RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503080.1

UBE2B-203, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 2

Gene UBE2B, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-203ENST00000503080 TEKQ02763 1124 aa7.01□□□□□ -1.29
UBE2B-203ENST00000503080 MLANAQ16655 118 aa7.01□□□□□ -1.29
UBE2B-203ENST00000503080 USHBP1Q8N6Y0 703 aa7.01□□□□□ -1.29
UBE2B-203ENST00000503080 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
UBE2B-203ENST00000503080 PDZD8Q8NEN9 1154 aa7.01□□□□□ -1.29
UBE2B-203ENST00000503080 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
UBE2B-203ENST00000503080 TM9SF2Q99805 663 aa7.01□□□□□ -1.29
UBE2B-203ENST00000503080 GINM1Q9NU53 330 aa7.01□□□□□ -1.29
UBE2B-203ENST00000503080 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
UBE2B-203ENST00000503080 PRAMEF1O95521 474 aa7□□□□□ -1.29
UBE2B-203ENST00000503080 C8AP07357 584 aa7□□□□□ -1.29
UBE2B-203ENST00000503080 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP7□□□□□ -1.293e-17■■■□□ 15.4
UBE2B-203ENST00000503080 OXR1Q8N573 874 aa7□□□□□ -1.29
UBE2B-203ENST00000503080 TCTN2Q96GX1 697 aa7□□□□□ -1.29
UBE2B-203ENST00000503080 DHRS1Q96LJ7 313 aa7□□□□□ -1.29
UBE2B-203ENST00000503080 C19orf44Q9H6X5 657 aa7□□□□□ -1.29
UBE2B-203ENST00000503080 MINPP1Q9UNW1 487 aa7□□□□□ -1.29
UBE2B-203ENST00000503080 SIGLEC6O43699 453 aa6.99□□□□□ -1.29
UBE2B-203ENST00000503080 RPL10P27635 214 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
UBE2B-203ENST00000503080 AUHQ13825 339 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
UBE2B-203ENST00000503080 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
UBE2B-203ENST00000503080 CCDC81Q6ZN84 652 aa6.99□□□□□ -1.29
UBE2B-203ENST00000503080 RNF111Q6ZNA4 994 aa6.99□□□□□ -1.29
UBE2B-203ENST00000503080 RUFY4Q6ZNE9 571 aa6.99□□□□□ -1.29
UBE2B-203ENST00000503080 PRR23BQ6ZRT6 265 aa6.99□□□□□ -1.29
UBE2B-203ENST00000503080 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
UBE2B-203ENST00000503080 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
UBE2B-203ENST00000503080 GPRASP2Q96D09 838 aa6.99□□□□□ -1.29
UBE2B-203ENST00000503080 SPATA32Q96LK8 384 aa6.99□□□□□ -1.29
UBE2B-203ENST00000503080 FOXP3Q9BZS1 431 aa6.99□□□□□ -1.29
UBE2B-203ENST00000503080 SP110Q9HB58 689 aa6.99□□□□□ -1.29
UBE2B-203ENST00000503080 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
UBE2B-203ENST00000503080 EBF1Q9UH73 591 aa6.99□□□□□ -1.29
UBE2B-203ENST00000503080 FBXL21Q9UKT6 434 aa6.99□□□□□ -1.29
UBE2B-203ENST00000503080 TCFL5Q9UL49 500 aa6.99□□□□□ -1.29
UBE2B-203ENST00000503080 EFR3BQ9Y2G0 817 aa6.99□□□□□ -1.29
UBE2B-203ENST00000503080 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
UBE2B-203ENST00000503080 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa6.99□□□□□ -1.29
UBE2B-203ENST00000503080 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa6.98□□□□□ -1.29
UBE2B-203ENST00000503080 C9IYK1 514 aa6.98□□□□□ -1.29
UBE2B-203ENST00000503080 GUCY2CP25092 1073 aa6.98□□□□□ -1.29
UBE2B-203ENST00000503080 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
UBE2B-203ENST00000503080 DUSP4Q13115 394 aa6.98□□□□□ -1.29
UBE2B-203ENST00000503080 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
UBE2B-203ENST00000503080 LCE3BQ5TA77 95 aa6.98□□□□□ -1.29
UBE2B-203ENST00000503080 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
UBE2B-203ENST00000503080 LINC00116Q8NCU8 138 aa6.98□□□□□ -1.29
UBE2B-203ENST00000503080 CRBNQ96SW2 442 aa6.98□□□□□ -1.29
UBE2B-203ENST00000503080 CHST7Q9NS84 486 aa6.98□□□□□ -1.29
UBE2B-203ENST00000503080 GFOD1Q9NXC2 390 aa6.98□□□□□ -1.29
UBE2B-203ENST00000503080 ZNF281Q9Y2X9 895 aa6.98□□□□□ -1.29
