RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544999.2

HOXD8-204, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,235 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-204ENST00000544999 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXD8-204ENST00000544999 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP20.12■□□□□ 0.81
HOXD8-204ENST00000544999 ZMYM6O95789 1325 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD8-204ENST00000544999 CCDC171Q6TFL3 1326 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD8-204ENST00000544999 RAD21O60216 631 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD8-204ENST00000544999 SGPL1O95470 568 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD8-204ENST00000544999 TTLL1O95922 423 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD8-204ENST00000544999 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
HOXD8-204ENST00000544999 TFAP4Q01664 338 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD8-204ENST00000544999 FAM83BQ5T0W9 1011 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD8-204ENST00000544999 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
HOXD8-204ENST00000544999 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
HOXD8-204ENST00000544999 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD8-204ENST00000544999 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD8-204ENST00000544999 RPTORQ8N122 1335 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXD8-204ENST00000544999 F5H6K3 240 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXD8-204ENST00000544999 NDUFB10O96000 172 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXD8-204ENST00000544999 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
HOXD8-204ENST00000544999 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
HOXD8-204ENST00000544999 CTDSPL2Q05D32 466 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXD8-204ENST00000544999 KLRC3Q07444 240 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXD8-204ENST00000544999 GRB14Q14449 540 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXD8-204ENST00000544999 FAM47AQ5JRC9 791 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXD8-204ENST00000544999 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
HOXD8-204ENST00000544999 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP20.1■□□□□ 0.81
HOXD8-204ENST00000544999 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXD8-204ENST00000544999 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXD8-204ENST00000544999 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
HOXD8-204ENST00000544999 HIP1O00291 1037 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXD8-204ENST00000544999 FGAP02671 866 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXD8-204ENST00000544999 TRIM32Q13049 653 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXD8-204ENST00000544999 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXD8-204ENST00000544999 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
HOXD8-204ENST00000544999 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
HOXD8-204ENST00000544999 FBXO28Q9NVF7 368 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXD8-204ENST00000544999 ZNF236Q9UL36 1845 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXD8-204ENST00000544999 STRNO43815 780 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXD8-204ENST00000544999 FGRP09769 529 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXD8-204ENST00000544999 ERCC3P19447 782 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXD8-204ENST00000544999 PDE4AP27815 886 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXD8-204ENST00000544999 PLS1Q14651 629 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXD8-204ENST00000544999 TMEM132BQ14DG7 1078 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXD8-204ENST00000544999 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXD8-204ENST00000544999 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXD8-204ENST00000544999 DEFB118Q96PH6 123 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXD8-204ENST00000544999 MROH8Q9H579 483 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXD8-204ENST00000544999 TSPY2A6NKD2 308 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXD8-204ENST00000544999 VWA5AO00534 786 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXD8-204ENST00000544999 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
HOXD8-204ENST00000544999 ORC4O43929 436 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXD8-204ENST00000544999 SLC25A27O95847 323 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXD8-204ENST00000544999 HOXC6P09630 235 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXD8-204ENST00000544999 CCL14Q16627 93 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXD8-204ENST00000544999 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXD8-204ENST00000544999 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
HOXD8-204ENST00000544999 SLF1Q9BQI6 1058 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXD8-204ENST00000544999 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXD8-204ENST00000544999 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXD8-204ENST00000544999 TACC3Q9Y6A5 838 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXD8-204ENST00000544999 TFRCP02786 760 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
HOXD8-204ENST00000544999 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
HOXD8-204ENST00000544999 NCAPG2Q86XI2 1143 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXD8-204ENST00000544999 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
HOXD8-204ENST00000544999 INCENPQ9NQS7 918 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXD8-204ENST00000544999 BRCA2P51587 3418 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXD8-204ENST00000544999 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
HOXD8-204ENST00000544999 ADORA2AP29274 412 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXD8-204ENST00000544999 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
HOXD8-204ENST00000544999 TTC22Q5TAA0 569 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXD8-204ENST00000544999 SLFN13Q68D06 897 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXD8-204ENST00000544999 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
HOXD8-204ENST00000544999 RIOX2Q8IUF8 465 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXD8-204ENST00000544999 ABRAQ8N0Z2 381 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXD8-204ENST00000544999 REPS2Q8NFH8 660 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXD8-204ENST00000544999 NPLOC4Q8TAT6 608 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXD8-204ENST00000544999 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
HOXD8-204ENST00000544999 PCP11498 1178 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
HOXD8-204ENST00000544999 COPB2P35606 906 aa20.04■□□□□ 0.8
HOXD8-204ENST00000544999 MFSD14CQ5VZR4 134 aa20.04■□□□□ 0.8
HOXD8-204ENST00000544999 DPP9Q86TI2 863 aa20.04■□□□□ 0.8
HOXD8-204ENST00000544999 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
HOXD8-204ENST00000544999 IL17RBQ9NRM6 502 aa20.04■□□□□ 0.8
HOXD8-204ENST00000544999 FLRT1Q9NZU1 646 aa20.04■□□□□ 0.8
HOXD8-204ENST00000544999 FEM1BQ9UK73 627 aa20.04■□□□□ 0.8
HOXD8-204ENST00000544999 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
HOXD8-204ENST00000544999 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
HOXD8-204ENST00000544999 STAT3P40763 770 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXD8-204ENST00000544999 NOVP48745 357 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXD8-204ENST00000544999 TOMM22Q9NS69 142 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXD8-204ENST00000544999 SLC5A4Q9NY91 659 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXD8-204ENST00000544999 STX8Q9UNK0 236 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXD8-204ENST00000544999 FCER1AP12319 257 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXD8-204ENST00000544999 BMP3P12645 472 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXD8-204ENST00000544999 HAND2P61296 217 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXD8-204ENST00000544999 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
HOXD8-204ENST00000544999 AKNAD1Q5T1N1 836 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXD8-204ENST00000544999 ANKLE1Q8NAG6 615 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXD8-204ENST00000544999 STAG1Q8WVM7 1258 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXD8-204ENST00000544999 GMCL1Q96IK5 515 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXD8-204ENST00000544999 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.4 ms