RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531951.5

PUF60-217, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 3

Gene PUF60, Length 973 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-217ENST00000531951 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
PUF60-217ENST00000531951 GTF3C6Q969F1 213 aa22■■□□□ 1.11
PUF60-217ENST00000531951 CREBZFQ9NS37 354 aa22■■□□□ 1.11
PUF60-217ENST00000531951 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PUF60-217ENST00000531951 SLC1A4P43007 532 aa21.99■■□□□ 1.11
PUF60-217ENST00000531951 CCT2P78371 535 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PUF60-217ENST00000531951 ZNF543Q08ER8 600 aa21.99■■□□□ 1.11
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PUF60-217ENST00000531951 DGKZQ13574 1117 aa21.99■■□□□ 1.11
PUF60-217ENST00000531951 ASPRV1Q53RT3 343 aa21.99■■□□□ 1.11
PUF60-217ENST00000531951 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
PUF60-217ENST00000531951 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
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PUF60-217ENST00000531951 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
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PUF60-217ENST00000531951 BMP3P12645 472 aa21.98■■□□□ 1.11
PUF60-217ENST00000531951 CDC27P30260 824 aa21.98■■□□□ 1.11
PUF60-217ENST00000531951 SNAPC2Q13487 334 aa21.98■■□□□ 1.11
PUF60-217ENST00000531951 BECN1Q14457 450 aa21.98■■□□□ 1.11
PUF60-217ENST00000531951 CCDC96Q2M329 555 aa21.98■■□□□ 1.11
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PUF60-217ENST00000531951 CHMP4CQ96CF2 233 aa21.98■■□□□ 1.11
PUF60-217ENST00000531951 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
PUF60-217ENST00000531951 TMOD4Q9NZQ9 345 aa21.98■■□□□ 1.11
PUF60-217ENST00000531951 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa21.97■■□□□ 1.11
PUF60-217ENST00000531951 SLC10A3P09131 477 aa21.97■■□□□ 1.11
PUF60-217ENST00000531951 VCAM1P19320 739 aa21.97■■□□□ 1.11
PUF60-217ENST00000531951 ST3GAL1Q11201 340 aa21.97■■□□□ 1.11
PUF60-217ENST00000531951 STAG2Q8N3U4 1231 aa21.97■■□□□ 1.11
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PUF60-217ENST00000531951 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
PUF60-217ENST00000531951 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
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PUF60-217ENST00000531951 GTF2A2P52657 109 aa21.96■■□□□ 1.11
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PUF60-217ENST00000531951 KCTD1Q719H9 257 aa21.96■■□□□ 1.11
PUF60-217ENST00000531951 A0A0G2JMZ2 1700 aa21.95■■□□□ 1.1
PUF60-217ENST00000531951 KLRF2D3W0D1 207 aa21.95■■□□□ 1.1
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PUF60-217ENST00000531951 CCDC83Q8IWF9 413 aa21.95■■□□□ 1.1
PUF60-217ENST00000531951 CCDC102AQ96A19 550 aa21.95■■□□□ 1.1
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PUF60-217ENST00000531951 GPCPD1Q9NPB8 672 aa21.95■■□□□ 1.1
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PUF60-217ENST00000531951 RASSF10A6NK89 507 aa21.94■■□□□ 1.1
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PUF60-217ENST00000531951 TTBK2Q6IQ55 1244 aa21.92■■□□□ 1.1
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PUF60-217ENST00000531951 CHURC1Q8WUH1 139 aa21.91■■□□□ 1.1
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