RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498054.1

POLR1B-215, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1B, Length 636 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-215ENST00000498054 PPM1BO75688 479 aa6.3□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 SLC10A6Q3KNW5 377 aa6.3□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 CYP27C1Q4G0S4 372 aa6.3□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 DUSP27Q5VZP5 1158 aa6.3□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 OGFOD3Q6PK18 319 aa6.3□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 ZAR1Q86SH2 424 aa6.3□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 LRRN4CLQ8ND94 238 aa6.3□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 ADCY4Q8NFM4 1077 aa6.3□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 BRF1Q92994 677 aa6.3□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 EPN3Q9H201 632 aa6.3□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 KCNH3Q9ULD8 1083 aa6.3□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa6.3□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa6.29□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 GNAT3A8MTJ3 354 aa6.29□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 ITGA4P13612 1032 aa6.29□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 CD247P20963 164 aa6.29□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 CANXP27824 592 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 CYP27A1Q02318 531 aa6.29□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF765Q7L2R6 523 aa6.29□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 SHISA5Q8N114 240 aa6.29□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 NLGN1Q8N2Q7 840 aa6.29□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 FBXL18Q96ME1 805 aa6.29□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 SPATA9Q9BWV2 254 aa6.29□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 KANSL2Q9H9L4 492 aa6.29□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 ATG3Q9NT62 314 aa6.29□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 FANCLQ9NW38 375 aa6.29□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 WDR64B1ANS9 1081 aa6.28□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 MEIS1O00470 390 aa6.28□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 NOP56O00567 594 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 CBFA2T2O43439 604 aa6.28□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 PPP2R5DQ14738 602 aa6.28□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa6.28□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 NBPF9Q3BBW0 867 aa6.28□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 RNF43Q68DV7 783 aa6.28□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 DSCC1Q9BVC3 393 aa6.28□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 LGR4Q9BXB1 951 aa6.28□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa6.28□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 PRDM14Q9GZV8 571 aa6.28□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 KLHL25Q9H0H3 589 aa6.28□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa6.28□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 GP6Q9HCN6 339 aa6.28□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 APEX2Q9UBZ4 518 aa6.28□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 SUSD2Q9UGT4 822 aa6.28□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 LEMD3Q9Y2U8 911 aa6.28□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 ESYT3A0FGR9 886 aa6.27□□□□□ -1.41
POLR1B-215ENST00000498054 CDC45O75419 566 aa6.27□□□□□ -1.41
POLR1B-215ENST00000498054 FAM153BP0C7A2 387 aa6.27□□□□□ -1.41
POLR1B-215ENST00000498054 ITIH2P19823 946 aa6.27□□□□□ -1.41
POLR1B-215ENST00000498054 SSTR4P31391 388 aa6.27□□□□□ -1.41
POLR1B-215ENST00000498054 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
POLR1B-215ENST00000498054 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.27□□□□□ -1.41
POLR1B-215ENST00000498054 C2orf27AQ580R0 203 aa6.27□□□□□ -1.41
POLR1B-215ENST00000498054 SLC51AQ86UW1 340 aa6.27□□□□□ -1.41
POLR1B-215ENST00000498054 HOMER1Q86YM7 354 aa6.27□□□□□ -1.41
POLR1B-215ENST00000498054 APPBP2Q92624 585 aa6.27□□□□□ -1.41
POLR1B-215ENST00000498054 GATA6Q92908 595 aa6.27□□□□□ -1.41
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
POLR1B-215ENST00000498054 VWCEQ96DN2 955 aa6.27□□□□□ -1.41
POLR1B-215ENST00000498054 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
POLR1B-215ENST00000498054 CDC6Q99741 560 aa6.27□□□□□ -1.41
POLR1B-215ENST00000498054 PCMTD2Q9NV79 361 aa6.27□□□□□ -1.41
POLR1B-215ENST00000498054 GFOD1Q9NXC2 390 aa6.27□□□□□ -1.41
POLR1B-215ENST00000498054 WHRNQ9P202 907 aa6.27□□□□□ -1.41
POLR1B-215ENST00000498054 AKT3Q9Y243 479 aa6.27□□□□□ -1.41
POLR1B-215ENST00000498054 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
POLR1B-215ENST00000498054 PRR33A8MZF0 331 aa6.26□□□□□ -1.41
POLR1B-215ENST00000498054 F13BP05160 661 aa6.26□□□□□ -1.41
POLR1B-215ENST00000498054 ITGAVP06756 1048 aa6.26□□□□□ -1.41
POLR1B-215ENST00000498054 HSD3B2P26439 372 aa6.26□□□□□ -1.41
POLR1B-215ENST00000498054 KIR3DL1P43629 444 aa6.26□□□□□ -1.41
POLR1B-215ENST00000498054 NFIAQ12857 509 aa6.26□□□□□ -1.41
POLR1B-215ENST00000498054 TMC3Q7Z5M5 1100 aa6.26□□□□□ -1.41
POLR1B-215ENST00000498054 FAM181AQ8N9Y4 354 aa6.26□□□□□ -1.41
POLR1B-215ENST00000498054 DTWD2Q8NBA8 298 aa6.26□□□□□ -1.41
POLR1B-215ENST00000498054 BVESQ8NE79 360 aa6.26□□□□□ -1.41
POLR1B-215ENST00000498054 COX4I2Q96KJ9 171 aa6.26□□□□□ -1.41
POLR1B-215ENST00000498054 ZDHHC15Q96MV8 337 aa6.26□□□□□ -1.41
POLR1B-215ENST00000498054 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
POLR1B-215ENST00000498054 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP6.26□□□□□ -1.41
POLR1B-215ENST00000498054 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa6.26□□□□□ -1.41
POLR1B-215ENST00000498054 A0A1W2PQU0 124 aa6.25□□□□□ -1.41
POLR1B-215ENST00000498054 ANKRD62A6NC57 917 aa6.25□□□□□ -1.41
POLR1B-215ENST00000498054 KCNH1O95259 989 aa6.25□□□□□ -1.41
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF445P59923 1031 aa6.25□□□□□ -1.41
POLR1B-215ENST00000498054 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
POLR1B-215ENST00000498054 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
POLR1B-215ENST00000498054 CDKAL1Q5VV42 579 aa6.25□□□□□ -1.41
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF662Q6ZS27 426 aa6.25□□□□□ -1.41
POLR1B-215ENST00000498054 MFSD4AQ8N468 514 aa6.25□□□□□ -1.41
POLR1B-215ENST00000498054 FIBCD1Q8N539 461 aa6.25□□□□□ -1.41
POLR1B-215ENST00000498054 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
POLR1B-215ENST00000498054 SHKBP1Q8TBC3 707 aa6.25□□□□□ -1.41
POLR1B-215ENST00000498054 SGSM3Q96HU1 749 aa6.25□□□□□ -1.41
POLR1B-215ENST00000498054 Q96M66 194 aa6.25□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms