RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511316.1

HMGB2-205, Transcript of high mobility group box 2, humanhuman

TSL 2

Gene HMGB2, Length 1,841 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2-205ENST00000511316 LAMA4Q16363 1823 aa14.71□□□□□ -0.06
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HMGB2-205ENST00000511316 TEX35Q5T0J7 233 aa14.66□□□□□ -0.06
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HMGB2-205ENST00000511316 MAP3K9P80192 1104 aa14.66□□□□□ -0.06
HMGB2-205ENST00000511316 MYL5Q02045 173 aa14.66□□□□□ -0.06
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HMGB2-205ENST00000511316 VGLL4Q14135 290 aa14.66□□□□□ -0.06
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HMGB2-205ENST00000511316 KMT5BQ4FZB7 885 aa14.66□□□□□ -0.06
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HMGB2-205ENST00000511316 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.065e-67■□□□□ 9.1
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HMGB2-205ENST00000511316 TMC6Q7Z403 805 aa14.65□□□□□ -0.06
HMGB2-205ENST00000511316 NBPF11Q86T75 865 aa14.65□□□□□ -0.06
HMGB2-205ENST00000511316 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa14.65□□□□□ -0.06
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HMGB2-205ENST00000511316 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HMGB2-205ENST00000511316 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.061e-25■■■■■ 32.6
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