UBE2B-203ENST00000503080 FITM1A5D6W6 292 aa6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-203ENST00000503080 MEIS1O00470 390 aa6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-203ENST00000503080 SYPP08247 313 aa6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-203ENST00000503080 SOX9P48436 509 aa6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-203ENST00000503080 MESP2Q0VG99 397 aa6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-203ENST00000503080 TIGD5Q53EQ6 642 aa6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-203ENST00000503080 UNC5AQ6ZN44 842 aa6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-203ENST00000503080 WAPLQ7Z5K2 1190 aa6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-203ENST00000503080 SPPL2CQ8IUH8 684 aa6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-203ENST00000503080 KSR1Q8IVT5 923 aa6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-203ENST00000503080 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-203ENST00000503080 RASGRP4Q8TDF6 673 aa6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-203ENST00000503080 LINC01599Q8WXQ3 324 aa6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-203ENST00000503080 DIRC2Q96SL1 478 aa6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-203ENST00000503080 ZMYM5Q9UJ78 669 aa6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-203ENST00000503080 FKTNO75072 461 aa6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-203ENST00000503080 PMS1P54277 932 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-203ENST00000503080 NR0B2Q15466 257 aa6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-203ENST00000503080 ZNF124Q15973 351 aa6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-203ENST00000503080 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-203ENST00000503080 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-203ENST00000503080 ANKS4BQ8N8V4 417 aa6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-203ENST00000503080 FAM84AQ96KN4 292 aa6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-203ENST00000503080 SLC38A3Q99624 504 aa6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-203ENST00000503080 G6PC3Q9BUM1 346 aa6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-203ENST00000503080 RNF32Q9H0A6 362 aa6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-203ENST00000503080 TMEM82A0PJX8 343 aa6.95□□□□□ -1.3
UBE2B-203ENST00000503080 GJA8P48165 433 aa6.95□□□□□ -1.3
UBE2B-203ENST00000503080 EIF6P56537 245 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
UBE2B-203ENST00000503080 CHRNEQ04844 493 aa6.95□□□□□ -1.3
UBE2B-203ENST00000503080 BBS9Q3SYG4 887 aa6.95□□□□□ -1.3
UBE2B-203ENST00000503080 ZPBP2Q6X784 338 aa6.95□□□□□ -1.3
UBE2B-203ENST00000503080 PPFIBP1Q86W92 1011 aa6.95□□□□□ -1.3
UBE2B-203ENST00000503080 C7orf61Q8IZ16 206 aa6.95□□□□□ -1.3
UBE2B-203ENST00000503080 LILRA2Q8N149 483 aa6.95□□□□□ -1.3
UBE2B-203ENST00000503080 TGIF2Q9GZN2 237 aa6.95□□□□□ -1.3
UBE2B-203ENST00000503080 ACBD3Q9H3P7 528 aa6.95□□□□□ -1.3
UBE2B-203ENST00000503080 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
UBE2B-203ENST00000503080 FAM86C1Q9NVL1 165 aa6.95□□□□□ -1.3
UBE2B-203ENST00000503080 SHOXO15266 292 aa6.94□□□□□ -1.3
UBE2B-203ENST00000503080 PSPNO60542 156 aa6.94□□□□□ -1.3
UBE2B-203ENST00000503080 TP53P04637 393 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
UBE2B-203ENST00000503080 CTSKP43235 329 aa6.94□□□□□ -1.3
UBE2B-203ENST00000503080 NASPP49321 788 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
UBE2B-203ENST00000503080 DCAF15Q66K64 600 aa6.94□□□□□ -1.3
UBE2B-203ENST00000503080 GPR160Q9UJ42 338 aa6.94□□□□□ -1.3
UBE2B-203ENST00000503080 USP2O75604 605 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
UBE2B-203ENST00000503080 GIPRP48546 466 aa6.93□□□□□ -1.3
UBE2B-203ENST00000503080 PKN1Q16512 942 aa6.93□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.4 ms