RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550672.5

SLC8B1-211, Transcript of solute carrier family 8 member B1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SLC8B1, Length 2,925 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8B1-211ENST00000550672 ABCC12Q96J65 1359 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 IRF6O14896 467 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 MFAP3LO75121 409 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 IRAK1P51617 712 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 CHRNDQ07001 517 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 TRIM29Q14134 588 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 KCNV1Q6PIU1 500 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 MAGEB6Q8N7X4 407 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 MLKLQ8NB16 471 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 BCL9LQ86UU0 1499 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 A0A1B0GTH6 734 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 GYPCP04921 128 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 INPP5BP32019 993 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 ERVK-24P63145 666 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 VPS16Q9H269 839 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 CAPN7Q9Y6W3 813 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 PES1O00541 588 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 CPP00450 1065 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 CAGE1Q8TC20 777 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 MYO1FO00160 1098 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 GNGT1P63211 74 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 UBE3CQ15386 1083 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 NFXL1Q6ZNB6 911 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 TBC1D10CQ8IV04 446 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 AIDAQ96BJ3 306 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 CEP89Q96ST8 783 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 DACH1Q9UI36 760 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 KCNJ14Q9UNX9 436 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SLC8B1-211ENST00000550672 BTBD18B2RXH4 712 aa14.71□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 MYO1BO43795 1136 aa14.71□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 NCOA7Q8NI08 942 aa14.71□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 COG1Q8WTW3 980 aa14.71□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 CHP1Q99653 195 aa14.71□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 SUFUQ9UMX1 484 aa14.71□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 ZNF652Q9Y2D9 606 aa14.71□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 CD44P16070 742 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 SATB1Q01826 763 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 TBC1D9BQ66K14 1250 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 SHTN1A0MZ66 631 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 ZNF185O15231 689 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 USP14P54578 494 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 MORC3Q14149 939 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 FILIP1LQ4L180 1135 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 AMIGO3Q86WK7 504 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 SELENOOQ9BVL4 669 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 SLC26A6Q9BXS9 759 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 ARMT1Q9H993 441 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 GOLGA6BA6NDN3 693 aa14.69□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 N4BP3O15049 544 aa14.69□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 ARHGAP25P42331 645 aa14.69□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 VPS72Q15906 364 aa14.69□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 MAP9Q49MG5 647 aa14.69□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 WDR93Q6P2C0 686 aa14.69□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 CAPS2Q9BXY5 557 aa14.69□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 LRP5O75197 1615 aa14.69□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 AGPSO00116 658 aa14.69□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 PRKAB2O43741 272 aa14.69□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 MBD4O95243 580 aa14.69□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 GYG1P46976 350 aa14.69□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 PLCD1P51178 756 aa14.69□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 ATP2B2Q01814 1243 aa14.69□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 CYB5R4Q7L1T6 521 aa14.69□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 CENPHQ9H3R5 247 aa14.69□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 B4E1Z4 1266 aa14.69□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 ZEB2O60315 1214 aa14.69□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 IARSP41252 1262 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 MAP3K12Q12852 859 aa14.69□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 CNGA4Q8IV77 575 aa14.69□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 MIGA1Q8NAN2 632 aa14.69□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 RNF217Q8TC41 542 aa14.69□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 FAM107BQ9H098 131 aa14.69□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa14.68□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 RREB1Q92766 1687 aa14.68□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 KRT9P35527 623 aa14.68□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP14.68□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 ATP1A2P50993 1020 aa14.68□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 GSCP56915 257 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 CD248Q9HCU0 757 aa14.68□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 USP21Q9UK80 565 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 92.1 ms