RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543088.5

TM7SF3-212, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

TSL 4

Gene TM7SF3, Length 601 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-212ENST00000543088 SHCBP1Q8NEM2 672 aa29.63■■■□□ 2.33
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TM7SF3-212ENST00000543088 SLC15A5A6NIM6 579 aa29.62■■■□□ 2.33
TM7SF3-212ENST00000543088 F5H6K3 240 aa29.62■■■□□ 2.33
TM7SF3-212ENST00000543088 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
TM7SF3-212ENST00000543088 CAPN2P17655 700 aa29.62■■■□□ 2.33
TM7SF3-212ENST00000543088 PDE4AP27815 886 aa29.62■■■□□ 2.33
TM7SF3-212ENST00000543088 GJA8P48165 433 aa29.62■■■□□ 2.33
TM7SF3-212ENST00000543088 KLRC3Q07444 240 aa29.62■■■□□ 2.33
TM7SF3-212ENST00000543088 PLS1Q14651 629 aa29.62■■■□□ 2.33
TM7SF3-212ENST00000543088 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
TM7SF3-212ENST00000543088 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
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TM7SF3-212ENST00000543088 MAP2K5Q13163 448 aa29.61■■■□□ 2.33
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TM7SF3-212ENST00000543088 USP6NLQ92738 828 aa29.61■■■□□ 2.33
TM7SF3-212ENST00000543088 TOMM22Q9NS69 142 aa29.61■■■□□ 2.33
TM7SF3-212ENST00000543088 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa29.61■■■□□ 2.33
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TM7SF3-212ENST00000543088 TRIB2Q92519 343 aa29.6■■■□□ 2.33
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TM7SF3-212ENST00000543088 GRB14Q14449 540 aa29.59■■■□□ 2.33
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TM7SF3-212ENST00000543088 FBXO28Q9NVF7 368 aa29.59■■■□□ 2.33
TM7SF3-212ENST00000543088 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa29.59■■■□□ 2.33
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TM7SF3-212ENST00000543088 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
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TM7SF3-212ENST00000543088 ZNF236Q9UL36 1845 aa29.58■■■□□ 2.33
TM7SF3-212ENST00000543088 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa29.58■■■□□ 2.33
TM7SF3-212ENST00000543088 STX8Q9UNK0 236 aa29.58■■■□□ 2.33
TM7SF3-212ENST00000543088 RPTORQ8N122 1335 aa29.57■■■□□ 2.32
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TM7SF3-212ENST00000543088 SLC25A27O95847 323 aa29.57■■■□□ 2.32
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TM7SF3-212ENST00000543088 ERCC3P19447 782 aa29.57■■■□□ 2.32
TM7SF3-212ENST00000543088 NCAPG2Q86XI2 1143 aa29.57■■■□□ 2.32
TM7SF3-212ENST00000543088 SHISA4Q96DD7 197 aa29.57■■■□□ 2.32
TM7SF3-212ENST00000543088 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
TM7SF3-212ENST00000543088 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
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TM7SF3-212ENST00000543088 TMEM132BQ14DG7 1078 aa29.56■■■□□ 2.32
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TM7SF3-212ENST00000543088 SLC5A4Q9NY91 659 aa29.55■■■□□ 2.32
TM7SF3-212ENST00000543088 FEM1BQ9UK73 627 aa29.55■■■□□ 2.32
TM7SF3-212ENST00000543088 LAMA4Q16363 1823 aa29.55■■■□□ 2.32
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TM7SF3-212ENST00000543088 ABRAQ8N0Z2 381 aa29.53■■■□□ 2.32
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TM7SF3-212ENST00000543088 NT5C2P49902 561 aa29.52■■■□□ 2.32
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TM7SF3-212ENST00000543088 TEX13BQ9BXU2 312 aa29.51■■■□□ 2.31
TM7SF3-212ENST00000543088 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.31
TM7SF3-212ENST00000543088 TACC3Q9Y6A5 838 aa29.51■■■□□ 2.31
TM7SF3-212ENST00000543088 NMT2O60551 498 aa29.5■■■□□ 2.31
TM7SF3-212ENST00000543088 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
TM7SF3-212ENST00000543088 SLC1A4P43007 532 aa29.5■■■□□ 2.31
TM7SF3-212ENST00000543088 STAT2P52630 851 aa29.5■■■□□ 2.31
TM7SF3-212ENST00000543088 REPS2Q8NFH8 660 aa29.5■■■□□ 2.31
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