RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 PDE6AP16499 860 aa6.75□□□□□ -1.33
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PTPRD-214ENST00000540109 VAV2P52735 878 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRD-214ENST00000540109 DRP2Q13474 957 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRD-214ENST00000540109 COL24A1Q17RW2 1714 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRD-214ENST00000540109 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRD-214ENST00000540109 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRD-214ENST00000540109 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRD-214ENST00000540109 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
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PTPRD-214ENST00000540109 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRD-214ENST00000540109 HPDP32754 393 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRD-214ENST00000540109 ATP11AP98196 1134 aa6.75□□□□□ -1.33
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PTPRD-214ENST00000540109 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
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PTPRD-214ENST00000540109 OSBP2Q969R2 916 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRD-214ENST00000540109 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRD-214ENST00000540109 SALL1Q9NSC2 1324 aa6.75□□□□□ -1.33
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PTPRD-214ENST00000540109 A0A1W2PQ64 194 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRD-214ENST00000540109 A0A1W2PQD8 194 aa6.75□□□□□ -1.33
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PTPRD-214ENST00000540109 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
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PTPRD-214ENST00000540109 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
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PTPRD-214ENST00000540109 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
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PTPRD-214ENST00000540109 CCDC77Q9BR77 488 aa6.75□□□□□ -1.33
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PTPRD-214ENST00000540109 TADA2BQ86TJ2 420 aa6.75□□□□□ -1.33
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PTPRD-214ENST00000540109 CCDC51Q96ER9 411 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRD-214ENST00000540109 GBP5Q96PP8 586 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRD-214ENST00000540109 NAPBQ9H115 298 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRD-214ENST00000540109 CLSTN2Q9H4D0 955 aa6.75□□□□□ -1.33
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PTPRD-214ENST00000540109 TMED1Q13445 227 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRD-214ENST00000540109 SEPT2Q15019 361 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRD-214ENST00000540109 TMC4Q7Z404 712 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRD-214ENST00000540109 DONSONQ9NYP3 566 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRD-214ENST00000540109 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRD-214ENST00000540109 MAST2Q6P0Q8 1798 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRD-214ENST00000540109 CETN3O15182 167 aa6.74□□□□□ -1.33
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PTPRD-214ENST00000540109 NECAB1Q8N987 351 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRD-214ENST00000540109 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRD-214ENST00000540109 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRD-214ENST00000540109 OSBPL9Q96SU4 736 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRD-214ENST00000540109 PLVAPQ9BX97 442 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRD-214ENST00000540109 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP6.74□□□□□ -1.33
PTPRD-214ENST00000540109 DACT1Q9NYF0 836 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRD-214ENST00000540109 RCOR1Q9UKL0 485 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRD-214ENST00000540109 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF804BA4D1E1 1349 aa6.74□□□□□ -1.33
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