RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515011.5

PDE4D-223, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,175 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-223ENST00000515011 POSTNQ15063 836 aa26.11■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 KANK3Q6NY19 840 aa26.11■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 USP49Q70CQ1 688 aa26.11■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 C10orf71Q711Q0 1435 aa26.11■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 SWAP70Q9UH65 585 aa26.11■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 M0R2N6 131 aa26.1■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 NCAPHQ15003 741 aa26.1■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 CCDC186Q7Z3E2 898 aa26.1■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 MYH8P13535 1937 aa26.1■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 STXBP3O00186 592 aa26.1■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 FOXN1O15353 648 aa26.1■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 PTGDRQ13258 359 aa26.1■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 NT5DC1Q5TFE4 455 aa26.1■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa26.09■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 GOLGA8HP0CJ92 632 aa26.09■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 STRIP1Q5VSL9 837 aa26.09■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 RASGRP2Q7LDG7 609 aa26.09■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 CNKSR1Q969H4 720 aa26.09■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 CAMKK2Q96RR4 588 aa26.09■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 MRIQ9BWK5 157 aa26.09■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 CRKP46108 304 aa26.09■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 TPM4P67936 248 aa26.09■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 ISM2Q6H9L7 571 aa26.09■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa26.09■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 ZDHHC15Q96MV8 337 aa26.09■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 MTMR4Q9NYA4 1195 aa26.09■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 NRBP1Q9UHY1 535 aa26.09■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 SERPINB13Q9UIV8 391 aa26.09■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 KCNQ5Q9NR82 932 aa26.08■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 STK32BQ9NY57 414 aa26.08■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 CHRNA5P30532 468 aa26.07■■□□□ 1.76
PDE4D-223ENST00000515011 PDILTQ8N807 584 aa26.07■■□□□ 1.76
PDE4D-223ENST00000515011 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
PDE4D-223ENST00000515011 ECE2O60344 883 aa26.07■■□□□ 1.76
PDE4D-223ENST00000515011 AKR1B1P15121 316 aa26.07■■□□□ 1.76
PDE4D-223ENST00000515011 SARSP49591 514 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
PDE4D-223ENST00000515011 DACT2Q5SW24 774 aa26.07■■□□□ 1.76
PDE4D-223ENST00000515011 USP17L2Q6R6M4 530 aa26.07■■□□□ 1.76
PDE4D-223ENST00000515011 KIAA1524Q8TCG1 905 aa26.07■■□□□ 1.76
PDE4D-223ENST00000515011 EPSTI1Q96J88 318 aa26.07■■□□□ 1.76
PDE4D-223ENST00000515011 SCN9AQ15858 1988 aa26.07■■□□□ 1.76
PDE4D-223ENST00000515011 PRR29P0C7W0 189 aa26.06■■□□□ 1.76
PDE4D-223ENST00000515011 C7orf43Q8WVR3 580 aa26.06■■□□□ 1.76
PDE4D-223ENST00000515011 SPTLC3Q9NUV7 552 aa26.06■■□□□ 1.76
PDE4D-223ENST00000515011 MAN1B1Q9UKM7 699 aa26.06■■□□□ 1.76
PDE4D-223ENST00000515011 PYCARDQ9ULZ3 195 aa26.06■■□□□ 1.76
