RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540101.2

C16orf62-211, Transcript of UPF0505 protein C16orf62, humanhuman

TSL 3

Gene C16orf62, Length 461 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf62-211ENST00000540101 IRF6O14896 467 aa9.14□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 ZBTB43O43298 467 aa9.14□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 CTDNEP1O95476 244 aa9.14□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 CALM1P0DP23 149 aa9.14□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 CALM2P0DP24 149 aa9.14□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 CALM3P0DP25 149 aa9.14□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 RXRAP19793 462 aa9.14□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 BACE1P56817 501 aa9.14□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 FGD1P98174 961 aa9.14□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 KLRC3Q07444 240 aa9.14□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 ZNF543Q08ER8 600 aa9.14□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 PPIL2Q13356 520 aa9.14□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 MTMR2Q13614 643 aa9.14□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 NFXL1Q6ZNB6 911 aa9.14□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 TMTC3Q6ZXV5 915 aa9.14□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 CATIPQ7Z7H3 387 aa9.14□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 MICU3Q86XE3 530 aa9.14□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 NECAB1Q8N987 351 aa9.14□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 FANCBQ8NB91 859 aa9.14□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 OTUD5Q96G74 571 aa9.14□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 AS3MTQ9HBK9 375 aa9.14□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa9.14□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 MAD2L2Q9UI95 211 aa9.14□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 DOCK1Q14185 1865 aa9.14□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 TRIM75PA6NK02 468 aa9.13□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 GOLGA8AA7E2F4 631 aa9.13□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 USP17L10C9JJH3 530 aa9.13□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 CXCL11O14625 94 aa9.13□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 PLEKHA8P1O95397 391 aa9.13□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 VCAM1P19320 739 aa9.13□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 ADD1P35611 737 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 TM4SF4P48230 202 aa9.13□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP9.13□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 PPP2R5BQ15173 497 aa9.13□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 SPRYD7Q5W111 196 aa9.13□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 SLFN13Q68D06 897 aa9.13□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 USP17L2Q6R6M4 530 aa9.13□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 NBPF11Q86T75 865 aa9.13□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 STAG2Q8N3U4 1231 aa9.13□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa9.13□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 DCAF4Q8WV16 495 aa9.13□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 LPAR1Q92633 364 aa9.13□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 OPTNQ96CV9 577 aa9.13□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 WNK4Q96J92 1243 aa9.13□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 MS4A4AQ96JQ5 239 aa9.13□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa9.13□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 SH2D4AQ9H788 454 aa9.13□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 C19orf81C9J6K1 198 aa9.12□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 GPR25O00155 361 aa9.12□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 CYTH3O43739 400 aa9.12□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 GOLGA8HP0CJ92 632 aa9.12□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 IFNAR1P17181 557 aa9.12□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 USP14P54578 494 aa9.12□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 HMGCS2P54868 508 aa9.12□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 CCT2P78371 535 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 ATP2B2Q01814 1243 aa9.12□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 SREBF2Q12772 1141 aa9.12□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 STK3Q13188 491 aa9.12□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 RTN1Q16799 776 aa9.12□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 ASPRV1Q53RT3 343 aa9.12□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 BTNL9Q6UXG8 535 aa9.12□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 HSCBQ8IWL3 235 aa9.12□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa9.12□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 SPICE1Q8N0Z3 855 aa9.12□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 NUP133Q8WUM0 1156 aa9.12□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 FEZ1Q99689 392 aa9.12□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa9.11□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 KLRF2D3W0D1 207 aa9.11□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 WDR46O15213 610 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 JAK2O60674 1132 aa9.11□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 PLA2G6O60733 806 aa9.11□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 DTNBO60941 627 aa9.11□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 SLC34A2O95436 690 aa9.11□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 BMP3P12645 472 aa9.11□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 FDPSP14324 419 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 SMARCA1P28370 1054 aa9.11□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 KIF5BP33176 963 aa9.11□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 DDIT3P35638 169 aa9.11□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 SLC1A4P43007 532 aa9.11□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 FAM83BQ5T0W9 1011 aa9.11□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 TTBK2Q6IQ55 1244 aa9.11□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 GPAT2Q6NUI2 795 aa9.11□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 POTEEQ6S8J3 1075 aa9.11□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 CCDC83Q8IWF9 413 aa9.11□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms