RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519674.1

TRPS1-209, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 3,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-209ENST00000519674 ECEL1O95672 775 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-209ENST00000519674 GOLGA6DP0CG33 693 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-209ENST00000519674 PHKA1P46020 1223 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-209ENST00000519674 NCAPHQ15003 741 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-209ENST00000519674 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-209ENST00000519674 SUSD4Q5VX71 490 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-209ENST00000519674 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-209ENST00000519674 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-209ENST00000519674 MFN1Q8IWA4 741 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-209ENST00000519674 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-209ENST00000519674 ENGASEQ8NFI3 743 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-209ENST00000519674 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa9.5□□□□□ -0.89
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TRPS1-209ENST00000519674 TBC1D5Q92609 795 aa9.5□□□□□ -0.89
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TRPS1-209ENST00000519674 AGXT2Q9BYV1 514 aa9.5□□□□□ -0.89
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TRPS1-209ENST00000519674 FUKQ8N0W3 1084 aa9.49□□□□□ -0.89
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TRPS1-209ENST00000519674 PHLPP1O60346 1717 aa9.48□□□□□ -0.89
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TRPS1-209ENST00000519674 SLC30A9Q6PML9 568 aa9.48□□□□□ -0.89
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TRPS1-209ENST00000519674 ZNF532Q9HCE3 1301 aa9.47□□□□□ -0.89
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TRPS1-209ENST00000519674 CAMTA2O94983 1202 aa9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-209ENST00000519674 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-209ENST00000519674 IFFO1Q0D2I5 559 aa9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-209ENST00000519674 C6orf89Q6UWU4 347 aa9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-209ENST00000519674 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
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