RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 PGK1P00558 417 aa19.49■□□□□ 0.71
CS-227ENST00000551441 EPHB4P54760 987 aa19.49■□□□□ 0.71
CS-227ENST00000551441 TMEM132BQ14DG7 1078 aa19.49■□□□□ 0.71
CS-227ENST00000551441 TMEM179Q6ZVK1 233 aa19.49■□□□□ 0.71
CS-227ENST00000551441 FBXO28Q9NVF7 368 aa19.49■□□□□ 0.71
CS-227ENST00000551441 CDH23Q9H251 3354 aa19.49■□□□□ 0.71
CS-227ENST00000551441 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa19.48■□□□□ 0.71
CS-227ENST00000551441 ICA1Q05084 483 aa19.48■□□□□ 0.71
CS-227ENST00000551441 RHPN1Q8TCX5 695 aa19.48■□□□□ 0.71
CS-227ENST00000551441 PANK1Q8TE04 598 aa19.48■□□□□ 0.71
CS-227ENST00000551441 MROH8Q9H579 483 aa19.48■□□□□ 0.71
CS-227ENST00000551441 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa19.48■□□□□ 0.71
CS-227ENST00000551441 SLC5A4Q9NY91 659 aa19.48■□□□□ 0.71
CS-227ENST00000551441 PARP14Q460N5 1801 aa19.48■□□□□ 0.71
CS-227ENST00000551441 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
CS-227ENST00000551441 FCER1AP12319 257 aa19.47■□□□□ 0.71
CS-227ENST00000551441 SNX17Q15036 470 aa19.47■□□□□ 0.71
CS-227ENST00000551441 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
CS-227ENST00000551441 ERC1Q8IUD2 1116 aa19.47■□□□□ 0.71
CS-227ENST00000551441 MMP19Q99542 508 aa19.47■□□□□ 0.71
CS-227ENST00000551441 VCPKMTQ9H867 229 aa19.47■□□□□ 0.71
CS-227ENST00000551441 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa19.47■□□□□ 0.71
CS-227ENST00000551441 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa19.47■□□□□ 0.71
CS-227ENST00000551441 MBD4O95243 580 aa19.46■□□□□ 0.71
CS-227ENST00000551441 MB21D1Q8N884 522 aa19.46■□□□□ 0.71
CS-227ENST00000551441 TMX2Q9Y320 296 aa19.46■□□□□ 0.71
CS-227ENST00000551441 RARBP10826 455 aa19.45■□□□□ 0.7
CS-227ENST00000551441 EEF2P13639 858 aaKnown RBP19.45■□□□□ 0.7
CS-227ENST00000551441 FOSL2P15408 326 aa19.45■□□□□ 0.7
CS-227ENST00000551441 SLC4A3P48751 1232 aa19.45■□□□□ 0.7
CS-227ENST00000551441 CDK8P49336 464 aa19.45■□□□□ 0.7
CS-227ENST00000551441 STK11IPQ8N1F8 1099 aa19.45■□□□□ 0.7
CS-227ENST00000551441 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP19.45■□□□□ 0.7
CS-227ENST00000551441 BOLA2Q9H3K6 86 aa19.45■□□□□ 0.7
CS-227ENST00000551441 SWAP70Q9UH65 585 aa19.45■□□□□ 0.7
CS-227ENST00000551441 PHF24Q9UPV7 400 aa19.45■□□□□ 0.7
CS-227ENST00000551441 CLTBP09497 229 aa19.44■□□□□ 0.7
CS-227ENST00000551441 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP19.44■□□□□ 0.7
CS-227ENST00000551441 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP19.44■□□□□ 0.7
CS-227ENST00000551441 ABRAQ8N0Z2 381 aa19.44■□□□□ 0.7
CS-227ENST00000551441 TINF2Q9BSI4 451 aa19.44■□□□□ 0.7
CS-227ENST00000551441 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP19.43■□□□□ 0.7
CS-227ENST00000551441 A0A1W2PQY0 241 aa19.43■□□□□ 0.7
CS-227ENST00000551441 WDR46O15213 610 aaKnown RBP19.43■□□□□ 0.7
CS-227ENST00000551441 RAG1P15918 1043 aa19.43■□□□□ 0.7
CS-227ENST00000551441 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP19.43■□□□□ 0.7
CS-227ENST00000551441 FAM83BQ5T0W9 1011 aa19.43■□□□□ 0.7
CS-227ENST00000551441 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP19.43■□□□□ 0.7
CS-227ENST00000551441 TACC3Q9Y6A5 838 aa19.43■□□□□ 0.7
CS-227ENST00000551441 USP17L12C9JPN9 530 aa19.42■□□□□ 0.7
CS-227ENST00000551441 USP17L21D6R901 530 aa19.42■□□□□ 0.7
