RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517323.2

TRPS1-206, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5

Gene TRPS1, Length 2,171 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-206ENST00000517323 CALM3P0DP25 149 aa18.01■□□□□ 0.47
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TRPS1-206ENST00000517323 PKN1Q16512 942 aa18.01■□□□□ 0.47
TRPS1-206ENST00000517323 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP18.01■□□□□ 0.47
TRPS1-206ENST00000517323 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP18.01■□□□□ 0.47
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TRPS1-206ENST00000517323 KCNJ14Q9UNX9 436 aa18.01■□□□□ 0.47
TRPS1-206ENST00000517323 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa18.01■□□□□ 0.47
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TRPS1-206ENST00000517323 MKL1Q969V6 931 aa18.01■□□□□ 0.47
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TRPS1-206ENST00000517323 ZNF543Q08ER8 600 aa18■□□□□ 0.47
TRPS1-206ENST00000517323 SPP2Q13103 211 aa18■□□□□ 0.47
TRPS1-206ENST00000517323 MTMR2Q13614 643 aa18■□□□□ 0.47
TRPS1-206ENST00000517323 FEZ1Q99689 392 aa18■□□□□ 0.47
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TRPS1-206ENST00000517323 SCYL3Q8IZE3 742 aa18■□□□□ 0.47
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TRPS1-206ENST00000517323 CEP350Q5VT06 3117 aa17.94■□□□□ 0.46
TRPS1-206ENST00000517323 SCG2P13521 617 aa17.93■□□□□ 0.46
TRPS1-206ENST00000517323 IREB2P48200 963 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
TRPS1-206ENST00000517323 DCAF4Q8WV16 495 aa17.93■□□□□ 0.46
TRPS1-206ENST00000517323 KIFC2Q96AC6 838 aa17.93■□□□□ 0.46
TRPS1-206ENST00000517323 GMCL1Q96IK5 515 aa17.93■□□□□ 0.46
TRPS1-206ENST00000517323 CSADQ9Y600 493 aa17.93■□□□□ 0.46
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