PDE4D-223ENST00000515011 PCDHA6Q9UN73 950 aa26.06■■□□□ 1.76
PDE4D-223ENST00000515011 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa26.06■■□□□ 1.76
PDE4D-223ENST00000515011 A0A087X0B3 334 aa26.06■■□□□ 1.76
PDE4D-223ENST00000515011 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
PDE4D-223ENST00000515011 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP26.06■■□□□ 1.76
PDE4D-223ENST00000515011 CCDC34Q96HJ3 373 aa26.06■■□□□ 1.76
PDE4D-223ENST00000515011 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
PDE4D-223ENST00000515011 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
PDE4D-223ENST00000515011 HLA-DOAP06340 250 aa26.05■■□□□ 1.76
PDE4D-223ENST00000515011 MCM7P33993 719 aa26.05■■□□□ 1.76
PDE4D-223ENST00000515011 CCDC144BQ3MJ40 725 aa26.05■■□□□ 1.76
PDE4D-223ENST00000515011 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
PDE4D-223ENST00000515011 TRIML1Q8N9V2 468 aa26.05■■□□□ 1.76
PDE4D-223ENST00000515011 SMARCE1Q969G3 411 aa26.05■■□□□ 1.76
PDE4D-223ENST00000515011 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
PDE4D-223ENST00000515011 EHD4Q9H223 541 aa26.05■■□□□ 1.76
PDE4D-223ENST00000515011 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa26.05■■□□□ 1.76
PDE4D-223ENST00000515011 VWA3AA6NCI4 1184 aa26.05■■□□□ 1.76
PDE4D-223ENST00000515011 SLFN14P0C7P3 912 aa26.05■■□□□ 1.76
PDE4D-223ENST00000515011 PDHBP11177 359 aa26.05■■□□□ 1.76
PDE4D-223ENST00000515011 BMP6P22004 513 aa26.05■■□□□ 1.76
PDE4D-223ENST00000515011 SHMT1P34896 483 aa26.05■■□□□ 1.76
PDE4D-223ENST00000515011 MYL5Q02045 173 aa26.05■■□□□ 1.76
PDE4D-223ENST00000515011 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
PDE4D-223ENST00000515011 SPATA20Q8TB22 786 aa26.05■■□□□ 1.76
PDE4D-223ENST00000515011 RASGRP4Q8TDF6 673 aa26.05■■□□□ 1.76
PDE4D-223ENST00000515011 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
PDE4D-223ENST00000515011 ZMYND12Q9H0C1 365 aa26.05■■□□□ 1.76
PDE4D-223ENST00000515011 CPVLQ9H3G5 476 aa26.05■■□□□ 1.76
PDE4D-223ENST00000515011 USP17L5A8MUK1 530 aa26.04■■□□□ 1.76
PDE4D-223ENST00000515011 NFIAQ12857 509 aa26.04■■□□□ 1.76
PDE4D-223ENST00000515011 C4orf32Q8N8J7 132 aa26.04■■□□□ 1.76
PDE4D-223ENST00000515011 DHX58Q96C10 678 aa26.04■■□□□ 1.76
PDE4D-223ENST00000515011 SNHG28P0DPA3 235 aa26.03■■□□□ 1.76
PDE4D-223ENST00000515011 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa26.03■■□□□ 1.76
PDE4D-223ENST00000515011 KIAA0825Q8IV33 1275 aa26.03■■□□□ 1.76
PDE4D-223ENST00000515011 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa26.03■■□□□ 1.76
PDE4D-223ENST00000515011 HSD3B7Q9H2F3 369 aa26.03■■□□□ 1.76
PDE4D-223ENST00000515011 MORC3Q14149 939 aa26.03■■□□□ 1.76
PDE4D-223ENST00000515011 ASPRV1Q53RT3 343 aa26.03■■□□□ 1.76
PDE4D-223ENST00000515011 RIOX1Q9H6W3 641 aa26.03■■□□□ 1.76
PDE4D-223ENST00000515011 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
PDE4D-223ENST00000515011 TTLL1O95922 423 aa26.02■■□□□ 1.76
PDE4D-223ENST00000515011 NAPAP54920 295 aa26.02■■□□□ 1.76
PDE4D-223ENST00000515011 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa26.02■■□□□ 1.76
PDE4D-223ENST00000515011 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
PDE4D-223ENST00000515011 IL17AQ16552 155 aa26.02■■□□□ 1.76
PDE4D-223ENST00000515011 SIPA1L1O43166 1804 aa26.01■■□□□ 1.75
PDE4D-223ENST00000515011 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
PDE4D-223ENST00000515011 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
PDE4D-223ENST00000515011 MLKLQ8NB16 471 aa26.01■■□□□ 1.75
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