RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513521.1

USP9YP1-201, Transcript of USP9Y pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene USP9YP1, Length 1,002 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YP1-201ENST00000513521 ADCY4Q8NFM4 1077 aa11.03□□□□□ -0.64
USP9YP1-201ENST00000513521 PPP1R14AQ96A00 147 aa11.03□□□□□ -0.64
USP9YP1-201ENST00000513521 DBNDD2Q9BQY9 259 aa11.03□□□□□ -0.64
USP9YP1-201ENST00000513521 LGR4Q9BXB1 951 aa11.03□□□□□ -0.64
USP9YP1-201ENST00000513521 LEMD3Q9Y2U8 911 aa11.03□□□□□ -0.64
USP9YP1-201ENST00000513521 ESYT3A0FGR9 886 aa11.02□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP11.02□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 ADCY3O60266 1144 aa11.02□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 PPM1BO75688 479 aa11.02□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 SQSTM1Q13501 440 aa11.02□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 SGSM3Q96HU1 749 aa11.02□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 KCNH3Q9ULD8 1083 aa11.02□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa11.02□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa11.02□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 A0A1W2PQU0 124 aa11.01□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 ZNF445P59923 1031 aa11.01□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa11.01□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 GPAT2Q6NUI2 795 aa11.01□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 TMC3Q7Z5M5 1100 aa11.01□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 ZNF227Q86WZ6 799 aa11.01□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 MFSD4AQ8N468 514 aa11.01□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 BRF1Q92994 677 aa11.01□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 FANCLQ9NW38 375 aa11.01□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 TMEM260Q9NX78 707 aa11.01□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 GFOD1Q9NXC2 390 aa11.01□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 LRP2BPQ9P2M1 347 aa11.01□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa11.01□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 U3KQE9 123 aa11.01□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 GNAT3A8MTJ3 354 aa11□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 ITGAVP06756 1048 aa11□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 H2AFB1P0C5Y9 115 aa11□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 H2AFB2P0C5Z0 115 aa11□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 FAM153BP0C7A2 387 aa11□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 HSD3B2P26439 372 aa11□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 DUSP27Q5VZP5 1158 aa11□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 LRRN4CLQ8ND94 238 aa11□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 BVESQ8NE79 360 aa11□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 SHKBP1Q8TBC3 707 aa11□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 FHOD1Q9Y613 1164 aa11□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 WDR64B1ANS9 1081 aa10.99□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 CDC45O75419 566 aa10.99□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 IGLV1-40P01703 118 aa10.99□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 FSTP19883 344 aa10.99□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 TNK2Q07912 1038 aa10.99□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 ARHGEF4Q9NR80 690 aa10.99□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 PRR13Q9NZ81 148 aa10.99□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 SIGLEC6O43699 453 aa10.98□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 PROCP04070 461 aa10.98□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 PPP2R2AP63151 447 aa10.98□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 HOMER1Q86YM7 354 aa10.98□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 FAM181AQ8N9Y4 354 aa10.98□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 APPBP2Q92624 585 aa10.98□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa10.98□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 A0A087WZG4 1122 aa10.97□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 SHISA3A0PJX4 238 aa10.97□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 GSC2O15499 205 aa10.97□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 TBX1O43435 398 aa10.97□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 PRAMEF1O95521 474 aa10.97□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 OXCT1P55809 520 aa10.97□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa10.97□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 FIBCD1Q8N539 461 aa10.97□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 ATG3Q9NT62 314 aa10.97□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 MINPP1Q9UNW1 487 aa10.97□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 AKT3Q9Y243 479 aa10.97□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 EMC9Q9Y3B6 208 aa10.97□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 NOP56O00567 594 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 ITIH2P19823 946 aa10.96□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 PPP2R5DQ14738 602 aa10.96□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 LONRF2Q1L5Z9 754 aa10.96□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 NKAPLQ5M9Q1 402 aa10.96□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 ZNF662Q6ZS27 426 aa10.96□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa10.96□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 MRGPRX3Q96LB0 322 aa10.96□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 SPOCK3Q9BQ16 436 aa10.96□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 DSCC1Q9BVC3 393 aa10.96□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 CHST7Q9NS84 486 aa10.96□□□□□ -0.65
USP9YP1-201ENST00000513521 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
USP9YP1-201ENST00000513521 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
USP9YP1-201ENST00000513521 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa10.95□□□□□ -0.66
USP9YP1-201ENST00000513521 TMEM67Q5HYA8 995 aa10.95□□□□□ -0.66
USP9YP1-201ENST00000513521 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa10.95□□□□□ -0.66
USP9YP1-201ENST00000513521 TRIM59Q8IWR1 403 aa10.95□□□□□ -0.66
USP9YP1-201ENST00000513521 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
USP9YP1-201ENST00000513521 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa10.95□□□□□ -0.66
USP9YP1-201ENST00000513521 MEIS1O00470 390 aa10.94□□□□□ -0.66
USP9YP1-201ENST00000513521 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP10.94□□□□□ -0.66
USP9YP1-201ENST00000513521 NKPD1Q17RQ9 610 aa10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85.8 ms