CS-227ENST00000551441 SLC25A27O95847 323 aa19.42■□□□□ 0.7
CS-227ENST00000551441 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP19.42■□□□□ 0.7
CS-227ENST00000551441 STAT3P40763 770 aa19.42■□□□□ 0.7
CS-227ENST00000551441 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP19.42■□□□□ 0.7
CS-227ENST00000551441 KCTD2Q14681 263 aa19.42■□□□□ 0.7
CS-227ENST00000551441 ZNF792Q3KQV3 632 aa19.42■□□□□ 0.7
CS-227ENST00000551441 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP19.42■□□□□ 0.7
CS-227ENST00000551441 RNF180Q86T96 592 aa19.42■□□□□ 0.7
CS-227ENST00000551441 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP19.42■□□□□ 0.7
CS-227ENST00000551441 SH2D4AQ9H788 454 aa19.42■□□□□ 0.7
CS-227ENST00000551441 TMEM39AQ9NV64 488 aa19.42■□□□□ 0.7
CS-227ENST00000551441 ADD2P35612 726 aa19.41■□□□□ 0.7
CS-227ENST00000551441 GRIN2CQ14957 1233 aa19.41■□□□□ 0.7
CS-227ENST00000551441 C12orf60Q5U649 245 aa19.41■□□□□ 0.7
CS-227ENST00000551441 RIOX2Q8IUF8 465 aa19.41■□□□□ 0.7
CS-227ENST00000551441 PAG1Q9NWQ8 432 aa19.41■□□□□ 0.7
CS-227ENST00000551441 VWA5AO00534 786 aa19.4■□□□□ 0.7
CS-227ENST00000551441 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa19.4■□□□□ 0.7
CS-227ENST00000551441 C1orf53Q5VUE5 145 aa19.4■□□□□ 0.7
CS-227ENST00000551441 USP38Q8NB14 1042 aa19.4■□□□□ 0.7
CS-227ENST00000551441 KIF1BPQ96EK5 621 aa19.4■□□□□ 0.7
CS-227ENST00000551441 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa19.4■□□□□ 0.7
CS-227ENST00000551441 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa19.4■□□□□ 0.7
CS-227ENST00000551441 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa19.4■□□□□ 0.7
CS-227ENST00000551441 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa19.4■□□□□ 0.7
CS-227ENST00000551441 MYADML2A6NDP7 307 aa19.39■□□□□ 0.69
CS-227ENST00000551441 KIAA0355O15063 1070 aa19.39■□□□□ 0.69
CS-227ENST00000551441 AKR1A1P14550 325 aa19.39■□□□□ 0.69
CS-227ENST00000551441 FPGSQ05932 587 aa19.39■□□□□ 0.69
CS-227ENST00000551441 FAAP100Q0VG06 881 aa19.39■□□□□ 0.69
CS-227ENST00000551441 C16orf86Q6ZW13 317 aa19.39■□□□□ 0.69
CS-227ENST00000551441 REPS2Q8NFH8 660 aa19.39■□□□□ 0.69
CS-227ENST00000551441 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP19.39■□□□□ 0.69
CS-227ENST00000551441 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP19.39■□□□□ 0.69
CS-227ENST00000551441 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP19.39■□□□□ 0.69
CS-227ENST00000551441 ADAMTS4O75173 837 aa19.38■□□□□ 0.69
CS-227ENST00000551441 ACLYP53396 1101 aa19.38■□□□□ 0.69
CS-227ENST00000551441 CTR9Q6PD62 1173 aa19.38■□□□□ 0.69
CS-227ENST00000551441 SIRT2Q8IXJ6 389 aa19.38■□□□□ 0.69
CS-227ENST00000551441 AMOTL1Q8IY63 956 aa19.38■□□□□ 0.69
CS-227ENST00000551441 PPM1EQ8WY54 764 aa19.38■□□□□ 0.69
CS-227ENST00000551441 CCDC17Q96LX7 622 aa19.38■□□□□ 0.69
CS-227ENST00000551441 GOPCQ9HD26 462 aa19.38■□□□□ 0.69
CS-227ENST00000551441 PRDM6Q9NQX0 595 aa19.38■□□□□ 0.69
CS-227ENST00000551441 STARD7Q9NQZ5 370 aa19.38■□□□□ 0.69
CS-227ENST00000551441 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa19.38■□□□□ 0.69
CS-227ENST00000551441 CNPY2Q9Y2B0 182 aa19.38■□□□□ 0.69
CS-227ENST00000551441 RIPK3Q9Y572 518 aa19.38■□□□□ 0.69
CS-227ENST00000551441 GRXCR1A8MXD5 290 aa19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms