433 aa14.39□□□□□ -0.11
CS-228ENST00000551473 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP14.39□□□□□ -0.11
CS-228ENST00000551473 ERC1Q8IUD2 1116 aa14.39□□□□□ -0.11
CS-228ENST00000551473 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP14.39□□□□□ -0.11
CS-228ENST00000551473 DDX11Q96FC9 970 aa14.39□□□□□ -0.11
CS-228ENST00000551473 IL23AQ9NPF7 189 aa14.39□□□□□ -0.11
CS-228ENST00000551473 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP14.39□□□□□ -0.11
CS-228ENST00000551473 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa14.39□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms