RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519227.1

NSMAF-208, Transcript of neutral sphingomyelinase activation associated factor, human

TSL 4

Gene NSMAF, Length 583 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NSMAF-208	ENST00000519227	PSMA5	P28066	241 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	SLC4A3	P48751	1232 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	MOGS	Q13724	837 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	PLS1	Q14651	629 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	WDR78	Q5VTH9	848 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	DGKH	Q86XP1	1220 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	ERO1A	Q96HE7	468 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	NEK1	Q96PY6	1258 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	CCDC69	A6NI79	296 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	TMEM232	C9JQI7	657 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	PRC1	O43663	620 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	ZBED4	O75132	1171 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	HERVK_113	P62684	666 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	KIFC2	Q96AC6	838 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	USP26	Q9BXU7	913 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	FEM1B	Q9UK73	627 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	HSPA4	P34932	840 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	CCNA1	P78396	465 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	KCTD1	Q719H9	257 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	TMTC2	Q8N394	836 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	PNMA1	Q8ND90	353 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	DCAF4	Q8WV16	495 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	HOXD10	P28358	340 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	STAT2	P52630	851 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	FCGRT	P55899	365 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	C17orf99	Q6UX52	265 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	FAM160B2	Q86V87	743 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	RASEF	Q8IZ41	740 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	TMEM87B	Q96K49	555 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	EFCC1	Q9HA90	598 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NSMAF-208	ENST00000519227	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
NSMAF-208	ENST00000519227	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
NSMAF-208	ENST00000519227	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
NSMAF-208	ENST00000519227	PSMC4	P43686	418 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NSMAF-208	ENST00000519227	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NSMAF-208	ENST00000519227	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
NSMAF-208	ENST00000519227	CPXCR1	Q8N123	301 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NSMAF-208	ENST00000519227	MB21D1	Q8N884	522 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NSMAF-208	ENST00000519227	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
NSMAF-208	ENST00000519227	COA7	Q96BR5	231 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NSMAF-208	ENST00000519227	ATG4C	Q96DT6	458 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NSMAF-208	ENST00000519227	GMCL1	Q96IK5	515 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NSMAF-208	ENST00000519227	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NSMAF-208	ENST00000519227	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NSMAF-208	ENST00000519227	TRIM17	Q9Y577	477 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NSMAF-208	ENST00000519227	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NSMAF-208	ENST00000519227	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
NSMAF-208	ENST00000519227	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NSMAF-208	ENST00000519227	ERVK-9	P63128	1117 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NSMAF-208	ENST00000519227	ERVK-24	P63145	666 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NSMAF-208	ENST00000519227	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
NSMAF-208	ENST00000519227	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NSMAF-208	ENST00000519227	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NSMAF-208	ENST00000519227	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
NSMAF-208	ENST00000519227	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
NSMAF-208	ENST00000519227	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
NSMAF-208	ENST00000519227	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NSMAF-208	ENST00000519227	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		11.13	□□□□□ -0.63

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