RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518136.3

HOXA13-202, Transcript of homeobox A13, humanhuman

TSL 2

Gene HOXA13, Length 871 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13-202ENST00000518136 USP40Q9NVE5 1235 aa9.9□□□□□ -0.82
HOXA13-202ENST00000518136 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa9.9□□□□□ -0.82
HOXA13-202ENST00000518136 PHIPQ8WWQ0 1821 aa9.9□□□□□ -0.82
HOXA13-202ENST00000518136 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 FAM187AA6NFU0 413 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 USP17L12C9JPN9 530 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 USP17L21D6R901 530 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 E7EWF7 191 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 WNT10BO00744 389 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 GRIN3BO60391 1043 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 ADH1CP00326 375 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 APPP05067 770 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 SMPD1P17405 629 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 EPS15P42566 896 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 PLCD1P51178 756 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 PPARAQ07869 468 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 NBPF20Q3BBV1 942 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 SBK1Q52WX2 424 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 GIMAP6Q6P9H5 292 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 TTC14Q96N46 770 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 IDI2Q9BXS1 227 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 NAPBQ9H115 298 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 MYOZ2Q9NPC6 264 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 GPRC5DQ9NZD1 345 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 PGAP2Q9UHJ9 254 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 ANAPC4Q9UJX5 808 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 MYH6P13533 1939 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 ATRNL1Q5VV63 1379 aa9.88□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 DOCK1Q14185 1865 aa9.88□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 CLRN2A0PK11 232 aa9.88□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 POTECB2RU33 542 aa9.88□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 BAG3O95817 575 aa9.88□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 FGRP09769 529 aa9.88□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 GRM5P41594 1212 aa9.88□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 TDO2P48775 406 aa9.88□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 ANTXR2P58335 489 aa9.88□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 SEMA3FQ13275 785 aa9.88□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 PICALMQ13492 652 aa9.88□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 C12orf60Q5U649 245 aa9.88□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 SLC44A5Q8NCS7 719 aa9.88□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 TCEANC2Q96MN5 208 aa9.88□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP9.88□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 USP5P45974 858 aa9.87□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP9.87□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 GABPAQ06546 454 aa9.87□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 NR5A1Q13285 461 aa9.87□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 DLGAP5Q15398 846 aa9.87□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa9.87□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 PKDCCQ504Y2 493 aa9.87□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 CYB5R4Q7L1T6 521 aa9.87□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 STAG1Q8WVM7 1258 aa9.87□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 DYNLL2Q96FJ2 89 aa9.87□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 TM6SF1Q9BZW5 370 aa9.87□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 DNAJC18Q9H819 358 aa9.87□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 MCM9Q9NXL9 1143 aa9.87□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 CTNNA3Q9UI47 895 aa9.87□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 HDAC9Q9UKV0 1011 aa9.87□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 PTPRFP10586 1907 aa9.87□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 SSC5DA1L4H1 1573 aa9.87□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 POM121CA8CG34 1229 aa9.86□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 MINDY4BA8MYZ0 360 aa9.86□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 TRAK2O60296 914 aa9.86□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 CASTP20810 708 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 MCCP23508 829 aa9.86□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 FSHRP23945 695 aa9.86□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 SOX11P35716 441 aa9.86□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 TCP10Q12799 353 aa9.86□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 NNTQ13423 1086 aa9.86□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 RABEP1Q15276 862 aa9.86□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 CERS3Q8IU89 383 aa9.86□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 STK11IPQ8N1F8 1099 aa9.86□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 NACAP1Q9BZK3 213 aa9.86□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 GLTPD2A6NH11 291 aa9.85□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 FAM196BA6NMK8 535 aa9.85□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 B4E1Z4 1266 aa9.85□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 TCP10L2B9ZVM9 353 aa9.85□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 ZNF213O14771 459 aa9.85□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 PRDM1O75626 825 aa9.85□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 DGAT1O75907 488 aa9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms