RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496569.1

HDLBP-246, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 4

Gene HDLBP, Length 374 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-246ENST00000496569 CCDC171Q6TFL3 1326 aa14.53□□□□□ -0.08
HDLBP-246ENST00000496569 SDSP20132 328 aa14.53□□□□□ -0.08
HDLBP-246ENST00000496569 GJA8P48165 433 aa14.53□□□□□ -0.08
HDLBP-246ENST00000496569 TFAP4Q01664 338 aa14.53□□□□□ -0.08
HDLBP-246ENST00000496569 TMEM132BQ14DG7 1078 aa14.53□□□□□ -0.08
HDLBP-246ENST00000496569 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa14.53□□□□□ -0.08
HDLBP-246ENST00000496569 IL25Q9H293 177 aa14.53□□□□□ -0.08
HDLBP-246ENST00000496569 OSBPL3Q9H4L5 887 aa14.53□□□□□ -0.08
HDLBP-246ENST00000496569 GOPCQ9HD26 462 aa14.53□□□□□ -0.08
HDLBP-246ENST00000496569 NYAP2Q9P242 653 aa14.53□□□□□ -0.08
HDLBP-246ENST00000496569 F5H6K3 240 aa14.52□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 FGAP02671 866 aa14.52□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 TSPY3P0CV98 308 aa14.52□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 TSPY8P0CW00 308 aa14.52□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 ERCC3P19447 782 aa14.52□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 PTPREP23469 700 aa14.52□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 RGS2P41220 211 aa14.52□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 CCNA1P78396 465 aa14.52□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 PDE4BQ07343 736 aa14.52□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 KLRC3Q07444 240 aa14.52□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 MAP2K5Q13163 448 aa14.52□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 SKAP1Q86WV1 359 aa14.52□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 NCAPG2Q86XI2 1143 aa14.52□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 NEDD1Q8NHV4 660 aa14.52□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 APBA2Q99767 749 aa14.52□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 MTMR4Q9NYA4 1195 aa14.52□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 MTMR7Q9Y216 660 aa14.52□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 SGPL1O95470 568 aa14.51□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 GRB14Q14449 540 aa14.51□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 REPS2Q8NFH8 660 aa14.51□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 NBPF3Q9H094 633 aa14.51□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 TOMM22Q9NS69 142 aa14.51□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 HOXC10Q9NYD6 342 aa14.51□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa14.51□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa14.51□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 SLC15A5A6NIM6 579 aa14.5□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 TSPY2A6NKD2 308 aa14.5□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 TFRCP02786 760 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 ADORA2AP29274 412 aa14.5□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 SLC4A3P48751 1232 aa14.5□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa14.5□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa14.5□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 TBC1D10CQ8IV04 446 aa14.5□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 IL17RBQ9NRM6 502 aa14.5□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa14.5□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 PCDH10Q9P2E7 1040 aa14.5□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 LCTP09848 1927 aa14.49□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 RPTORQ8N122 1335 aa14.49□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 VWA5AO00534 786 aa14.49□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 COBLO75128 1261 aa14.49□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 TTLL1O95922 423 aa14.49□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 CYP2C19P33261 490 aa14.49□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 ALX1Q15699 326 aa14.49□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 TTC22Q5TAA0 569 aa14.49□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 KIFC2Q96AC6 838 aa14.49□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 SLF1Q9BQI6 1058 aa14.49□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 ZNF287Q9HBT7 754 aa14.49□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 ANAPC4Q9UJX5 808 aa14.49□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 NEDD4P46934 1319 aa14.48□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 SLC34A2O95436 690 aa14.48□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 SLFN13Q68D06 897 aa14.48□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 MB21D1Q8N884 522 aa14.48□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 TRPV1Q8NER1 839 aa14.48□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa14.48□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa14.48□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 STX8Q9UNK0 236 aa14.48□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 RIPK3Q9Y572 518 aa14.48□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 MYH6P13533 1939 aa14.48□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa14.48□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 PGK2P07205 417 aa14.47□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 MCCP23508 829 aa14.47□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 SNAP25P60880 206 aa14.47□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 ANO1Q5XXA6 986 aa14.47□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 KCTD1Q719H9 257 aa14.47□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 CPXCR1Q8N123 301 aa14.47□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 SHCBP1Q8NEM2 672 aa14.47□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 MKL1Q969V6 931 aa14.47□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 ZMYM6O95789 1325 aa14.46□□□□□ -0.09
HDLBP-246ENST00000496569 ORC4O43929 436 aa14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms