RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538758.1

RIMKLB-208, Transcript of ribosomal modification protein rimK like family member B, human

TSL 3

Gene RIMKLB, Length 570 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RIMKLB-208	ENST00000538758	CHST3	Q7LGC8	479 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	IQCA1	Q86XH1	822 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	KCNB2	Q92953	911 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	FLOT1	O75955	427 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	REC8	O95072	547 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	BMP3	P12645	472 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	HSPA4	P34932	840 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	ANTXR2	P58335	489 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	SEC23A	Q15436	765 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	RNF20	Q5VTR2	975 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	ERO1A	Q96HE7	468 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	BTBD7	Q9P203	1132 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	TNKS	O95271	1327 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	TMEM232	C9JQI7	657 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	SLC1A4	P43007	532 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	PSMC4	P43686	418 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	ERVK-9	P63128	1117 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	ERVK-24	P63145	666 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	KIF22	Q14807	665 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	KCTD1	Q719H9	257 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	ATG4C	Q96DT6	458 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	GMCL1	Q96IK5	515 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	EFCC1	Q9HA90	598 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	SENP2	Q9HC62	589 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	FEM1B	Q9UK73	627 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	MTMR7	Q9Y216	660 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	RLF	Q13129	1914 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	PLA2G6	O60733	806 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	SEC24B	O95487	1268 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	MCM5	P33992	734 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	PNMA1	Q8ND90	353 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	DCAF4	Q8WV16	495 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	TRIM47	Q96LD4	638 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	NEK1	Q96PY6	1258 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	KAT14	Q9H8E8	782 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	TRIM17	Q9Y577	477 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	MYPN	Q86TC9	1320 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RIMKLB-208	ENST00000538758	VWA5A	O00534	786 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RIMKLB-208	ENST00000538758	PRC1	O43663	620 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RIMKLB-208	ENST00000538758	SNHG28	P0DPA3	235 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RIMKLB-208	ENST00000538758	PDHB	P11177	359 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RIMKLB-208	ENST00000538758	FCGRT	P55899	365 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RIMKLB-208	ENST00000538758	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RIMKLB-208	ENST00000538758	WTAP	Q15007	396 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RIMKLB-208	ENST00000538758	ARHGEF6	Q15052	776 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RIMKLB-208	ENST00000538758	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RIMKLB-208	ENST00000538758	MB21D1	Q8N884	522 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RIMKLB-208	ENST00000538758	REPS2	Q8NFH8	660 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RIMKLB-208	ENST00000538758	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RIMKLB-208	ENST00000538758	KIFC2	Q96AC6	838 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RIMKLB-208	ENST00000538758	MTA3	Q9BTC8	594 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RIMKLB-208	ENST00000538758	PORCN	Q9H237	461 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RIMKLB-208	ENST00000538758	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RIMKLB-208	ENST00000538758	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RIMKLB-208	ENST00000538758	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
RIMKLB-208	ENST00000538758	ERICH2	A1L162	156 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RIMKLB-208	ENST00000538758	ZBED4	O75132	1171 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RIMKLB-208	ENST00000538758	GNRH1	P01148	92 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RIMKLB-208	ENST00000538758	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RIMKLB-208	ENST00000538758	HOXD10	P28358	340 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RIMKLB-208	ENST00000538758	SLC16A2	P36021	539 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RIMKLB-208	ENST00000538758	STAT2	P52630	851 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RIMKLB-208	ENST00000538758	ZNF543	Q08ER8	600 aa		10.76	□□□□□ -0.69

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